RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PNMA8C-201ENST00000617053 TOPBP1Q92547 1522 aa13.3□□□□□ -0.28
PNMA8C-201ENST00000617053 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PNMA8C-201ENST00000617053 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.28□□□□□ -0.28
PNMA8C-201ENST00000617053 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.28□□□□□ -0.28
PNMA8C-201ENST00000617053 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.25□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
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PNMA8C-201ENST00000617053 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.24□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.23□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.22□□□□□ -0.29
PNMA8C-201ENST00000617053 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.21□□□□□ -0.29
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PNMA8C-201ENST00000617053 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.19□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.18□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.17□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 BCANQ96GW7 911 aa13.16□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.16□□□□□ -0.3
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PNMA8C-201ENST00000617053 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.13□□□□□ -0.31
PNMA8C-201ENST00000617053 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PNMA8C-201ENST00000617053 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PNMA8C-201ENST00000617053 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.12□□□□□ -0.31
PNMA8C-201ENST00000617053 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.12□□□□□ -0.31
PNMA8C-201ENST00000617053 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.1□□□□□ -0.31
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PNMA8C-201ENST00000617053 ARAP1Q96P48 1450 aa13.08□□□□□ -0.31
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PNMA8C-201ENST00000617053 JPH4Q96JJ6 628 aa13.07□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 GRIN2BQ13224 1484 aa13.07□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 FMN1Q68DA7 1419 aa13.06□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.06□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 IFT140Q96RY7 1462 aa13.06□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.05□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 MLECQ14165 292 aa13.05□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.04□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 NEFLP07196 543 aa13.04□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
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PNMA8C-201ENST00000617053 TSPY10P0CW01 314 aa13.02□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.02□□□□□ -0.32
PNMA8C-201ENST00000617053 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.01□□□□□ -0.33
PNMA8C-201ENST00000617053 STAG3Q9UJ98 1225 aa13□□□□□ -0.33
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PNMA8C-201ENST00000617053 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.99□□□□□ -0.33
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PNMA8C-201ENST00000617053 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.92□□□□□ -0.34
PNMA8C-201ENST00000617053 MIER1Q8N108 512 aa12.92□□□□□ -0.34
PNMA8C-201ENST00000617053 ANP32CO43423 234 aa12.91□□□□□ -0.34
PNMA8C-201ENST00000617053 CUL7Q14999 1698 aa12.9□□□□□ -0.34
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PNMA8C-201ENST00000617053 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.87□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.87□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 PTPRGP23470 1445 aa12.87□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 RGL3Q3MIN7 710 aa12.87□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.86□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 FOXD1Q16676 465 aa12.85□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 GGT6Q6P531 493 aa12.85□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.85□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 GRIN2AQ12879 1464 aa12.84□□□□□ -0.35
PNMA8C-201ENST00000617053 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.83□□□□□ -0.36
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PNMA8C-201ENST00000617053 SYNJ2O15056 1496 aa12.82□□□□□ -0.36
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PNMA8C-201ENST00000617053 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.81□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 BCL11AQ9H165 835 aa12.81□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.8□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.8□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 TIAM1Q13009 1591 aa12.78□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.77□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.77□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 NCOA2Q15596 1464 aa12.75□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.75□□□□□ -0.37
PNMA8C-201ENST00000617053 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
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PNMA8C-201ENST00000617053 ADAMTS12P58397 1594 aa12.74□□□□□ -0.37
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