RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 WDR97A6NE52 1622 aa30.29■■■□□ 2.44
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HDGFL2-208ENST00000616600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.18■■■□□ 2.42
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HDGFL2-208ENST00000616600 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.14■■■□□ 2.42
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HDGFL2-208ENST00000616600 ITGAEP38570 1179 aa29.92■■■□□ 2.38
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HDGFL2-208ENST00000616600 PBRM1Q86U86 1689 aa29.8■■■□□ 2.36
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HDGFL2-208ENST00000616600 ADAMTS12P58397 1594 aa29.72■■■□□ 2.35
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HDGFL2-208ENST00000616600 IFT140Q96RY7 1462 aa29.68■■■□□ 2.34
HDGFL2-208ENST00000616600 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.68■■■□□ 2.34
HDGFL2-208ENST00000616600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
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HDGFL2-208ENST00000616600 MAPKBP1O60336 1514 aa29.63■■■□□ 2.33
HDGFL2-208ENST00000616600 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.63■■■□□ 2.33
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
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HDGFL2-208ENST00000616600 DAPK1P53355 1430 aa28.96■■■□□ 2.23
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