RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TIAM1Q13009 1591 aa32.29■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.26■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CUL7Q14999 1698 aa32.26■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR97A6NE52 1622 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.21■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.21■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP3K1Q13233 1512 aa32.2■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.16■■■□□ 2.74
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.13■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.12■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.1■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.04■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.04■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.04■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.03■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEUROD1Q13562 356 aa32.03■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FMN1Q68DA7 1419 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.9■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAMD9Q5K651 1589 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.85■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.82■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PBRM1Q86U86 1689 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MIER1Q8N108 512 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRIN2BQ13224 1484 aa31.74■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADAMTS12P58397 1594 aa31.71■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAPKBP1O60336 1514 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.7■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFT140Q96RY7 1462 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQGAP2Q13576 1575 aa31.64■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR62O43379 1518 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCOA2Q15596 1464 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARID3CA6NKF2 412 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.6■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERCC6Q03468 1493 aa31.58■■■□□ 2.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.55■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPRKQ15262 1439 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HECW1Q76N89 1606 aa31.45■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.43■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYT1Q01538 1121 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.4■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRIN2AQ12879 1464 aa31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HFM1A2PYH4 1435 aa31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBLN2P98095 1184 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF11O15085 1522 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.37■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.36■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DISP1Q96F81 1524 aa31.35■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NAIPQ13075 1403 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA0556O60303 1618 aa31.3■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UACAQ9BZF9 1416 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNJ2O15056 1496 aa31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP170Q5SW79 1584 aa31.18■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TONSLQ96HA7 1378 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MIA2Q96PC5 1412 aa31.15■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM52Q96A61 297 aa31.14■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.13■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 JPH4Q96JJ6 628 aa31.1■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM6BO15054 1643 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUP160Q12769 1436 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DAPK1P53355 1430 aa30.99■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AKNAQ7Z591 1439 aa30.99■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms