RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626574.2

PCBP1-AS1-296, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 887 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.16□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CEP170Q5SW79 1584 aa14.16□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 JPH4Q96JJ6 628 aa14.13□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.12□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 IQGAP2Q13576 1575 aa14.12□□□□□ -0.15
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.07□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CLIP1P30622 1438 aa14.06□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 P3H3Q8IVL6 736 aa14.05□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CEP162Q5TB80 1403 aa14.05□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.05□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.03□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SHROOM2Q13796 1616 aa14□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.99□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DISP1Q96F81 1524 aa13.97□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.97□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIAA0556O60303 1618 aa13.96□□□□□ -0.17
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PTPRGP23470 1445 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SAMD9Q5K651 1589 aa13.95□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.92□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARHGEF11O15085 1522 aa13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FMN1Q68DA7 1419 aa13.9□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARAP1Q96P48 1450 aa13.9□□□□□ -0.18
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 APLP2Q06481 763 aa13.85□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 UACAQ9BZF9 1416 aa13.83□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PLB1Q6P1J6 1458 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARID3CA6NKF2 412 aa13.8□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCA8O94911 1581 aa13.77□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 HECW1Q76N89 1606 aa13.77□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCC2Q92887 1545 aa13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.73□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ATP10BO94823 1461 aa13.7□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAP3K1Q13233 1512 aa13.66□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KCNH8Q96L42 1107 aa13.65□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TIAM1Q13009 1591 aa13.65□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.63□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ASXL2Q76L83 1435 aa13.62□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.59□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.59□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAPKBP1O60336 1514 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.56□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.54□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.54□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 KIF14Q15058 1648 aa13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 NCOA2Q15596 1464 aa13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.49□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 CD109Q6YHK3 1445 aa13.47□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.46□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.46□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GLI2P10070 1586 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 DIP2BQ9P265 1576 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 PLCH2O75038 1416 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.42□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.42□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.41□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 MIA2Q96PC5 1412 aa13.41□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-296ENST00000626574 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms