RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.02	■■■■■ 4.64
PTPRS-209	ENST00000591760	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.01	■■■■■ 4.64
PTPRS-209	ENST00000591760	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.99	■■■■■ 4.63
PTPRS-209	ENST00000591760	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	43.86	■■■■■ 4.61
PTPRS-209	ENST00000591760	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.77	■■■■■ 4.6
PTPRS-209	ENST00000591760	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.71	■■■■■ 4.59
PTPRS-209	ENST00000591760	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.56	■■■■■ 4.56
PTPRS-209	ENST00000591760	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PTPRS-209	ENST00000591760	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.47	■■■■■ 4.55
PTPRS-209	ENST00000591760	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.46	■■■■■ 4.55
PTPRS-209	ENST00000591760	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.43	■■■■■ 4.54
PTPRS-209	ENST00000591760	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.42	■■■■■ 4.54
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPRG	P23470	1445 aa		43.42	■■■■■ 4.54
PTPRS-209	ENST00000591760	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PTPRS-209	ENST00000591760	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.36	■■■■■ 4.53
PTPRS-209	ENST00000591760	EEA1	Q15075	1411 aa		43.32	■■■■■ 4.53
PTPRS-209	ENST00000591760	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.32	■■■■■ 4.52
PTPRS-209	ENST00000591760	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.3	■■■■■ 4.52
PTPRS-209	ENST00000591760	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
PTPRS-209	ENST00000591760	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.27	■■■■■ 4.52
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PTPRS-209	ENST00000591760	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PTPRS-209	ENST00000591760	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.14	■■■■■ 4.5
PTPRS-209	ENST00000591760	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.14	■■■■■ 4.5
PTPRS-209	ENST00000591760	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PTPRS-209	ENST00000591760	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.04	■■■■■ 4.48
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF21B	O75037	1637 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PTPRS-209	ENST00000591760	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PTPRS-209	ENST00000591760	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PTPRS-209	ENST00000591760	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PTPRS-209	ENST00000591760	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.45
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCA8	O94911	1581 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PTPRS-209	ENST00000591760	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PTPRS-209	ENST00000591760	GLI2	P10070	1586 aa		42.75	■■■■■ 4.43
PTPRS-209	ENST00000591760	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.72	■■■■■ 4.43
PTPRS-209	ENST00000591760	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PTPRS-209	ENST00000591760	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
PTPRS-209	ENST00000591760	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.63	■■■■■ 4.42
PTPRS-209	ENST00000591760	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.58	■■■■■ 4.41
PTPRS-209	ENST00000591760	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
PTPRS-209	ENST00000591760	KDM6B	O15054	1643 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PTPRS-209	ENST00000591760	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PTPRS-209	ENST00000591760	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.54	■■■■■ 4.4
PTPRS-209	ENST00000591760	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
PTPRS-209	ENST00000591760	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PTPRS-209	ENST00000591760	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
PTPRS-209	ENST00000591760	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.45	■■■■■ 4.39
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP10B	O94823	1461 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PTPRS-209	ENST00000591760	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PTPRS-209	ENST00000591760	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.38	■■■■■ 4.37
PTPRS-209	ENST00000591760	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PTPRS-209	ENST00000591760	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
PTPRS-209	ENST00000591760	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PTPRS-209	ENST00000591760	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.26	■■■■■ 4.36
PTPRS-209	ENST00000591760	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PTPRS-209	ENST00000591760	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PTPRS-209	ENST00000591760	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PTPRS-209	ENST00000591760	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PTPRS-209	ENST00000591760	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.16	■■■■■ 4.34
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.15	■■■■■ 4.34
PTPRS-209	ENST00000591760	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
PTPRS-209	ENST00000591760	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PTPRS-209	ENST00000591760	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
PTPRS-209	ENST00000591760	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.02	■■■■■ 4.32
PTPRS-209	ENST00000591760	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3
PTPRS-209	ENST00000591760	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PTPRS-209	ENST00000591760	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PTPRS-209	ENST00000591760	NEO1	Q92859	1461 aa		41.85	■■■■■ 4.29
PTPRS-209	ENST00000591760	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.84	■■■■■ 4.29
PTPRS-209	ENST00000591760	CLIP1	P30622	1438 aa		41.8	■■■■■ 4.28
PTPRS-209	ENST00000591760	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.8	■■■■■ 4.28
PTPRS-209	ENST00000591760	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
PTPRS-209	ENST00000591760	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.77	■■■■■ 4.28
PTPRS-209	ENST00000591760	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PTPRS-209	ENST00000591760	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PTPRS-209	ENST00000591760	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.69	■■■■■ 4.26
PTPRS-209	ENST00000591760	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.68	■■■■■ 4.26
PTPRS-209	ENST00000591760	FANCA	O15360	1455 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PTPRS-209	ENST00000591760	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF14	Q15058	1648 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PTPRS-209	ENST00000591760	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.64	■■■■■ 4.26
PTPRS-209	ENST00000591760	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.62	■■■■■ 4.25
PTPRS-209	ENST00000591760	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.59	■■■■■ 4.25
PTPRS-209	ENST00000591760	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.59	■■■■■ 4.25
PTPRS-209	ENST00000591760	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.59	■■■■■ 4.25
PTPRS-209	ENST00000591760	PLCH2	O75038	1416 aa		41.57	■■■■■ 4.25
PTPRS-209	ENST00000591760	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PTPRS-209	ENST00000591760	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.53	■■■■■ 4.24
PTPRS-209	ENST00000591760	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.51	■■■■■ 4.24
PTPRS-209	ENST00000591760	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.5	■■■■■ 4.23
PTPRS-209	ENST00000591760	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.38	■■■■■ 4.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.38	■■■■■ 4.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.38	■■■■■ 4.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.37	■■■■■ 4.21

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