RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612323.4

TMEM230-210, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM230, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-210ENST00000612323 KIF27Q86VH2 1401 aa36.81■■■■□ 3.48
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TMEM230-210ENST00000612323 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.6■■■■□ 3.45
TMEM230-210ENST00000612323 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.5■■■■□ 3.43
TMEM230-210ENST00000612323 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.45■■■■□ 3.42
TMEM230-210ENST00000612323 IQGAP2Q13576 1575 aa36.31■■■■□ 3.4
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TMEM230-210ENST00000612323 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.26■■■■□ 3.4
TMEM230-210ENST00000612323 PTPRGP23470 1445 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 DISP1Q96F81 1524 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.39
TMEM230-210ENST00000612323 DIP2BQ9P265 1576 aa36.19■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
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TMEM230-210ENST00000612323 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM230-210ENST00000612323 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.12■■■■□ 3.37
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TMEM230-210ENST00000612323 PRXQ9BXM0 1461 aa36■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 TSPOAP1O95153 1857 aa36■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 UACAQ9BZF9 1416 aa35.98■■■■□ 3.35
TMEM230-210ENST00000612323 ASXL2Q76L83 1435 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM230-210ENST00000612323 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.87■■■■□ 3.33
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TMEM230-210ENST00000612323 KDM6BO15054 1643 aa35.75■■■■□ 3.31
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TMEM230-210ENST00000612323 GOLGA3Q08378 1498 aa35.71■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 ABCA8O94911 1581 aa35.71■■■■□ 3.31
TMEM230-210ENST00000612323 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.65■■■■□ 3.3
TMEM230-210ENST00000612323 P3H3Q8IVL6 736 aa35.58■■■■□ 3.29
TMEM230-210ENST00000612323 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
TMEM230-210ENST00000612323 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.55■■■■□ 3.28
TMEM230-210ENST00000612323 SAMD9Q5K651 1589 aa35.53■■■■□ 3.28
TMEM230-210ENST00000612323 EEA1Q15075 1411 aa35.5■■■■□ 3.27
TMEM230-210ENST00000612323 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
TMEM230-210ENST00000612323 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.44■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 ATP10BO94823 1461 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 KCNH8Q96L42 1107 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 ARID3CA6NKF2 412 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM230-210ENST00000612323 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.37■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.36■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 KIF21BO75037 1637 aa35.33■■■■□ 3.25
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TMEM230-210ENST00000612323 CD109Q6YHK3 1445 aa35.32■■■■□ 3.25
TMEM230-210ENST00000612323 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.32■■■■□ 3.25
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TMEM230-210ENST00000612323 NEO1Q92859 1461 aa34.88■■■■□ 3.17
TMEM230-210ENST00000612323 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
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TMEM230-210ENST00000612323 RICTORQ6R327 1708 aa34.73■■■■□ 3.15
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TMEM230-210ENST00000612323 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.58■■■■□ 3.13
TMEM230-210ENST00000612323 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.56■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.52■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
TMEM230-210ENST00000612323 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.49■■■■□ 3.11
TMEM230-210ENST00000612323 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.48■■■■□ 3.11
TMEM230-210ENST00000612323 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.48■■■■□ 3.11
TMEM230-210ENST00000612323 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
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