RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCL23-201ENST00000612516 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
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CCL23-201ENST00000612516 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCL23-201ENST00000612516 TSPOAP1O95153 1857 aa9.96□□□□□ -0.81
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CCL23-201ENST00000612516 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.83□□□□□ -0.84
CCL23-201ENST00000612516 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCL23-201ENST00000612516 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCL23-201ENST00000612516 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.82□□□□□ -0.84
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CCL23-201ENST00000612516 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCL23-201ENST00000612516 HECW1Q76N89 1606 aa9.78□□□□□ -0.84
CCL23-201ENST00000612516 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.78□□□□□ -0.84
CCL23-201ENST00000612516 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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CCL23-201ENST00000612516 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL23-201ENST00000612516 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL23-201ENST00000612516 RAPGEF3O95398 923 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL23-201ENST00000612516 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
CCL23-201ENST00000612516 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.72□□□□□ -0.85
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CCL23-201ENST00000612516 FANCAO15360 1455 aa9.72□□□□□ -0.85
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CCL23-201ENST00000612516 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.7□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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CCL23-201ENST00000612516 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.69□□□□□ -0.86
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CCL23-201ENST00000612516 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 KIF14Q15058 1648 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.68□□□□□ -0.86
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CCL23-201ENST00000612516 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 ARHGAP5Q13017 1502 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL23-201ENST00000612516 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.65□□□□□ -0.86
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