RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615198.4

CPEB1-211, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-211ENST00000615198 PBRM1Q86U86 1689 aa23.26■■□□□ 1.31
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CPEB1-211ENST00000615198 APLP2Q06481 763 aa23.17■■□□□ 1.3
CPEB1-211ENST00000615198 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CPEB1-211ENST00000615198 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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CPEB1-211ENST00000615198 ADAMTS12P58397 1594 aa23.11■■□□□ 1.29
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CPEB1-211ENST00000615198 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23■■□□□ 1.27
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CPEB1-211ENST00000615198 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.95■■□□□ 1.26
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CPEB1-211ENST00000615198 GRIN2AQ12879 1464 aa22.92■■□□□ 1.26
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CPEB1-211ENST00000615198 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-211ENST00000615198 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-211ENST00000615198 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CPEB1-211ENST00000615198 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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CPEB1-211ENST00000615198 CHD1O14646 1710 aa22.81■■□□□ 1.24
CPEB1-211ENST00000615198 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.81■■□□□ 1.24
CPEB1-211ENST00000615198 MAP3K1Q13233 1512 aa22.8■■□□□ 1.24
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CPEB1-211ENST00000615198 NUP160Q12769 1436 aa22.77■■□□□ 1.24
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CPEB1-211ENST00000615198 MIER1Q8N108 512 aa22.73■■□□□ 1.23
CPEB1-211ENST00000615198 SAMD9Q5K651 1589 aa22.71■■□□□ 1.23
CPEB1-211ENST00000615198 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.71■■□□□ 1.23
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CPEB1-211ENST00000615198 DISP1Q96F81 1524 aa22.62■■□□□ 1.21
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CPEB1-211ENST00000615198 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.58■■□□□ 1.21
CPEB1-211ENST00000615198 KIAA0556O60303 1618 aa22.57■■□□□ 1.2
CPEB1-211ENST00000615198 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.55■■□□□ 1.2
CPEB1-211ENST00000615198 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CPEB1-211ENST00000615198 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CPEB1-211ENST00000615198 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.52■■□□□ 1.2
CPEB1-211ENST00000615198 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.5■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 SHROOM2Q13796 1616 aa22.48■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 FMN1Q68DA7 1419 aa22.48■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 MAPKBP1O60336 1514 aa22.47■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.46■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.45■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.45■■□□□ 1.19
CPEB1-211ENST00000615198 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.45■■□□□ 1.18
CPEB1-211ENST00000615198 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
CPEB1-211ENST00000615198 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CPEB1-211ENST00000615198 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.43■■□□□ 1.18
CPEB1-211ENST00000615198 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.42■■□□□ 1.18
CPEB1-211ENST00000615198 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 29.7
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CPEB1-211ENST00000615198 OSCARQ8IYS5 282 aa22.37■■□□□ 1.17
CPEB1-211ENST00000615198 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.35■■□□□ 1.17
CPEB1-211ENST00000615198 ARID3CA6NKF2 412 aa22.32■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.31■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.31■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 HECW1Q76N89 1606 aa22.29■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 PTPRGP23470 1445 aa22.28■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-211ENST00000615198 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
CPEB1-211ENST00000615198 ABCA8O94911 1581 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-211ENST00000615198 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-211ENST00000615198 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.2■■□□□ 1.15
CPEB1-211ENST00000615198 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.2■■□□□ 1.14
CPEB1-211ENST00000615198 UACAQ9BZF9 1416 aa22.15■■□□□ 1.14
CPEB1-211ENST00000615198 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.14■■□□□ 1.13
CPEB1-211ENST00000615198 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.13■■□□□ 1.13
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CPEB1-211ENST00000615198 HFM1A2PYH4 1435 aa22.12■■□□□ 1.13
CPEB1-211ENST00000615198 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.09■■□□□ 1.13
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CPEB1-211ENST00000615198 ARHGEF11O15085 1522 aa22.06■■□□□ 1.12
CPEB1-211ENST00000615198 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.06■■□□□ 1.12
CPEB1-211ENST00000615198 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CPEB1-211ENST00000615198 PTPRKQ15262 1439 aa22.04■■□□□ 1.12
CPEB1-211ENST00000615198 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.04■■□□□ 1.12
CPEB1-211ENST00000615198 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.02■■□□□ 1.12
CPEB1-211ENST00000615198 NAIPQ13075 1403 aa22■■□□□ 1.11
CPEB1-211ENST00000615198 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CPEB1-211ENST00000615198 KIF14Q15058 1648 aa21.98■■□□□ 1.11
CPEB1-211ENST00000615198 MYT1Q01538 1121 aa21.98■■□□□ 1.11
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