RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
ILF3-223	ENST00000593061	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ILF3-223	ENST00000593061	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ILF3-223	ENST00000593061	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ILF3-223	ENST00000593061	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ILF3-223	ENST00000593061	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ILF3-223	ENST00000593061	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ILF3-223	ENST00000593061	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ILF3-223	ENST00000593061	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
ILF3-223	ENST00000593061	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.71	■■■□□ 2.83
ILF3-223	ENST00000593061	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.7	■■■□□ 2.82
ILF3-223	ENST00000593061	PTPRG	P23470	1445 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ILF3-223	ENST00000593061	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ILF3-223	ENST00000593061	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ILF3-223	ENST00000593061	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ILF3-223	ENST00000593061	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ILF3-223	ENST00000593061	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ILF3-223	ENST00000593061	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ILF3-223	ENST00000593061	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ILF3-223	ENST00000593061	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ILF3-223	ENST00000593061	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ILF3-223	ENST00000593061	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ILF3-223	ENST00000593061	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ILF3-223	ENST00000593061	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ILF3-223	ENST00000593061	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ILF3-223	ENST00000593061	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ILF3-223	ENST00000593061	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ILF3-223	ENST00000593061	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ILF3-223	ENST00000593061	EEA1	Q15075	1411 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ILF3-223	ENST00000593061	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ILF3-223	ENST00000593061	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ILF3-223	ENST00000593061	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ILF3-223	ENST00000593061	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ILF3-223	ENST00000593061	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
ILF3-223	ENST00000593061	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ILF3-223	ENST00000593061	ABCA8	O94911	1581 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ILF3-223	ENST00000593061	GLI2	P10070	1586 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ILF3-223	ENST00000593061	KDM6B	O15054	1643 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ILF3-223	ENST00000593061	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ILF3-223	ENST00000593061	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
ILF3-223	ENST00000593061	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ILF3-223	ENST00000593061	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ILF3-223	ENST00000593061	KIF21B	O75037	1637 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ILF3-223	ENST00000593061	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
ILF3-223	ENST00000593061	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ILF3-223	ENST00000593061	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ILF3-223	ENST00000593061	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
ILF3-223	ENST00000593061	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ILF3-223	ENST00000593061	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ILF3-223	ENST00000593061	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ILF3-223	ENST00000593061	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ILF3-223	ENST00000593061	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ILF3-223	ENST00000593061	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ILF3-223	ENST00000593061	ATP10B	O94823	1461 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ILF3-223	ENST00000593061	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ILF3-223	ENST00000593061	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ILF3-223	ENST00000593061	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
ILF3-223	ENST00000593061	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ILF3-223	ENST00000593061	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
ILF3-223	ENST00000593061	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
ILF3-223	ENST00000593061	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
ILF3-223	ENST00000593061	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
ILF3-223	ENST00000593061	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ILF3-223	ENST00000593061	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ILF3-223	ENST00000593061	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ILF3-223	ENST00000593061	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ILF3-223	ENST00000593061	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ILF3-223	ENST00000593061	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
ILF3-223	ENST00000593061	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ILF3-223	ENST00000593061	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
ILF3-223	ENST00000593061	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ILF3-223	ENST00000593061	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ILF3-223	ENST00000593061	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ILF3-223	ENST00000593061	NEO1	Q92859	1461 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ILF3-223	ENST00000593061	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ILF3-223	ENST00000593061	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.45	■■■□□ 2.63
ILF3-223	ENST00000593061	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ILF3-223	ENST00000593061	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ILF3-223	ENST00000593061	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ILF3-223	ENST00000593061	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ILF3-223	ENST00000593061	FANCA	O15360	1455 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ILF3-223	ENST00000593061	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
ILF3-223	ENST00000593061	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ILF3-223	ENST00000593061	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
ILF3-223	ENST00000593061	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ILF3-223	ENST00000593061	KIF14	Q15058	1648 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ILF3-223	ENST00000593061	CLIP1	P30622	1438 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ILF3-223	ENST00000593061	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	PLCH2	O75038	1416 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ILF3-223	ENST00000593061	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ILF3-223	ENST00000593061	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ILF3-223	ENST00000593061	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ILF3-223	ENST00000593061	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ILF3-223	ENST00000593061	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ILF3-223	ENST00000593061	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.1	■■■□□ 2.57

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