RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601549.1

KCNN4-208, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily N member 4, human

TSL 3

Gene KCNN4, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNN4-208	ENST00000601549	NUP160	Q12769	1436 aa		29.22	■■■□□ 2.27
KCNN4-208	ENST00000601549	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
KCNN4-208	ENST00000601549	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.18	■■■□□ 2.26
KCNN4-208	ENST00000601549	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.14	■■■□□ 2.26
KCNN4-208	ENST00000601549	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.12	■■■□□ 2.25
KCNN4-208	ENST00000601549	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.09	■■■□□ 2.25
KCNN4-208	ENST00000601549	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.09	■■■□□ 2.25
KCNN4-208	ENST00000601549	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.08	■■■□□ 2.25
KCNN4-208	ENST00000601549	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.04	■■■□□ 2.24
KCNN4-208	ENST00000601549	CLIP1	P30622	1438 aa		29	■■■□□ 2.23
KCNN4-208	ENST00000601549	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.99	■■■□□ 2.23
KCNN4-208	ENST00000601549	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.99	■■■□□ 2.23
KCNN4-208	ENST00000601549	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.91	■■■□□ 2.22
KCNN4-208	ENST00000601549	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.91	■■■□□ 2.22
KCNN4-208	ENST00000601549	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.88	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.87	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.87	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.85	■■■□□ 2.21
KCNN4-208	ENST00000601549	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.78	■■■□□ 2.2
KCNN4-208	ENST00000601549	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
KCNN4-208	ENST00000601549	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.76	■■■□□ 2.19
KCNN4-208	ENST00000601549	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
KCNN4-208	ENST00000601549	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.73	■■■□□ 2.19
KCNN4-208	ENST00000601549	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.72	■■■□□ 2.19
KCNN4-208	ENST00000601549	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.69	■■■□□ 2.18
KCNN4-208	ENST00000601549	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.66	■■■□□ 2.18
KCNN4-208	ENST00000601549	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.63	■■■□□ 2.17
KCNN4-208	ENST00000601549	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.63	■■■□□ 2.17
KCNN4-208	ENST00000601549	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.61	■■■□□ 2.17
KCNN4-208	ENST00000601549	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
KCNN4-208	ENST00000601549	PTPRG	P23470	1445 aa		28.57	■■■□□ 2.16
KCNN4-208	ENST00000601549	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.55	■■■□□ 2.16
KCNN4-208	ENST00000601549	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.53	■■■□□ 2.16
KCNN4-208	ENST00000601549	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.44	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	APLP2	Q06481	763 aa		28.42	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.42	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	ABCA8	O94911	1581 aa		28.41	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.41	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.4	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.4	■■■□□ 2.14
KCNN4-208	ENST00000601549	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.39	■■■□□ 2.13
KCNN4-208	ENST00000601549	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.35	■■■□□ 2.13
KCNN4-208	ENST00000601549	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
KCNN4-208	ENST00000601549	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
KCNN4-208	ENST00000601549	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.33	■■■□□ 2.13
KCNN4-208	ENST00000601549	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
KCNN4-208	ENST00000601549	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
KCNN4-208	ENST00000601549	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
KCNN4-208	ENST00000601549	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.25	■■■□□ 2.11
KCNN4-208	ENST00000601549	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
KCNN4-208	ENST00000601549	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
KCNN4-208	ENST00000601549	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.23	■■■□□ 2.11
KCNN4-208	ENST00000601549	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.22	■■■□□ 2.11
KCNN4-208	ENST00000601549	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.21	■■■□□ 2.11
KCNN4-208	ENST00000601549	ATP10B	O94823	1461 aa		28.18	■■■□□ 2.1
KCNN4-208	ENST00000601549	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.15	■■■□□ 2.1
KCNN4-208	ENST00000601549	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.11	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.1	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.1	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.09	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
KCNN4-208	ENST00000601549	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCNN4-208	ENST00000601549	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
KCNN4-208	ENST00000601549	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
KCNN4-208	ENST00000601549	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
KCNN4-208	ENST00000601549	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.98	■■■□□ 2.07
KCNN4-208	ENST00000601549	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.96	■■■□□ 2.07
KCNN4-208	ENST00000601549	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
KCNN4-208	ENST00000601549	ASXL2	Q76L83	1435 aa		27.93	■■■□□ 2.06
KCNN4-208	ENST00000601549	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		27.93	■■■□□ 2.06
KCNN4-208	ENST00000601549	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.89	■■■□□ 2.06
KCNN4-208	ENST00000601549	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.89	■■■□□ 2.06
KCNN4-208	ENST00000601549	KIF14	Q15058	1648 aa		27.89	■■■□□ 2.06
KCNN4-208	ENST00000601549	DIP2B	Q9P265	1576 aa		27.83	■■■□□ 2.05
KCNN4-208	ENST00000601549	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
KCNN4-208	ENST00000601549	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		27.82	■■■□□ 2.04
KCNN4-208	ENST00000601549	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.8	■■■□□ 2.04
KCNN4-208	ENST00000601549	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.8	■■■□□ 2.04
KCNN4-208	ENST00000601549	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.79	■■■□□ 2.04
KCNN4-208	ENST00000601549	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.78	■■■□□ 2.04
KCNN4-208	ENST00000601549	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.77	■■■□□ 2.04
KCNN4-208	ENST00000601549	GLI2	P10070	1586 aa		27.76	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.73	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.72	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.72	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.72	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.71	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.7	■■■□□ 2.03
KCNN4-208	ENST00000601549	PLCH2	O75038	1416 aa		27.67	■■■□□ 2.02
KCNN4-208	ENST00000601549	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02

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