RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-208ENST00000600277 KIF21BO75037 1637 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 CEP170Q5SW79 1584 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC27A1-208ENST00000600277 GOLGA3Q08378 1498 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC27A1-208ENST00000600277 ARAP1Q96P48 1450 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC27A1-208ENST00000600277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.09■■■■□ 3.37
SLC27A1-208ENST00000600277 JPH4Q96JJ6 628 aa36.01■■■■□ 3.36
SLC27A1-208ENST00000600277 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36■■■■□ 3.35
SLC27A1-208ENST00000600277 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
SLC27A1-208ENST00000600277 IQGAP2Q13576 1575 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC27A1-208ENST00000600277 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC27A1-208ENST00000600277 SHROOM2Q13796 1616 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC27A1-208ENST00000600277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC27A1-208ENST00000600277 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
SLC27A1-208ENST00000600277 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.87■■■■□ 3.33
SLC27A1-208ENST00000600277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC27A1-208ENST00000600277 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC27A1-208ENST00000600277 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.74■■■■□ 3.31
SLC27A1-208ENST00000600277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
SLC27A1-208ENST00000600277 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC27A1-208ENST00000600277 DISP1Q96F81 1524 aa35.65■■■■□ 3.3
SLC27A1-208ENST00000600277 KIAA0556O60303 1618 aa35.56■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 SAMD9Q5K651 1589 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 PTPRGP23470 1445 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 CEP162Q5TB80 1403 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 CLIP1P30622 1438 aa35.51■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 P3H3Q8IVL6 736 aa35.51■■■■□ 3.28
SLC27A1-208ENST00000600277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC27A1-208ENST00000600277 UACAQ9BZF9 1416 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC27A1-208ENST00000600277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
SLC27A1-208ENST00000600277 FMN1Q68DA7 1419 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC27A1-208ENST00000600277 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.2■■■■□ 3.23
SLC27A1-208ENST00000600277 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC27A1-208ENST00000600277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.18■■■■□ 3.22
SLC27A1-208ENST00000600277 ABCC2Q92887 1545 aa35.17■■■■□ 3.22
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SLC27A1-208ENST00000600277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.07■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
SLC27A1-208ENST00000600277 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35■■■■□ 3.19
SLC27A1-208ENST00000600277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
SLC27A1-208ENST00000600277 ARID3CA6NKF2 412 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC27A1-208ENST00000600277 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC27A1-208ENST00000600277 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
SLC27A1-208ENST00000600277 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
SLC27A1-208ENST00000600277 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
SLC27A1-208ENST00000600277 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
SLC27A1-208ENST00000600277 MAPKBP1O60336 1514 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC27A1-208ENST00000600277 HECW1Q76N89 1606 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC27A1-208ENST00000600277 ATP10BO94823 1461 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC27A1-208ENST00000600277 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
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SLC27A1-208ENST00000600277 ASXL2Q76L83 1435 aa34.85■■■■□ 3.17
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SLC27A1-208ENST00000600277 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.74■■■■□ 3.15
SLC27A1-208ENST00000600277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC27A1-208ENST00000600277 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
SLC27A1-208ENST00000600277 DIP2BQ9P265 1576 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC27A1-208ENST00000600277 KCNH8Q96L42 1107 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC27A1-208ENST00000600277 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC27A1-208ENST00000600277 MAP3K1Q13233 1512 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC27A1-208ENST00000600277 TIAM1Q13009 1591 aa34.62■■■■□ 3.13
SLC27A1-208ENST00000600277 APLP2Q06481 763 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC27A1-208ENST00000600277 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC27A1-208ENST00000600277 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
SLC27A1-208ENST00000600277 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC27A1-208ENST00000600277 GLI2P10070 1586 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC27A1-208ENST00000600277 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
SLC27A1-208ENST00000600277 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.52■■■■□ 3.12
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SLC27A1-208ENST00000600277 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.44■■■■□ 3.1
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SLC27A1-208ENST00000600277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC27A1-208ENST00000600277 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.34■■■■□ 3.09
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SLC27A1-208ENST00000600277 KDM6BO15054 1643 aa34.32■■■■□ 3.08
SLC27A1-208ENST00000600277 NCOA2Q15596 1464 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.27■■■■□ 3.08
SLC27A1-208ENST00000600277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
SLC27A1-208ENST00000600277 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
SLC27A1-208ENST00000600277 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SLC27A1-208ENST00000600277 PLCH2O75038 1416 aa34.19■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.16■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.14■■■■□ 3.06
SLC27A1-208ENST00000600277 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.13■■■■□ 3.05
SLC27A1-208ENST00000600277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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