RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591722.5

PSME3-212, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene PSME3, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-212ENST00000591722 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.24■■■□□ 2.43
PSME3-212ENST00000591722 JPH4Q96JJ6 628 aa30.19■■■□□ 2.42
PSME3-212ENST00000591722 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PSME3-212ENST00000591722 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.12■■■□□ 2.41
PSME3-212ENST00000591722 IQGAP2Q13576 1575 aa30.04■■■□□ 2.4
PSME3-212ENST00000591722 PRXQ9BXM0 1461 aa30.01■■■□□ 2.4
PSME3-212ENST00000591722 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME3-212ENST00000591722 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.91■■■□□ 2.38
PSME3-212ENST00000591722 DISP1Q96F81 1524 aa29.87■■■□□ 2.37
PSME3-212ENST00000591722 EEA1Q15075 1411 aa29.87■■■□□ 2.37
PSME3-212ENST00000591722 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.85■■■□□ 2.37
PSME3-212ENST00000591722 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.84■■■□□ 2.37
PSME3-212ENST00000591722 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.79■■■□□ 2.36
PSME3-212ENST00000591722 KIAA0556O60303 1618 aa29.79■■■□□ 2.36
PSME3-212ENST00000591722 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.79■■■□□ 2.36
PSME3-212ENST00000591722 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
PSME3-212ENST00000591722 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.77■■■□□ 2.36
PSME3-212ENST00000591722 PTPRGP23470 1445 aa29.76■■■□□ 2.35
PSME3-212ENST00000591722 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.75■■■□□ 2.35
PSME3-212ENST00000591722 MAPKBP1O60336 1514 aa29.73■■■□□ 2.35
PSME3-212ENST00000591722 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.68■■■□□ 2.34
PSME3-212ENST00000591722 KIF21BO75037 1637 aa29.66■■■□□ 2.34
PSME3-212ENST00000591722 GOLGA3Q08378 1498 aa29.64■■■□□ 2.34
PSME3-212ENST00000591722 ABCC2Q92887 1545 aa29.61■■■□□ 2.33
PSME3-212ENST00000591722 UACAQ9BZF9 1416 aa29.6■■■□□ 2.33
PSME3-212ENST00000591722 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.57■■■□□ 2.32
PSME3-212ENST00000591722 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
PSME3-212ENST00000591722 DIP2BQ9P265 1576 aa29.56■■■□□ 2.32
PSME3-212ENST00000591722 SAMD9Q5K651 1589 aa29.56■■■□□ 2.32
PSME3-212ENST00000591722 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.53■■■□□ 2.32
PSME3-212ENST00000591722 ABCA8O94911 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
PSME3-212ENST00000591722 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PSME3-212ENST00000591722 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PSME3-212ENST00000591722 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PSME3-212ENST00000591722 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.44■■■□□ 2.3
PSME3-212ENST00000591722 ASXL2Q76L83 1435 aa29.39■■■□□ 2.3
PSME3-212ENST00000591722 GLI2P10070 1586 aa29.39■■■□□ 2.29
PSME3-212ENST00000591722 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.37■■■□□ 2.29
PSME3-212ENST00000591722 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.32■■■□□ 2.28
PSME3-212ENST00000591722 TSPOAP1O95153 1857 aa29.31■■■□□ 2.28
PSME3-212ENST00000591722 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PSME3-212ENST00000591722 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.27■■■□□ 2.28
PSME3-212ENST00000591722 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PSME3-212ENST00000591722 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.25■■■□□ 2.27
PSME3-212ENST00000591722 P3H3Q8IVL6 736 aa29.25■■■□□ 2.27
PSME3-212ENST00000591722 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.23■■■□□ 2.27
PSME3-212ENST00000591722 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.2■■■□□ 2.27
PSME3-212ENST00000591722 ATP10BO94823 1461 aa29.18■■■□□ 2.26
PSME3-212ENST00000591722 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.13■■■□□ 2.25
PSME3-212ENST00000591722 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PSME3-212ENST00000591722 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PSME3-212ENST00000591722 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.11■■■□□ 2.25
PSME3-212ENST00000591722 KDM6BO15054 1643 aa29.09■■■□□ 2.25
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PSME3-212ENST00000591722 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.01■■■□□ 2.23
PSME3-212ENST00000591722 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.01■■■□□ 2.23
PSME3-212ENST00000591722 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29■■■□□ 2.23
PSME3-212ENST00000591722 FMN1Q68DA7 1419 aa28.98■■■□□ 2.23
PSME3-212ENST00000591722 CD109Q6YHK3 1445 aa28.94■■■□□ 2.22
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PSME3-212ENST00000591722 HECW1Q76N89 1606 aa28.93■■■□□ 2.22
PSME3-212ENST00000591722 KCNH8Q96L42 1107 aa28.92■■■□□ 2.22
PSME3-212ENST00000591722 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PSME3-212ENST00000591722 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.91■■■□□ 2.22
PSME3-212ENST00000591722 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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PSME3-212ENST00000591722 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.79■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 CLIP1P30622 1438 aa28.77■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.77■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.77■■■□□ 2.2
PSME3-212ENST00000591722 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.74■■■□□ 2.19
PSME3-212ENST00000591722 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.74■■■□□ 2.19
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PSME3-212ENST00000591722 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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PSME3-212ENST00000591722 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.47■■■□□ 2.15
PSME3-212ENST00000591722 PREX2Q70Z35 1606 aa28.46■■■□□ 2.15
PSME3-212ENST00000591722 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.46■■■□□ 2.15
PSME3-212ENST00000591722 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PSME3-212ENST00000591722 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.45■■■□□ 2.15
PSME3-212ENST00000591722 RAPGEF3O95398 923 aa28.44■■■□□ 2.14
PSME3-212ENST00000591722 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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