RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640136.1

NPTXR-202, Transcript of neuronal pentraxin receptor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPTXR, Length 1,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXR-202ENST00000640136 NUP160Q12769 1436 aa43.01■■■■■ 4.48
NPTXR-202ENST00000640136 CEP170Q5SW79 1584 aa42.96■■■■■ 4.47
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NPTXR-202ENST00000640136 IQGAP2Q13576 1575 aa42.83■■■■■ 4.45
NPTXR-202ENST00000640136 CEP162Q5TB80 1403 aa42.8■■■■■ 4.44
NPTXR-202ENST00000640136 CLIP1P30622 1438 aa42.7■■■■■ 4.43
NPTXR-202ENST00000640136 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.68■■■■■ 4.42
NPTXR-202ENST00000640136 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.66■■■■■ 4.42
NPTXR-202ENST00000640136 OSCARQ8IYS5 282 aa42.61■■■■■ 4.41
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NPTXR-202ENST00000640136 SHROOM2Q13796 1616 aa42.54■■■■■ 4.4
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NPTXR-202ENST00000640136 KIAA0556O60303 1618 aa42.4■■■■■ 4.38
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NPTXR-202ENST00000640136 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.38■■■■■ 4.37
NPTXR-202ENST00000640136 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
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NPTXR-202ENST00000640136 FMN1Q68DA7 1419 aa42.18■■■■■ 4.34
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NPTXR-202ENST00000640136 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.85■■■■■ 4.29
NPTXR-202ENST00000640136 HECW1Q76N89 1606 aa41.83■■■■■ 4.29
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NPTXR-202ENST00000640136 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.79■■■■■ 4.28
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NPTXR-202ENST00000640136 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.69■■■■■ 4.26
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NPTXR-202ENST00000640136 APLP2Q06481 763 aa41.69■■■■■ 4.26
NPTXR-202ENST00000640136 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
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NPTXR-202ENST00000640136 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.64■■■■■ 4.26
NPTXR-202ENST00000640136 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.56■■■■■ 4.24
NPTXR-202ENST00000640136 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
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NPTXR-202ENST00000640136 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.5■■■■■ 4.23
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NPTXR-202ENST00000640136 ARID3CA6NKF2 412 aa41.44■■■■■ 4.23
NPTXR-202ENST00000640136 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.44■■■■■ 4.22
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NPTXR-202ENST00000640136 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.35■■■■■ 4.21
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NPTXR-202ENST00000640136 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
NPTXR-202ENST00000640136 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
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NPTXR-202ENST00000640136 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.82■■■■■ 4.13
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NPTXR-202ENST00000640136 DIP2BQ9P265 1576 aa40.7■■■■■ 4.11
NPTXR-202ENST00000640136 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.68■■■■■ 4.1
NPTXR-202ENST00000640136 PLCH2O75038 1416 aa40.68■■■■■ 4.1
NPTXR-202ENST00000640136 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
NPTXR-202ENST00000640136 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.66■■■■■ 4.1
NPTXR-202ENST00000640136 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
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