RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.38	■■■■■ 4.69
TCF4-259	ENST00000627568	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.35	■■■■■ 4.69
TCF4-259	ENST00000627568	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.21	■■■■■ 4.67
TCF4-259	ENST00000627568	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.18	■■■■■ 4.66
TCF4-259	ENST00000627568	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.88	■■■■■ 4.61
TCF4-259	ENST00000627568	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.85	■■■■■ 4.61
TCF4-259	ENST00000627568	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.84	■■■■■ 4.61
TCF4-259	ENST00000627568	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.83	■■■■■ 4.61
TCF4-259	ENST00000627568	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.82	■■■■■ 4.6
TCF4-259	ENST00000627568	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.78	■■■■■ 4.6
TCF4-259	ENST00000627568	PTPRG	P23470	1445 aa		43.74	■■■■■ 4.59
TCF4-259	ENST00000627568	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.73	■■■■■ 4.59
TCF4-259	ENST00000627568	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.7	■■■■■ 4.59
TCF4-259	ENST00000627568	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.66	■■■■■ 4.58
TCF4-259	ENST00000627568	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.64	■■■■■ 4.58
TCF4-259	ENST00000627568	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.58	■■■■■ 4.57
TCF4-259	ENST00000627568	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.58	■■■■■ 4.57
TCF4-259	ENST00000627568	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.57	■■■■■ 4.57
TCF4-259	ENST00000627568	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.55	■■■■■ 4.56
TCF4-259	ENST00000627568	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.53	■■■■■ 4.56
TCF4-259	ENST00000627568	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TCF4-259	ENST00000627568	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.46	■■■■■ 4.55
TCF4-259	ENST00000627568	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.44	■■■■■ 4.54
TCF4-259	ENST00000627568	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.42	■■■■■ 4.54
TCF4-259	ENST00000627568	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.42	■■■■■ 4.54
TCF4-259	ENST00000627568	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.31	■■■■■ 4.52
TCF4-259	ENST00000627568	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.29	■■■■■ 4.52
TCF4-259	ENST00000627568	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.28	■■■■■ 4.52
TCF4-259	ENST00000627568	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.27	■■■■■ 4.52
TCF4-259	ENST00000627568	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TCF4-259	ENST00000627568	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.18	■■■■■ 4.5
TCF4-259	ENST00000627568	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
TCF4-259	ENST00000627568	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
TCF4-259	ENST00000627568	EEA1	Q15075	1411 aa		43.14	■■■■■ 4.5
TCF4-259	ENST00000627568	GLI2	P10070	1586 aa		43.13	■■■■■ 4.5
TCF4-259	ENST00000627568	KDM6B	O15054	1643 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TCF4-259	ENST00000627568	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
TCF4-259	ENST00000627568	ABCA8	O94911	1581 aa		43.01	■■■■■ 4.48
TCF4-259	ENST00000627568	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
TCF4-259	ENST00000627568	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
TCF4-259	ENST00000627568	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.94	■■■■■ 4.47
TCF4-259	ENST00000627568	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.91	■■■■■ 4.46
TCF4-259	ENST00000627568	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.87	■■■■■ 4.45
TCF4-259	ENST00000627568	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TCF4-259	ENST00000627568	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.82	■■■■■ 4.45
TCF4-259	ENST00000627568	KIF21B	O75037	1637 aa		42.75	■■■■■ 4.43
TCF4-259	ENST00000627568	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.69	■■■■■ 4.42
TCF4-259	ENST00000627568	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.68	■■■■■ 4.42
TCF4-259	ENST00000627568	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
TCF4-259	ENST00000627568	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.66	■■■■■ 4.42
TCF4-259	ENST00000627568	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TCF4-259	ENST00000627568	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.64	■■■■■ 4.42
TCF4-259	ENST00000627568	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.63	■■■■■ 4.41
TCF4-259	ENST00000627568	ATP10B	O94823	1461 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TCF4-259	ENST00000627568	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.58	■■■■■ 4.41
TCF4-259	ENST00000627568	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
TCF4-259	ENST00000627568	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.58	■■■■■ 4.41
TCF4-259	ENST00000627568	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.55	■■■■■ 4.4
TCF4-259	ENST00000627568	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
TCF4-259	ENST00000627568	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
TCF4-259	ENST00000627568	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
TCF4-259	ENST00000627568	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.42	■■■■■ 4.38
TCF4-259	ENST00000627568	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
TCF4-259	ENST00000627568	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.4	■■■■■ 4.38
TCF4-259	ENST00000627568	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.4	■■■■■ 4.38
TCF4-259	ENST00000627568	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.25	■■■■■ 4.35
TCF4-259	ENST00000627568	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.23	■■■■■ 4.35
TCF4-259	ENST00000627568	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.22	■■■■■ 4.35
TCF4-259	ENST00000627568	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.21	■■■■■ 4.35
TCF4-259	ENST00000627568	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.16	■■■■■ 4.34
TCF4-259	ENST00000627568	NEO1	Q92859	1461 aa		42.15	■■■■■ 4.34
TCF4-259	ENST00000627568	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.15	■■■■■ 4.34
TCF4-259	ENST00000627568	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
TCF4-259	ENST00000627568	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.09	■■■■■ 4.33
TCF4-259	ENST00000627568	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
TCF4-259	ENST00000627568	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.01	■■■■■ 4.32
TCF4-259	ENST00000627568	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.98	■■■■■ 4.31
TCF4-259	ENST00000627568	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.97	■■■■■ 4.31
TCF4-259	ENST00000627568	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.95	■■■■■ 4.31
TCF4-259	ENST00000627568	FANCA	O15360	1455 aa		41.92	■■■■■ 4.3
TCF4-259	ENST00000627568	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.9	■■■■■ 4.3
TCF4-259	ENST00000627568	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
TCF4-259	ENST00000627568	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.87	■■■■■ 4.29
TCF4-259	ENST00000627568	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.85	■■■■■ 4.29
TCF4-259	ENST00000627568	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.8	■■■■■ 4.28
TCF4-259	ENST00000627568	KIF14	Q15058	1648 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TCF4-259	ENST00000627568	PLCH2	O75038	1416 aa		41.75	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.75	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	CLIP1	P30622	1438 aa		41.74	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.74	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.73	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.72	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.69	■■■■■ 4.27
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.68	■■■■■ 4.26
TCF4-259	ENST00000627568	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.65	■■■■■ 4.26
TCF4-259	ENST00000627568	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.64	■■■■■ 4.26
TCF4-259	ENST00000627568	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.61	■■■■■ 4.25
TCF4-259	ENST00000627568	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.61	■■■■■ 4.25
TCF4-259	ENST00000627568	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.61	■■■■■ 4.25

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