RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594521.5

ARHGEF1-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF1, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-210ENST00000594521 JPH4Q96JJ6 628 aa30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF1-210ENST00000594521 KIF27Q86VH2 1401 aa30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF1-210ENST00000594521 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF1-210ENST00000594521 IGF1RP08069 1367 aa30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF1-210ENST00000594521 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF1-210ENST00000594521 MAPKBP1O60336 1514 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF1-210ENST00000594521 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF1-210ENST00000594521 DIP2BQ9P265 1576 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF1-210ENST00000594521 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF1-210ENST00000594521 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF1-210ENST00000594521 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF1-210ENST00000594521 IQGAP2Q13576 1575 aa29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF1-210ENST00000594521 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF1-210ENST00000594521 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF1-210ENST00000594521 PTPRGP23470 1445 aa29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF1-210ENST00000594521 TSPOAP1O95153 1857 aa29.82■■■□□ 2.37
ARHGEF1-210ENST00000594521 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF1-210ENST00000594521 KDM6BO15054 1643 aa29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF1-210ENST00000594521 ABCC2Q92887 1545 aa29.76■■■□□ 2.36
ARHGEF1-210ENST00000594521 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.74■■■□□ 2.35
ARHGEF1-210ENST00000594521 DISP1Q96F81 1524 aa29.72■■■□□ 2.35
ARHGEF1-210ENST00000594521 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.7■■■□□ 2.35
ARHGEF1-210ENST00000594521 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.7■■■□□ 2.34
ARHGEF1-210ENST00000594521 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF1-210ENST00000594521 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF1-210ENST00000594521 KIAA0556O60303 1618 aa29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF1-210ENST00000594521 UACAQ9BZF9 1416 aa29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF1-210ENST00000594521 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF1-210ENST00000594521 GLI2P10070 1586 aa29.64■■■□□ 2.33
ARHGEF1-210ENST00000594521 ASXL2Q76L83 1435 aa29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF1-210ENST00000594521 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ARHGEF1-210ENST00000594521 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
ARHGEF1-210ENST00000594521 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF1-210ENST00000594521 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF1-210ENST00000594521 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF1-210ENST00000594521 GOLGA3Q08378 1498 aa29.45■■■□□ 2.31
ARHGEF1-210ENST00000594521 PRXQ9BXM0 1461 aa29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF1-210ENST00000594521 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF1-210ENST00000594521 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF1-210ENST00000594521 ABCA8O94911 1581 aa29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF1-210ENST00000594521 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF1-210ENST00000594521 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF1-210ENST00000594521 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF1-210ENST00000594521 ADGRL1O94910 1474 aa29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF1-210ENST00000594521 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF1-210ENST00000594521 SAMD9Q5K651 1589 aa29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF1-210ENST00000594521 CD109Q6YHK3 1445 aa29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF1-210ENST00000594521 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF1-210ENST00000594521 KCNH8Q96L42 1107 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF1-210ENST00000594521 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF1-210ENST00000594521 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF1-210ENST00000594521 EEA1Q15075 1411 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF1-210ENST00000594521 ATP10BO94823 1461 aa29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF1-210ENST00000594521 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF1-210ENST00000594521 P3H3Q8IVL6 736 aa29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF1-210ENST00000594521 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF1-210ENST00000594521 KIF21BO75037 1637 aa28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF1-210ENST00000594521 ARID3CA6NKF2 412 aa28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF1-210ENST00000594521 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF1-210ENST00000594521 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF1-210ENST00000594521 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF1-210ENST00000594521 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF1-210ENST00000594521 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF1-210ENST00000594521 NEO1Q92859 1461 aa28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF1-210ENST00000594521 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF1-210ENST00000594521 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF1-210ENST00000594521 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF1-210ENST00000594521 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF1-210ENST00000594521 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF1-210ENST00000594521 RICTORQ6R327 1708 aa28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 RAPGEF3O95398 923 aa28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF1-210ENST00000594521 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF1-210ENST00000594521 FANCAO15360 1455 aa28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF1-210ENST00000594521 HECW1Q76N89 1606 aa28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF1-210ENST00000594521 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF1-210ENST00000594521 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF1-210ENST00000594521 AKNAQ7Z591 1439 aa28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF1-210ENST00000594521 PTPRMP28827 1452 aa28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF1-210ENST00000594521 MADDQ8WXG6 1647 aa28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF1-210ENST00000594521 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF1-210ENST00000594521 FMN1Q68DA7 1419 aa28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF1-210ENST00000594521 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF1-210ENST00000594521 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF1-210ENST00000594521 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF1-210ENST00000594521 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF1-210ENST00000594521 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF1-210ENST00000594521 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF1-210ENST00000594521 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF1-210ENST00000594521 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF1-210ENST00000594521 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF1-210ENST00000594521 PLCH2O75038 1416 aa28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF1-210ENST00000594521 KIF14Q15058 1648 aa28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF1-210ENST00000594521 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF1-210ENST00000594521 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF1-210ENST00000594521 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.43■■■□□ 2.14
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