RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
MBD3-211ENST00000592965 JPH4Q96JJ6 628 aa40.34■■■■■ 4.05
MBD3-211ENST00000592965 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.26■■■■■ 4.03
MBD3-211ENST00000592965 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.2■■■■■ 4.03
MBD3-211ENST00000592965 IQGAP2Q13576 1575 aa39.95■■■■□ 3.99
MBD3-211ENST00000592965 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.92■■■■□ 3.98
MBD3-211ENST00000592965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
MBD3-211ENST00000592965 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.88■■■■□ 3.97
MBD3-211ENST00000592965 MAPKBP1O60336 1514 aa39.83■■■■□ 3.97
MBD3-211ENST00000592965 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.82■■■■□ 3.97
MBD3-211ENST00000592965 PTPRGP23470 1445 aa39.78■■■■□ 3.96
MBD3-211ENST00000592965 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
MBD3-211ENST00000592965 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.75■■■■□ 3.95
MBD3-211ENST00000592965 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.71■■■■□ 3.95
MBD3-211ENST00000592965 DISP1Q96F81 1524 aa39.7■■■■□ 3.95
MBD3-211ENST00000592965 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.7■■■■□ 3.95
MBD3-211ENST00000592965 DIP2BQ9P265 1576 aa39.65■■■■□ 3.94
MBD3-211ENST00000592965 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.64■■■■□ 3.94
MBD3-211ENST00000592965 PRXQ9BXM0 1461 aa39.61■■■■□ 3.93
MBD3-211ENST00000592965 ABCC2Q92887 1545 aa39.58■■■■□ 3.93
MBD3-211ENST00000592965 KIAA0556O60303 1618 aa39.58■■■■□ 3.93
MBD3-211ENST00000592965 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.56■■■■□ 3.92
MBD3-211ENST00000592965 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.56■■■■□ 3.92
MBD3-211ENST00000592965 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
MBD3-211ENST00000592965 UACAQ9BZF9 1416 aa39.5■■■■□ 3.91
MBD3-211ENST00000592965 GOLGA3Q08378 1498 aa39.4■■■■□ 3.9
MBD3-211ENST00000592965 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.37■■■■□ 3.89
MBD3-211ENST00000592965 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.37■■■■□ 3.89
MBD3-211ENST00000592965 ASXL2Q76L83 1435 aa39.37■■■■□ 3.89
MBD3-211ENST00000592965 TSPOAP1O95153 1857 aa39.32■■■■□ 3.89
MBD3-211ENST00000592965 EEA1Q15075 1411 aa39.3■■■■□ 3.88
MBD3-211ENST00000592965 GLI2P10070 1586 aa39.29■■■■□ 3.88
MBD3-211ENST00000592965 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
MBD3-211ENST00000592965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.29■■■■□ 3.88
MBD3-211ENST00000592965 ABCA8O94911 1581 aa39.2■■■■□ 3.87
MBD3-211ENST00000592965 KDM6BO15054 1643 aa39.19■■■■□ 3.86
MBD3-211ENST00000592965 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
MBD3-211ENST00000592965 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
MBD3-211ENST00000592965 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.09■■■■□ 3.85
MBD3-211ENST00000592965 SAMD9Q5K651 1589 aa39.08■■■■□ 3.85
MBD3-211ENST00000592965 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.07■■■■□ 3.85
MBD3-211ENST00000592965 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
MBD3-211ENST00000592965 KIF21BO75037 1637 aa38.99■■■■□ 3.83
MBD3-211ENST00000592965 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.93■■■■□ 3.82
MBD3-211ENST00000592965 P3H3Q8IVL6 736 aa38.93■■■■□ 3.82
MBD3-211ENST00000592965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
MBD3-211ENST00000592965 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.86■■■■□ 3.81
MBD3-211ENST00000592965 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.85■■■■□ 3.81
MBD3-211ENST00000592965 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.84■■■■□ 3.81
MBD3-211ENST00000592965 ATP10BO94823 1461 aa38.82■■■■□ 3.81
MBD3-211ENST00000592965 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
MBD3-211ENST00000592965 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.77■■■■□ 3.8
MBD3-211ENST00000592965 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.76■■■■□ 3.8
MBD3-211ENST00000592965 CD109Q6YHK3 1445 aa38.75■■■■□ 3.79
MBD3-211ENST00000592965 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.74■■■■□ 3.79
MBD3-211ENST00000592965 KCNH8Q96L42 1107 aa38.74■■■■□ 3.79
MBD3-211ENST00000592965 ARID3CA6NKF2 412 aa38.71■■■■□ 3.79
MBD3-211ENST00000592965 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
MBD3-211ENST00000592965 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
MBD3-211ENST00000592965 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.62■■■■□ 3.77
MBD3-211ENST00000592965 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.57■■■■□ 3.76
MBD3-211ENST00000592965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
MBD3-211ENST00000592965 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
MBD3-211ENST00000592965 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
MBD3-211ENST00000592965 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.47■■■■□ 3.75
MBD3-211ENST00000592965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.44■■■■□ 3.74
MBD3-211ENST00000592965 ADGRL1O94910 1474 aa38.41■■■■□ 3.74
MBD3-211ENST00000592965 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.41■■■■□ 3.74
MBD3-211ENST00000592965 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.41■■■■□ 3.74
MBD3-211ENST00000592965 NEO1Q92859 1461 aa38.37■■■■□ 3.73
MBD3-211ENST00000592965 FMN1Q68DA7 1419 aa38.37■■■■□ 3.73
MBD3-211ENST00000592965 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.35■■■■□ 3.73
MBD3-211ENST00000592965 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
MBD3-211ENST00000592965 HECW1Q76N89 1606 aa38.3■■■■□ 3.72
MBD3-211ENST00000592965 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.721e-6■□□□□ 10.7
MBD3-211ENST00000592965 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.23■■■■□ 3.71
MBD3-211ENST00000592965 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
MBD3-211ENST00000592965 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.18■■■■□ 3.7
MBD3-211ENST00000592965 RAPGEF3O95398 923 aa38.13■■■■□ 3.69
MBD3-211ENST00000592965 FANCAO15360 1455 aa38.13■■■■□ 3.69
MBD3-211ENST00000592965 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
MBD3-211ENST00000592965 AKNAQ7Z591 1439 aa38.09■■■■□ 3.69
MBD3-211ENST00000592965 RICTORQ6R327 1708 aa38.08■■■■□ 3.69
MBD3-211ENST00000592965 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.08■■■■□ 3.69
MBD3-211ENST00000592965 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
MBD3-211ENST00000592965 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
MBD3-211ENST00000592965 PLCH2O75038 1416 aa38.01■■■■□ 3.68
MBD3-211ENST00000592965 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 KIF14Q15058 1648 aa38■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.99■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.98■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.96■■■■□ 3.67
MBD3-211ENST00000592965 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.94■■■■□ 3.66
MBD3-211ENST00000592965 CLIP1P30622 1438 aa37.93■■■■□ 3.66
MBD3-211ENST00000592965 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.9■■■■□ 3.66
MBD3-211ENST00000592965 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.89■■■■□ 3.66
MBD3-211ENST00000592965 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.86■■■■□ 3.65
MBD3-211ENST00000592965 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.7 ms