RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 SHROOM2Q13796 1616 aa32.76■■■□□ 2.83
ANKRD54-211ENST00000609454 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.74■■■□□ 2.83
ANKRD54-211ENST00000609454 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.68■■■□□ 2.82
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.65■■■□□ 2.82
ANKRD54-211ENST00000609454 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.53■■■□□ 2.8
ANKRD54-211ENST00000609454 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.47■■■□□ 2.79
ANKRD54-211ENST00000609454 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
ANKRD54-211ENST00000609454 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.43■■■□□ 2.78
ANKRD54-211ENST00000609454 IQGAP2Q13576 1575 aa32.38■■■□□ 2.77
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPRGP23470 1445 aa32.35■■■□□ 2.77
ANKRD54-211ENST00000609454 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.32■■■□□ 2.76
ANKRD54-211ENST00000609454 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.22■■■□□ 2.75
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.21■■■□□ 2.75
ANKRD54-211ENST00000609454 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.16■■■□□ 2.74
ANKRD54-211ENST00000609454 DISP1Q96F81 1524 aa32.15■■■□□ 2.74
ANKRD54-211ENST00000609454 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.15■■■□□ 2.74
ANKRD54-211ENST00000609454 PRXQ9BXM0 1461 aa32.14■■■□□ 2.74
ANKRD54-211ENST00000609454 MAPKBP1O60336 1514 aa32.13■■■□□ 2.73
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.1■■■□□ 2.73
ANKRD54-211ENST00000609454 UACAQ9BZF9 1416 aa32.08■■■□□ 2.73
ANKRD54-211ENST00000609454 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.07■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCC2Q92887 1545 aa32.05■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA0556O60303 1618 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLGA3Q08378 1498 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 EEA1Q15075 1411 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-211ENST00000609454 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32■■■□□ 2.71
ANKRD54-211ENST00000609454 DIP2BQ9P265 1576 aa31.97■■■□□ 2.71
ANKRD54-211ENST00000609454 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.93■■■□□ 2.7
ANKRD54-211ENST00000609454 ASXL2Q76L83 1435 aa31.92■■■□□ 2.7
ANKRD54-211ENST00000609454 P3H3Q8IVL6 736 aa31.9■■■□□ 2.7
ANKRD54-211ENST00000609454 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
ANKRD54-211ENST00000609454 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.86■■■□□ 2.69
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.85■■■□□ 2.69
ANKRD54-211ENST00000609454 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
ANKRD54-211ENST00000609454 TSPOAP1O95153 1857 aa31.78■■■□□ 2.68
ANKRD54-211ENST00000609454 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
ANKRD54-211ENST00000609454 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.74■■■□□ 2.67
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCA8O94911 1581 aa31.7■■■□□ 2.67
ANKRD54-211ENST00000609454 GLI2P10070 1586 aa31.7■■■□□ 2.67
ANKRD54-211ENST00000609454 ARID3CA6NKF2 412 aa31.7■■■□□ 2.67
ANKRD54-211ENST00000609454 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNH8Q96L42 1107 aa31.69■■■□□ 2.66
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM6BO15054 1643 aa31.68■■■□□ 2.66
ANKRD54-211ENST00000609454 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.66■■■□□ 2.66
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF21BO75037 1637 aa31.64■■■□□ 2.66
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
ANKRD54-211ENST00000609454 SAMD9Q5K651 1589 aa31.61■■■□□ 2.65
ANKRD54-211ENST00000609454 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.57■■■□□ 2.64
ANKRD54-211ENST00000609454 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.55■■■□□ 2.64
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.52■■■□□ 2.64
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP10BO94823 1461 aa31.51■■■□□ 2.63
ANKRD54-211ENST00000609454 CD109Q6YHK3 1445 aa31.49■■■□□ 2.63
ANKRD54-211ENST00000609454 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.49■■■□□ 2.63
ANKRD54-211ENST00000609454 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
ANKRD54-211ENST00000609454 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.46■■■□□ 2.63
ANKRD54-211ENST00000609454 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.39■■■□□ 2.62
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.37■■■□□ 2.61
ANKRD54-211ENST00000609454 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-211ENST00000609454 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
ANKRD54-211ENST00000609454 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
ANKRD54-211ENST00000609454 FMN1Q68DA7 1419 aa31.26■■■□□ 2.6
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.22■■■□□ 2.59
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.2■■■□□ 2.59
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.19■■■□□ 2.58
ANKRD54-211ENST00000609454 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.17■■■□□ 2.58
ANKRD54-211ENST00000609454 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
ANKRD54-211ENST00000609454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
ANKRD54-211ENST00000609454 HECW1Q76N89 1606 aa31.11■■■□□ 2.57
ANKRD54-211ENST00000609454 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.09■■■□□ 2.57
ANKRD54-211ENST00000609454 NEO1Q92859 1461 aa31.08■■■□□ 2.57
ANKRD54-211ENST00000609454 RAPGEF3O95398 923 aa31.05■■■□□ 2.56
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRL1O94910 1474 aa31.04■■■□□ 2.56
ANKRD54-211ENST00000609454 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
ANKRD54-211ENST00000609454 FANCAO15360 1455 aa30.97■■■□□ 2.55
ANKRD54-211ENST00000609454 CLIP1P30622 1438 aa30.97■■■□□ 2.55
ANKRD54-211ENST00000609454 AKNAQ7Z591 1439 aa30.96■■■□□ 2.55
ANKRD54-211ENST00000609454 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.93■■■□□ 2.54
ANKRD54-211ENST00000609454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.93■■■□□ 2.54
ANKRD54-211ENST00000609454 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
ANKRD54-211ENST00000609454 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.9■■■□□ 2.54
ANKRD54-211ENST00000609454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
ANKRD54-211ENST00000609454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD54-211ENST00000609454 PLCH2O75038 1416 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD54-211ENST00000609454 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.87■■■□□ 2.53
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF14Q15058 1648 aa30.85■■■□□ 2.53
ANKRD54-211ENST00000609454 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ANKRD54-211ENST00000609454 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.8■■■□□ 2.52
ANKRD54-211ENST00000609454 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.79■■■□□ 2.52
ANKRD54-211ENST00000609454 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.78■■■□□ 2.52
ANKRD54-211ENST00000609454 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.76■■■□□ 2.52
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.75■■■□□ 2.51
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.74■■■□□ 2.51
ANKRD54-211ENST00000609454 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.74■■■□□ 2.51
ANKRD54-211ENST00000609454 RICTORQ6R327 1708 aa30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms