RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590282.5

NFIC-210, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NFIC, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-210ENST00000590282 CLIP1P30622 1438 aa27.08■■□□□ 1.93
NFIC-210ENST00000590282 NUP160Q12769 1436 aa27.07■■□□□ 1.92
NFIC-210ENST00000590282 CEP170Q5SW79 1584 aa27.07■■□□□ 1.92
NFIC-210ENST00000590282 FBLN2P98095 1184 aa27.06■■□□□ 1.92
NFIC-210ENST00000590282 IQGAP2Q13576 1575 aa27.03■■□□□ 1.92
NFIC-210ENST00000590282 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.03■■□□□ 1.92
NFIC-210ENST00000590282 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.96■■□□□ 1.91
NFIC-210ENST00000590282 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
NFIC-210ENST00000590282 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.94■■□□□ 1.9
NFIC-210ENST00000590282 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.91■■□□□ 1.9
NFIC-210ENST00000590282 SAMD9Q5K651 1589 aa26.91■■□□□ 1.9
NFIC-210ENST00000590282 ARAP1Q96P48 1450 aa26.9■■□□□ 1.9
NFIC-210ENST00000590282 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.83■■□□□ 1.89
NFIC-210ENST00000590282 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.81■■□□□ 1.88
NFIC-210ENST00000590282 DISP1Q96F81 1524 aa26.78■■□□□ 1.88
NFIC-210ENST00000590282 SHROOM2Q13796 1616 aa26.77■■□□□ 1.88
NFIC-210ENST00000590282 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.77■■□□□ 1.88
NFIC-210ENST00000590282 KIAA0556O60303 1618 aa26.77■■□□□ 1.88
NFIC-210ENST00000590282 JPH4Q96JJ6 628 aa26.75■■□□□ 1.87
NFIC-210ENST00000590282 P3H3Q8IVL6 736 aa26.71■■□□□ 1.87
NFIC-210ENST00000590282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.68■■□□□ 1.86
NFIC-210ENST00000590282 FMN1Q68DA7 1419 aa26.66■■□□□ 1.86
NFIC-210ENST00000590282 OSCARQ8IYS5 282 aa26.65■■□□□ 1.86
NFIC-210ENST00000590282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
NFIC-210ENST00000590282 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NFIC-210ENST00000590282 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
NFIC-210ENST00000590282 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.56■■□□□ 1.84
NFIC-210ENST00000590282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.55■■□□□ 1.84
NFIC-210ENST00000590282 HECW1Q76N89 1606 aa26.45■■□□□ 1.83
NFIC-210ENST00000590282 MAP3K1Q13233 1512 aa26.45■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.44■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 PTPRGP23470 1445 aa26.44■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.42■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 APLP2Q06481 763 aa26.41■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 ABCA8O94911 1581 aa26.41■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 TIAM1Q13009 1591 aa26.41■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.4■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.39■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NFIC-210ENST00000590282 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
NFIC-210ENST00000590282 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.36■■□□□ 1.81
NFIC-210ENST00000590282 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
NFIC-210ENST00000590282 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NFIC-210ENST00000590282 UACAQ9BZF9 1416 aa26.3■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 ARHGEF11O15085 1522 aa26.28■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.28■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 ABCC2Q92887 1545 aa26.27■■□□□ 1.8
NFIC-210ENST00000590282 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.24■■□□□ 1.79
NFIC-210ENST00000590282 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.19■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.18■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 ATP10BO94823 1461 aa26.18■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 ARID3CA6NKF2 412 aa26.16■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.15■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.15■■□□□ 1.78
NFIC-210ENST00000590282 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.12■■□□□ 1.77
NFIC-210ENST00000590282 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
NFIC-210ENST00000590282 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 NCOA2Q15596 1464 aa26.02■■□□□ 1.76
NFIC-210ENST00000590282 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26■■□□□ 1.75
NFIC-210ENST00000590282 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.99■■□□□ 1.75
NFIC-210ENST00000590282 KIF14Q15058 1648 aa25.95■■□□□ 1.74
NFIC-210ENST00000590282 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NFIC-210ENST00000590282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.93■■□□□ 1.74
NFIC-210ENST00000590282 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.9■■□□□ 1.74
NFIC-210ENST00000590282 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.88■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.88■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.87■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.86■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.85■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 ASXL2Q76L83 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
NFIC-210ENST00000590282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.81■■□□□ 1.72
NFIC-210ENST00000590282 MIA2Q96PC5 1412 aa25.81■■□□□ 1.72
NFIC-210ENST00000590282 MAPKBP1O60336 1514 aa25.8■■□□□ 1.72
NFIC-210ENST00000590282 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.723e-6■■■□□ 14.7
NFIC-210ENST00000590282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
NFIC-210ENST00000590282 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.79■■□□□ 1.72
NFIC-210ENST00000590282 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.77■■□□□ 1.72
NFIC-210ENST00000590282 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.722e-6■■■■□ 21.1
NFIC-210ENST00000590282 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.76■■□□□ 1.71
NFIC-210ENST00000590282 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NFIC-210ENST00000590282 PREX2Q70Z35 1606 aa25.73■■□□□ 1.71
NFIC-210ENST00000590282 KCNH8Q96L42 1107 aa25.73■■□□□ 1.71
NFIC-210ENST00000590282 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.71■■□□□ 1.71
NFIC-210ENST00000590282 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.7■■□□□ 1.7
NFIC-210ENST00000590282 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.69■■□□□ 1.7
NFIC-210ENST00000590282 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.67■■□□□ 1.7
NFIC-210ENST00000590282 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
NFIC-210ENST00000590282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
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