RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.73■■■□□ 2.67
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GIPC1-210ENST00000589497 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.71■■■□□ 2.67
GIPC1-210ENST00000589497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.7■■■□□ 2.67
GIPC1-210ENST00000589497 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
GIPC1-210ENST00000589497 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.58■■■□□ 2.65
GIPC1-210ENST00000589497 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.57■■■□□ 2.64
GIPC1-210ENST00000589497 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
GIPC1-210ENST00000589497 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.5■■■□□ 2.63
GIPC1-210ENST00000589497 IQGAP2Q13576 1575 aa31.5■■■□□ 2.63
GIPC1-210ENST00000589497 EEA1Q15075 1411 aa31.49■■■□□ 2.63
GIPC1-210ENST00000589497 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
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GIPC1-210ENST00000589497 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.3■■■□□ 2.6
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GIPC1-210ENST00000589497 KIAA0556O60303 1618 aa31.17■■■□□ 2.58
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GIPC1-210ENST00000589497 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.16■■■□□ 2.58
GIPC1-210ENST00000589497 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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GIPC1-210ENST00000589497 P3H3Q8IVL6 736 aa31.12■■■□□ 2.57
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GIPC1-210ENST00000589497 DIP2BQ9P265 1576 aa30.83■■■□□ 2.53
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GIPC1-210ENST00000589497 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
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GIPC1-210ENST00000589497 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.69■■■□□ 2.5
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GIPC1-210ENST00000589497 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
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GIPC1-210ENST00000589497 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
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GIPC1-210ENST00000589497 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-210ENST00000589497 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-210ENST00000589497 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.94■■■□□ 2.38
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.91■■■□□ 2.38
GIPC1-210ENST00000589497 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-210ENST00000589497 ADGRL1O94910 1474 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-210ENST00000589497 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-210ENST00000589497 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.88■■■□□ 2.37
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