RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637942.1

CACNB4-267, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5

Gene CACNB4, Length 4,020 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-267	ENST00000637942	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	CUL7	Q14999	1698 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	IGF1R	P08069	1367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CACNB4-267	ENST00000637942	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	MYT1	Q01538	1121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CACNB4-267	ENST00000637942	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	WDR62	O43379	1518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	MAPKBP1	O60336	1514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-267	ENST00000637942	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	CEP170	Q5SW79	1584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	KDM6B	O15054	1643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	PLEKHG5	O94827	1062 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-267	ENST00000637942	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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