RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.81□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 BCL11AQ9H165 835 aa8.8□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA3Q08378 1498 aa8.8□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.78□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.78□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.77□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.77□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 SOGA1O94964 1423 aa8.76□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.76□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 CEP162Q5TB80 1403 aa8.75□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.75□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.74□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.73□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 CUL7Q14999 1698 aa8.73□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP44Q96MT7 982 aa8.73□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 KLHL34Q8N239 644 aa8.72□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 ARAP1Q96P48 1450 aa8.71□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 PLCB2Q00722 1185 aa8.71□□□□□ -1.01
SEH1L-210ENST00000592582 SAMD9Q5K651 1589 aa8.7□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.69□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 BCANQ96GW7 911 aa8.68□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.68□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 CLIP1P30622 1438 aa8.66□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.66□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.65□□□□□ -1.02
SEH1L-210ENST00000592582 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.65□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.64□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.64□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 FBXO3Q9UK99 471 aa8.63□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 KIF27Q86VH2 1401 aa8.62□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.62□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 PBRM1Q86U86 1689 aa8.61□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.6□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF11O15085 1522 aa8.6□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 TIAM1Q13009 1591 aa8.6□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.59□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SEH1L-210ENST00000592582 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 NEFLP07196 543 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SEH1L-210ENST00000592582 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 TOPBP1Q92547 1522 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 MAPKBP1O60336 1514 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 NBR1Q14596 966 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 ADAMTS12P58397 1594 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 MIER1Q8N108 512 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-210ENST00000592582 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 FBLN2P98095 1184 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 WDR62O43379 1518 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 HECW1Q76N89 1606 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 IGF1RP08069 1367 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 GRIN2BQ13224 1484 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.41□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SEH1L-210ENST00000592582 CAPN15O75808 1086 aa8.4□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.39□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.38□□□□□ -1.07
SEH1L-210ENST00000592582 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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