RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-208ENST00000600277 KIF21BO75037 1637 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 CEP170Q5SW79 1584 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 GOLGA3Q08378 1498 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC27A1-208ENST00000600277 ARAP1Q96P48 1450 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC27A1-208ENST00000600277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.09■■■■□ 3.37
SLC27A1-208ENST00000600277 JPH4Q96JJ6 628 aa36.01■■■■□ 3.36
SLC27A1-208ENST00000600277 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36■■■■□ 3.35
SLC27A1-208ENST00000600277 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
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SLC27A1-208ENST00000600277 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC27A1-208ENST00000600277 SHROOM2Q13796 1616 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC27A1-208ENST00000600277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.9■■■■□ 3.34
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SLC27A1-208ENST00000600277 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.87■■■■□ 3.33
SLC27A1-208ENST00000600277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.77■■■■□ 3.32
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SLC27A1-208ENST00000600277 SAMD9Q5K651 1589 aa35.55■■■■□ 3.28
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SLC27A1-208ENST00000600277 PTPRGP23470 1445 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 CEP162Q5TB80 1403 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.52■■■■□ 3.28
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SLC27A1-208ENST00000600277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.4■■■■□ 3.26
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SLC27A1-208ENST00000600277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
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SLC27A1-208ENST00000600277 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.2■■■■□ 3.23
SLC27A1-208ENST00000600277 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC27A1-208ENST00000600277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.18■■■■□ 3.22
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SLC27A1-208ENST00000600277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.07■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
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SLC27A1-208ENST00000600277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
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SLC27A1-208ENST00000600277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.73■■■■□ 3.15
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SLC27A1-208ENST00000600277 DIP2BQ9P265 1576 aa34.72■■■■□ 3.15
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SLC27A1-208ENST00000600277 TIAM1Q13009 1591 aa34.62■■■■□ 3.13
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SLC27A1-208ENST00000600277 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.52■■■■□ 3.12
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SLC27A1-208ENST00000600277 TSPOAP1O95153 1857 aa34.4■■■■□ 3.1
SLC27A1-208ENST00000600277 KIF14Q15058 1648 aa34.38■■■■□ 3.09
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SLC27A1-208ENST00000600277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.38■■■■□ 3.09
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SLC27A1-208ENST00000600277 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.27■■■■□ 3.08
SLC27A1-208ENST00000600277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
SLC27A1-208ENST00000600277 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
SLC27A1-208ENST00000600277 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SLC27A1-208ENST00000600277 PLCH2O75038 1416 aa34.19■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.16■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.14■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.13■■■■□ 3.05
SLC27A1-208ENST00000600277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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