RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614839.4

PRAMEF25-201, Transcript of PRAME family member 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF25, Length 1,863 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25-201ENST00000614839 GOLGA3Q08378 1498 aa21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25-201ENST00000614839 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 ARHGEF11O15085 1522 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 SHROOM2Q13796 1616 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25-201ENST00000614839 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25-201ENST00000614839 JPH4Q96JJ6 628 aa21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25-201ENST00000614839 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF25-201ENST00000614839 IQGAP2Q13576 1575 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF25-201ENST00000614839 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PRAMEF25-201ENST00000614839 ARAP1Q96P48 1450 aa21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF25-201ENST00000614839 HRCP23327 699 aa21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF25-201ENST00000614839 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF25-201ENST00000614839 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF25-201ENST00000614839 CEP162Q5TB80 1403 aa21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF25-201ENST00000614839 DISP1Q96F81 1524 aa21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF25-201ENST00000614839 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF25-201ENST00000614839 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF25-201ENST00000614839 KIAA0556O60303 1618 aa21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF25-201ENST00000614839 CLIP1P30622 1438 aa21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF25-201ENST00000614839 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF25-201ENST00000614839 P3H3Q8IVL6 736 aa21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF25-201ENST00000614839 SAMD9Q5K651 1589 aa21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF25-201ENST00000614839 PTPRGP23470 1445 aa21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF25-201ENST00000614839 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF25-201ENST00000614839 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF25-201ENST00000614839 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF25-201ENST00000614839 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF25-201ENST00000614839 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.93■□□□□ 0.94
PRAMEF25-201ENST00000614839 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF25-201ENST00000614839 UACAQ9BZF9 1416 aa20.92■□□□□ 0.94
PRAMEF25-201ENST00000614839 ABCA8O94911 1581 aa20.9■□□□□ 0.94
PRAMEF25-201ENST00000614839 ABCC2Q92887 1545 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAMEF25-201ENST00000614839 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.87■□□□□ 0.93
PRAMEF25-201ENST00000614839 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.83■□□□□ 0.93
PRAMEF25-201ENST00000614839 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PRAMEF25-201ENST00000614839 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.8■□□□□ 0.92
PRAMEF25-201ENST00000614839 FMN1Q68DA7 1419 aa20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF25-201ENST00000614839 ARID3CA6NKF2 412 aa20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF25-201ENST00000614839 APLP2Q06481 763 aa20.79■□□□□ 0.92
PRAMEF25-201ENST00000614839 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PRAMEF25-201ENST00000614839 MAPKBP1O60336 1514 aa20.74■□□□□ 0.91
PRAMEF25-201ENST00000614839 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.74■□□□□ 0.91
PRAMEF25-201ENST00000614839 ATP10BO94823 1461 aa20.74■□□□□ 0.91
PRAMEF25-201ENST00000614839 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PRAMEF25-201ENST00000614839 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.71■□□□□ 0.91
PRAMEF25-201ENST00000614839 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.7■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 ASXL2Q76L83 1435 aa20.7■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.69■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 HECW1Q76N89 1606 aa20.67■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.67■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 MAP3K1Q13233 1512 aa20.64■□□□□ 0.9
PRAMEF25-201ENST00000614839 DIP2BQ9P265 1576 aa20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF25-201ENST00000614839 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF25-201ENST00000614839 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF25-201ENST00000614839 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF25-201ENST00000614839 KCNH8Q96L42 1107 aa20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF25-201ENST00000614839 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 TSPOAP1O95153 1857 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 GLI2P10070 1586 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 TIAM1Q13009 1591 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAMEF25-201ENST00000614839 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 KIF14Q15058 1648 aa20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF25-201ENST00000614839 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 CD109Q6YHK3 1445 aa20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF25-201ENST00000614839 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF25-201ENST00000614839 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF25-201ENST00000614839 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF25-201ENST00000614839 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF25-201ENST00000614839 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF25-201ENST00000614839 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF25-201ENST00000614839 PLCH2O75038 1416 aa20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF25-201ENST00000614839 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms