RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598128.5

LINC00854-208, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-208	ENST00000598128	ANP32C	O43423	234 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LINC00854-208	ENST00000598128	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LINC00854-208	ENST00000598128	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LINC00854-208	ENST00000598128	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LINC00854-208	ENST00000598128	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LINC00854-208	ENST00000598128	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	NCAPD3	P42695	1498 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LINC00854-208	ENST00000598128	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	BCAN	Q96GW7	911 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	CUX1	P39880	1505 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LINC00854-208	ENST00000598128	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	TONSL	Q96HA7	1378 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	HMGXB3	Q12766	1538 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00854-208	ENST00000598128	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	MS4A1	P11836	297 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	ITGAE	P38570	1179 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	CUL7	Q14999	1698 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LINC00854-208	ENST00000598128	INSR	P06213	1382 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.06	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.06	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.05	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.04	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.04	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
LINC00854-208	ENST00000598128	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.02	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	CFTR	P13569	1480 aa		11	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC7	Q96M83	1385 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	NAIP	Q13075	1403 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	PDE3B	Q13370	1112 aa		10.97	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	NBR1	Q14596	966 aa		10.97	□□□□□ -0.65
LINC00854-208	ENST00000598128	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		10.97	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms