RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621456.2

SLC38A3-208, Transcript of solute carrier family 38 member 3, human

TSL 5

Gene SLC38A3, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A3-208	ENST00000621456	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		30.1	■■■□□ 2.41
SLC38A3-208	ENST00000621456	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		30.06	■■■□□ 2.4
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
SLC38A3-208	ENST00000621456	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SLC38A3-208	ENST00000621456	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SLC38A3-208	ENST00000621456	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SLC38A3-208	ENST00000621456	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.71	■■■□□ 2.35
SLC38A3-208	ENST00000621456	PTPRG	P23470	1445 aa		29.7	■■■□□ 2.34
SLC38A3-208	ENST00000621456	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SLC38A3-208	ENST00000621456	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SLC38A3-208	ENST00000621456	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SLC38A3-208	ENST00000621456	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.66	■■■□□ 2.34
SLC38A3-208	ENST00000621456	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SLC38A3-208	ENST00000621456	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.62	■■■□□ 2.33
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SLC38A3-208	ENST00000621456	EEA1	Q15075	1411 aa		29.58	■■■□□ 2.33
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.57	■■■□□ 2.32
SLC38A3-208	ENST00000621456	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.56	■■■□□ 2.32
SLC38A3-208	ENST00000621456	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.55	■■■□□ 2.32
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.52	■■■□□ 2.32
SLC38A3-208	ENST00000621456	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.51	■■■□□ 2.31
SLC38A3-208	ENST00000621456	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.5	■■■□□ 2.31
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.5	■■■□□ 2.31
SLC38A3-208	ENST00000621456	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.49	■■■□□ 2.31
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.45	■■■□□ 2.31
SLC38A3-208	ENST00000621456	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.44	■■■□□ 2.3
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.36	■■■□□ 2.29
SLC38A3-208	ENST00000621456	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.35	■■■□□ 2.29
SLC38A3-208	ENST00000621456	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SLC38A3-208	ENST00000621456	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIF21B	O75037	1637 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCA8	O94911	1581 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SLC38A3-208	ENST00000621456	GLI2	P10070	1586 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SLC38A3-208	ENST00000621456	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SLC38A3-208	ENST00000621456	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SLC38A3-208	ENST00000621456	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SLC38A3-208	ENST00000621456	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SLC38A3-208	ENST00000621456	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SLC38A3-208	ENST00000621456	KDM6B	O15054	1643 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SLC38A3-208	ENST00000621456	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SLC38A3-208	ENST00000621456	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SLC38A3-208	ENST00000621456	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SLC38A3-208	ENST00000621456	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SLC38A3-208	ENST00000621456	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
SLC38A3-208	ENST00000621456	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SLC38A3-208	ENST00000621456	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SLC38A3-208	ENST00000621456	ATP10B	O94823	1461 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SLC38A3-208	ENST00000621456	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SLC38A3-208	ENST00000621456	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SLC38A3-208	ENST00000621456	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SLC38A3-208	ENST00000621456	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SLC38A3-208	ENST00000621456	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SLC38A3-208	ENST00000621456	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SLC38A3-208	ENST00000621456	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SLC38A3-208	ENST00000621456	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SLC38A3-208	ENST00000621456	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SLC38A3-208	ENST00000621456	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC38A3-208	ENST00000621456	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC38A3-208	ENST00000621456	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
SLC38A3-208	ENST00000621456	NEO1	Q92859	1461 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SLC38A3-208	ENST00000621456	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SLC38A3-208	ENST00000621456	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SLC38A3-208	ENST00000621456	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.56	■■■□□ 2.16
SLC38A3-208	ENST00000621456	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SLC38A3-208	ENST00000621456	CLIP1	P30622	1438 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC38A3-208	ENST00000621456	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC38A3-208	ENST00000621456	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SLC38A3-208	ENST00000621456	FANCA	O15360	1455 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SLC38A3-208	ENST00000621456	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SLC38A3-208	ENST00000621456	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
SLC38A3-208	ENST00000621456	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SLC38A3-208	ENST00000621456	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIF14	Q15058	1648 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLCH2	O75038	1416 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SLC38A3-208	ENST00000621456	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SLC38A3-208	ENST00000621456	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SLC38A3-208	ENST00000621456	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SLC38A3-208	ENST00000621456	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.28	■■■□□ 2.12
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.26	■■■□□ 2.11

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