RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629113.1

LEMD1-210, Transcript of LEM domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LEMD1, Length 314 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1-210ENST00000629113 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.96■■■■■ 5.43
LEMD1-210ENST00000629113 CUL7Q14999 1698 aa48.81■■■■■ 5.4
LEMD1-210ENST00000629113 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.73■■■■■ 5.39
LEMD1-210ENST00000629113 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.68■■■■■ 5.38
LEMD1-210ENST00000629113 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.5■■■■■ 5.35
LEMD1-210ENST00000629113 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.47■■■■■ 5.35
LEMD1-210ENST00000629113 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.41■■■■■ 5.34
LEMD1-210ENST00000629113 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.35■■■■■ 5.33
LEMD1-210ENST00000629113 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.3■■■■■ 5.32
LEMD1-210ENST00000629113 PTPRGP23470 1445 aa48.29■■■■■ 5.32
LEMD1-210ENST00000629113 IQGAP2Q13576 1575 aa48.28■■■■■ 5.32
LEMD1-210ENST00000629113 MAPKBP1O60336 1514 aa48.27■■■■■ 5.32
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.27■■■■■ 5.32
LEMD1-210ENST00000629113 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.21■■■■■ 5.31
LEMD1-210ENST00000629113 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.21■■■■■ 5.31
LEMD1-210ENST00000629113 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.19■■■■■ 5.31
LEMD1-210ENST00000629113 DIP2BQ9P265 1576 aa48.16■■■■■ 5.3
LEMD1-210ENST00000629113 DISP1Q96F81 1524 aa48.1■■■■■ 5.29
LEMD1-210ENST00000629113 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.01■■■■■ 5.28
LEMD1-210ENST00000629113 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.98■■■■■ 5.27
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC2Q92887 1545 aa47.97■■■■■ 5.27
LEMD1-210ENST00000629113 TSPOAP1O95153 1857 aa47.93■■■■■ 5.26
LEMD1-210ENST00000629113 UACAQ9BZF9 1416 aa47.91■■■■■ 5.26
LEMD1-210ENST00000629113 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.88■■■■■ 5.26
LEMD1-210ENST00000629113 KIAA0556O60303 1618 aa47.86■■■■■ 5.25
LEMD1-210ENST00000629113 ASXL2Q76L83 1435 aa47.84■■■■■ 5.25
LEMD1-210ENST00000629113 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.81■■■■■ 5.24
LEMD1-210ENST00000629113 PRXQ9BXM0 1461 aa47.77■■■■■ 5.24
LEMD1-210ENST00000629113 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.73■■■■■ 5.23
LEMD1-210ENST00000629113 KDM6BO15054 1643 aa47.7■■■■■ 5.23
LEMD1-210ENST00000629113 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.69■■■■■ 5.22
LEMD1-210ENST00000629113 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.22
LEMD1-210ENST00000629113 GLI2P10070 1586 aa47.62■■■■■ 5.21
LEMD1-210ENST00000629113 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
LEMD1-210ENST00000629113 GOLGA3Q08378 1498 aa47.55■■■■■ 5.2
LEMD1-210ENST00000629113 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
LEMD1-210ENST00000629113 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.48■■■■■ 5.19
LEMD1-210ENST00000629113 ABCA8O94911 1581 aa47.43■■■■■ 5.18
LEMD1-210ENST00000629113 P3H3Q8IVL6 736 aa47.4■■■■■ 5.18
LEMD1-210ENST00000629113 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.4■■■■■ 5.18
LEMD1-210ENST00000629113 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.35■■■■■ 5.17
LEMD1-210ENST00000629113 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
LEMD1-210ENST00000629113 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.27■■■■■ 5.16
LEMD1-210ENST00000629113 KCNH8Q96L42 1107 aa47.25■■■■■ 5.15
LEMD1-210ENST00000629113 ARID3CA6NKF2 412 aa47.23■■■■■ 5.15
LEMD1-210ENST00000629113 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
LEMD1-210ENST00000629113 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.18■■■■■ 5.14
LEMD1-210ENST00000629113 EEA1Q15075 1411 aa47.16■■■■■ 5.14
LEMD1-210ENST00000629113 SAMD9Q5K651 1589 aa47.13■■■■■ 5.14
LEMD1-210ENST00000629113 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
LEMD1-210ENST00000629113 CD109Q6YHK3 1445 aa47.08■■■■■ 5.13
LEMD1-210ENST00000629113 ATP10BO94823 1461 aa47.08■■■■■ 5.13
LEMD1-210ENST00000629113 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.03■■■■■ 5.12
LEMD1-210ENST00000629113 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.99■■■■■ 5.11
LEMD1-210ENST00000629113 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.94■■■■■ 5.11
LEMD1-210ENST00000629113 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.91■■■■■ 5.1
LEMD1-210ENST00000629113 ADGRL1O94910 1474 aa46.86■■■■■ 5.09
LEMD1-210ENST00000629113 KIF21BO75037 1637 aa46.85■■■■■ 5.09
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LEMD1-210ENST00000629113 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.8■■■■■ 5.08
LEMD1-210ENST00000629113 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
LEMD1-210ENST00000629113 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.72■■■■■ 5.07
LEMD1-210ENST00000629113 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.63■■■■■ 5.05
LEMD1-210ENST00000629113 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.62■■■■■ 5.05
LEMD1-210ENST00000629113 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
LEMD1-210ENST00000629113 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.52■■■■■ 5.04
LEMD1-210ENST00000629113 RAPGEF3O95398 923 aa46.49■■■■■ 5.03
LEMD1-210ENST00000629113 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.47■■■■■ 5.03
LEMD1-210ENST00000629113 NEO1Q92859 1461 aa46.44■■■■■ 5.02
LEMD1-210ENST00000629113 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.36■■■■■ 5.01
LEMD1-210ENST00000629113 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.34■■■■■ 5.01
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LEMD1-210ENST00000629113 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
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LEMD1-210ENST00000629113 FANCAO15360 1455 aa46.2■■■■■ 4.99
LEMD1-210ENST00000629113 HECW1Q76N89 1606 aa46.17■■■■■ 4.98
LEMD1-210ENST00000629113 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
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LEMD1-210ENST00000629113 RICTORQ6R327 1708 aa46.13■■■■■ 4.98
LEMD1-210ENST00000629113 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.1■■■■■ 4.97
LEMD1-210ENST00000629113 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.07■■■■■ 4.97
LEMD1-210ENST00000629113 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
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LEMD1-210ENST00000629113 PLCH2O75038 1416 aa46.03■■■■■ 4.96
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46■■■■■ 4.95
LEMD1-210ENST00000629113 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.98■■■■■ 4.95
LEMD1-210ENST00000629113 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
LEMD1-210ENST00000629113 KIF14Q15058 1648 aa45.98■■■■■ 4.95
LEMD1-210ENST00000629113 PTPRMP28827 1452 aa45.94■■■■■ 4.95
LEMD1-210ENST00000629113 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.93■■■■■ 4.94
LEMD1-210ENST00000629113 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
LEMD1-210ENST00000629113 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.91■■■■■ 4.94
LEMD1-210ENST00000629113 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.9■■■■■ 4.94
LEMD1-210ENST00000629113 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.9■■■■■ 4.94
LEMD1-210ENST00000629113 MADDQ8WXG6 1647 aa45.88■■■■■ 4.94
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