RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592967.5

SPC24-207, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SPC24, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-207ENST00000592967 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.36■■□□□ 1.97
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SPC24-207ENST00000592967 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.32■■□□□ 1.96
SPC24-207ENST00000592967 SHROOM2Q13796 1616 aa27.3■■□□□ 1.96
SPC24-207ENST00000592967 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.29■■□□□ 1.96
SPC24-207ENST00000592967 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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SPC24-207ENST00000592967 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
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SPC24-207ENST00000592967 ASXL2Q76L83 1435 aa26.53■■□□□ 1.84
SPC24-207ENST00000592967 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.52■■□□□ 1.84
SPC24-207ENST00000592967 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.52■■□□□ 1.84
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SPC24-207ENST00000592967 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.44■■□□□ 1.82
SPC24-207ENST00000592967 DIP2BQ9P265 1576 aa26.42■■□□□ 1.82
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SPC24-207ENST00000592967 FMN1Q68DA7 1419 aa26.39■■□□□ 1.81
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SPC24-207ENST00000592967 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.2■■□□□ 1.78
SPC24-207ENST00000592967 HECW1Q76N89 1606 aa26.19■■□□□ 1.78
SPC24-207ENST00000592967 CD109Q6YHK3 1445 aa26.17■■□□□ 1.78
SPC24-207ENST00000592967 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.17■■□□□ 1.78
SPC24-207ENST00000592967 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
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SPC24-207ENST00000592967 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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SPC24-207ENST00000592967 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.08■■□□□ 1.76
SPC24-207ENST00000592967 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.07■■□□□ 1.76
SPC24-207ENST00000592967 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.07■■□□□ 1.76
SPC24-207ENST00000592967 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.06■■□□□ 1.76
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SPC24-207ENST00000592967 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SPC24-207ENST00000592967 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.73■■□□□ 1.71
SPC24-207ENST00000592967 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SPC24-207ENST00000592967 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.71■■□□□ 1.71
SPC24-207ENST00000592967 APLP2Q06481 763 aa25.71■■□□□ 1.71
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