RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591919.5

UBXN6-207, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 1,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-207ENST00000591919 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
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UBXN6-207ENST00000591919 GRIN2AQ12879 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
UBXN6-207ENST00000591919 ARAP1Q96P48 1450 aa29.16■■■□□ 2.26
UBXN6-207ENST00000591919 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
UBXN6-207ENST00000591919 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.15■■■□□ 2.26
UBXN6-207ENST00000591919 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.12■■■□□ 2.25
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UBXN6-207ENST00000591919 SAMD9Q5K651 1589 aa29.03■■■□□ 2.24
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UBXN6-207ENST00000591919 NUP160Q12769 1436 aa28.96■■■□□ 2.23
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UBXN6-207ENST00000591919 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.91■■■□□ 2.22
UBXN6-207ENST00000591919 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.88■■■□□ 2.21
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UBXN6-207ENST00000591919 FMN1Q68DA7 1419 aa28.8■■■□□ 2.2
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UBXN6-207ENST00000591919 MAP3K1Q13233 1512 aa28.73■■■□□ 2.19
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UBXN6-207ENST00000591919 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.73■■■□□ 2.19
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UBXN6-207ENST00000591919 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.65■■■□□ 2.18
UBXN6-207ENST00000591919 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.63■■■□□ 2.17
UBXN6-207ENST00000591919 ARHGEF11O15085 1522 aa28.61■■■□□ 2.17
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UBXN6-207ENST00000591919 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.6■■■□□ 2.17
UBXN6-207ENST00000591919 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.6■■■□□ 2.17
UBXN6-207ENST00000591919 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.58■■■□□ 2.17
UBXN6-207ENST00000591919 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.58■■■□□ 2.17
UBXN6-207ENST00000591919 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
UBXN6-207ENST00000591919 HECW1Q76N89 1606 aa28.57■■■□□ 2.16
UBXN6-207ENST00000591919 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
UBXN6-207ENST00000591919 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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UBXN6-207ENST00000591919 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.49■■■□□ 2.15
UBXN6-207ENST00000591919 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.49■■■□□ 2.15
UBXN6-207ENST00000591919 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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UBXN6-207ENST00000591919 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.33■■■□□ 2.13
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UBXN6-207ENST00000591919 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.19■■■□□ 2.1
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UBXN6-207ENST00000591919 NCOA2Q15596 1464 aa28.16■■■□□ 2.1
UBXN6-207ENST00000591919 ABCC2Q92887 1545 aa28.14■■■□□ 2.1
UBXN6-207ENST00000591919 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.14■■■□□ 2.1
UBXN6-207ENST00000591919 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
UBXN6-207ENST00000591919 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.13■■■□□ 2.09
UBXN6-207ENST00000591919 ATP10BO94823 1461 aa28.13■■■□□ 2.09
UBXN6-207ENST00000591919 ARID3CA6NKF2 412 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN6-207ENST00000591919 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.09■■■□□ 2.09
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UBXN6-207ENST00000591919 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.05■■■□□ 2.08
UBXN6-207ENST00000591919 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.03■■■□□ 2.08
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UBXN6-207ENST00000591919 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.96■■■□□ 2.07
UBXN6-207ENST00000591919 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.96■■■□□ 2.07
UBXN6-207ENST00000591919 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.94■■■□□ 2.06
UBXN6-207ENST00000591919 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.93■■■□□ 2.06
UBXN6-207ENST00000591919 MIA2Q96PC5 1412 aa27.93■■■□□ 2.06
UBXN6-207ENST00000591919 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
UBXN6-207ENST00000591919 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
UBXN6-207ENST00000591919 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
UBXN6-207ENST00000591919 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.86■■■□□ 2.05
UBXN6-207ENST00000591919 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.84■■■□□ 2.05
UBXN6-207ENST00000591919 MAPKBP1O60336 1514 aa27.83■■■□□ 2.05
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UBXN6-207ENST00000591919 ITGAEP38570 1179 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 ASXL2Q76L83 1435 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 PREX2Q70Z35 1606 aa27.73■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.032e-6■■□□□ 11.5
UBXN6-207ENST00000591919 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.71■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.7■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.7■■■□□ 2.03
UBXN6-207ENST00000591919 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
UBXN6-207ENST00000591919 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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