RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.43■■■■■ 4.38
TOMM40-205ENST00000589649 CUL7Q14999 1698 aa42.38■■■■■ 4.37
TOMM40-205ENST00000589649 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.34■■■■■ 4.37
TOMM40-205ENST00000589649 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.28■■■■■ 4.36
TOMM40-205ENST00000589649 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
TOMM40-205ENST00000589649 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.95■■■■■ 4.31
TOMM40-205ENST00000589649 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
TOMM40-205ENST00000589649 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.91■■■■■ 4.3
TOMM40-205ENST00000589649 IQGAP2Q13576 1575 aa41.9■■■■■ 4.3
TOMM40-205ENST00000589649 PTPRGP23470 1445 aa41.87■■■■■ 4.29
TOMM40-205ENST00000589649 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.84■■■■■ 4.29
TOMM40-205ENST00000589649 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.81■■■■■ 4.28
TOMM40-205ENST00000589649 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.78■■■■■ 4.28
TOMM40-205ENST00000589649 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.75■■■■■ 4.27
TOMM40-205ENST00000589649 DISP1Q96F81 1524 aa41.74■■■■■ 4.27
TOMM40-205ENST00000589649 MAPKBP1O60336 1514 aa41.73■■■■■ 4.27
TOMM40-205ENST00000589649 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.7■■■■■ 4.27
TOMM40-205ENST00000589649 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.66■■■■■ 4.26
TOMM40-205ENST00000589649 PRXQ9BXM0 1461 aa41.61■■■■■ 4.25
TOMM40-205ENST00000589649 DIP2BQ9P265 1576 aa41.59■■■■■ 4.25
TOMM40-205ENST00000589649 ABCC2Q92887 1545 aa41.54■■■■■ 4.24
TOMM40-205ENST00000589649 UACAQ9BZF9 1416 aa41.54■■■■■ 4.24
TOMM40-205ENST00000589649 KIAA0556O60303 1618 aa41.54■■■■■ 4.24
TOMM40-205ENST00000589649 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.5■■■■■ 4.23
TOMM40-205ENST00000589649 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.49■■■■■ 4.23
TOMM40-205ENST00000589649 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.45■■■■■ 4.23
TOMM40-205ENST00000589649 ASXL2Q76L83 1435 aa41.42■■■■■ 4.22
TOMM40-205ENST00000589649 GOLGA3Q08378 1498 aa41.34■■■■■ 4.21
TOMM40-205ENST00000589649 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.33■■■■■ 4.21
TOMM40-205ENST00000589649 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.32■■■■■ 4.2
TOMM40-205ENST00000589649 TSPOAP1O95153 1857 aa41.31■■■■■ 4.2
TOMM40-205ENST00000589649 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
TOMM40-205ENST00000589649 P3H3Q8IVL6 736 aa41.24■■■■■ 4.19
TOMM40-205ENST00000589649 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
TOMM40-205ENST00000589649 EEA1Q15075 1411 aa41.19■■■■■ 4.18
TOMM40-205ENST00000589649 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
TOMM40-205ENST00000589649 GLI2P10070 1586 aa41.17■■■■■ 4.18
TOMM40-205ENST00000589649 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
TOMM40-205ENST00000589649 ABCA8O94911 1581 aa41.14■■■■■ 4.18
TOMM40-205ENST00000589649 KDM6BO15054 1643 aa41.13■■■■■ 4.17
TOMM40-205ENST00000589649 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
TOMM40-205ENST00000589649 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.06■■■■■ 4.16
TOMM40-205ENST00000589649 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
TOMM40-205ENST00000589649 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.03■■■■■ 4.16
TOMM40-205ENST00000589649 ARID3CA6NKF2 412 aa41.03■■■■■ 4.16
TOMM40-205ENST00000589649 KCNH8Q96L42 1107 aa40.98■■■■■ 4.15
TOMM40-205ENST00000589649 SAMD9Q5K651 1589 aa40.97■■■■■ 4.15
TOMM40-205ENST00000589649 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.96■■■■■ 4.15
TOMM40-205ENST00000589649 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.91■■■■■ 4.14
TOMM40-205ENST00000589649 ATP10BO94823 1461 aa40.86■■■■■ 4.13
TOMM40-205ENST00000589649 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
TOMM40-205ENST00000589649 KIF21BO75037 1637 aa40.85■■■■■ 4.13
TOMM40-205ENST00000589649 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.83■■■■■ 4.13
TOMM40-205ENST00000589649 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.82■■■■■ 4.12
TOMM40-205ENST00000589649 CD109Q6YHK3 1445 aa40.78■■■■■ 4.12
TOMM40-205ENST00000589649 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.75■■■■■ 4.11
TOMM40-205ENST00000589649 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
TOMM40-205ENST00000589649 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
TOMM40-205ENST00000589649 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.7■■■■■ 4.11
TOMM40-205ENST00000589649 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
TOMM40-205ENST00000589649 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.69■■■■■ 4.1
TOMM40-205ENST00000589649 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.67■■■■■ 4.1
TOMM40-205ENST00000589649 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TOMM40-205ENST00000589649 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.6■■■■■ 4.09
TOMM40-205ENST00000589649 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.48■■■■■ 4.07
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.44■■■■■ 4.06
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.41■■■■■ 4.06
TOMM40-205ENST00000589649 ADGRL1O94910 1474 aa40.39■■■■■ 4.06
TOMM40-205ENST00000589649 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
TOMM40-205ENST00000589649 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
TOMM40-205ENST00000589649 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.34■■■■■ 4.05
TOMM40-205ENST00000589649 FMN1Q68DA7 1419 aa40.27■■■■■ 4.04
TOMM40-205ENST00000589649 RAPGEF3O95398 923 aa40.27■■■■■ 4.04
TOMM40-205ENST00000589649 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.26■■■■■ 4.04
TOMM40-205ENST00000589649 NEO1Q92859 1461 aa40.24■■■■■ 4.03
TOMM40-205ENST00000589649 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.037e-7■■■■□ 22.9
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TOMM40-205ENST00000589649 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.15■■■■■ 4.02
TOMM40-205ENST00000589649 AKNAQ7Z591 1439 aa40.08■■■■■ 4.01
TOMM40-205ENST00000589649 FANCAO15360 1455 aa40.07■■■■■ 4.01
TOMM40-205ENST00000589649 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.07■■■■■ 4.01
TOMM40-205ENST00000589649 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
TOMM40-205ENST00000589649 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
TOMM40-205ENST00000589649 PLCH2O75038 1416 aa39.97■■■■□ 3.99
TOMM40-205ENST00000589649 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.96■■■■□ 3.99
TOMM40-205ENST00000589649 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.94■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 KIF14Q15058 1648 aa39.92■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.91■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 CLIP1P30622 1438 aa39.91■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 RICTORQ6R327 1708 aa39.9■■■■□ 3.98
TOMM40-205ENST00000589649 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
TOMM40-205ENST00000589649 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
TOMM40-205ENST00000589649 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.83■■■■□ 3.97
TOMM40-205ENST00000589649 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.79■■■■□ 3.96
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.79■■■■□ 3.96
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.78■■■■□ 3.96
TOMM40-205ENST00000589649 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.77■■■■□ 3.96
TOMM40-205ENST00000589649 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.75■■■■□ 3.95
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