RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588702.5

PRKAR1A-215, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-215ENST00000588702 GOLGA3Q08378 1498 aa30.89■■■□□ 2.54
PRKAR1A-215ENST00000588702 JPH4Q96JJ6 628 aa30.87■■■□□ 2.53
PRKAR1A-215ENST00000588702 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.85■■■□□ 2.53
PRKAR1A-215ENST00000588702 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PRKAR1A-215ENST00000588702 IQGAP2Q13576 1575 aa30.83■■■□□ 2.53
PRKAR1A-215ENST00000588702 SHROOM2Q13796 1616 aa30.79■■■□□ 2.52
PRKAR1A-215ENST00000588702 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.74■■■□□ 2.51
PRKAR1A-215ENST00000588702 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARHGEF11O15085 1522 aa30.69■■■□□ 2.5
PRKAR1A-215ENST00000588702 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.69■■■□□ 2.5
PRKAR1A-215ENST00000588702 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.68■■■□□ 2.5
PRKAR1A-215ENST00000588702 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.64■■■□□ 2.5
PRKAR1A-215ENST00000588702 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.64■■■□□ 2.5
PRKAR1A-215ENST00000588702 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.64■■■□□ 2.5
PRKAR1A-215ENST00000588702 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.62■■■□□ 2.49
PRKAR1A-215ENST00000588702 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.53■■■□□ 2.48
PRKAR1A-215ENST00000588702 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.53■■■□□ 2.48
PRKAR1A-215ENST00000588702 DISP1Q96F81 1524 aa30.52■■■□□ 2.48
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIAA0556O60303 1618 aa30.49■■■□□ 2.47
PRKAR1A-215ENST00000588702 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PRKAR1A-215ENST00000588702 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.47■■■□□ 2.47
PRKAR1A-215ENST00000588702 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.46■■■□□ 2.47
PRKAR1A-215ENST00000588702 SAMD9Q5K651 1589 aa30.45■■■□□ 2.47
PRKAR1A-215ENST00000588702 PTPRGP23470 1445 aa30.45■■■□□ 2.46
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARAP1Q96P48 1450 aa30.44■■■□□ 2.46
PRKAR1A-215ENST00000588702 P3H3Q8IVL6 736 aa30.39■■■□□ 2.46
PRKAR1A-215ENST00000588702 CLIP1P30622 1438 aa30.34■■■□□ 2.45
PRKAR1A-215ENST00000588702 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.31■■■□□ 2.44
PRKAR1A-215ENST00000588702 CEP162Q5TB80 1403 aa30.29■■■□□ 2.44
PRKAR1A-215ENST00000588702 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.26■■■□□ 2.43
PRKAR1A-215ENST00000588702 UACAQ9BZF9 1416 aa30.24■■■□□ 2.43
PRKAR1A-215ENST00000588702 FMN1Q68DA7 1419 aa30.23■■■□□ 2.43
PRKAR1A-215ENST00000588702 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
PRKAR1A-215ENST00000588702 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.19■■■□□ 2.42
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCC2Q92887 1545 aa30.15■■■□□ 2.42
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCA8O94911 1581 aa30.14■■■□□ 2.42
PRKAR1A-215ENST00000588702 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.13■■■□□ 2.41
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.11■■■□□ 2.41
PRKAR1A-215ENST00000588702 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.1■■■□□ 2.41
PRKAR1A-215ENST00000588702 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.02■■■□□ 2.4
PRKAR1A-215ENST00000588702 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PRKAR1A-215ENST00000588702 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.99■■■□□ 2.39
PRKAR1A-215ENST00000588702 HECW1Q76N89 1606 aa29.96■■■□□ 2.39
PRKAR1A-215ENST00000588702 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
PRKAR1A-215ENST00000588702 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.93■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 ATP10BO94823 1461 aa29.93■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.92■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAPKBP1O60336 1514 aa29.91■■■□□ 2.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PRKAR1A-215ENST00000588702 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PRKAR1A-215ENST00000588702 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.87■■■□□ 2.37
PRKAR1A-215ENST00000588702 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARID3CA6NKF2 412 aa29.86■■■□□ 2.37
PRKAR1A-215ENST00000588702 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.84■■■□□ 2.37
PRKAR1A-215ENST00000588702 ASXL2Q76L83 1435 aa29.82■■■□□ 2.36
PRKAR1A-215ENST00000588702 APLP2Q06481 763 aa29.77■■■□□ 2.36
PRKAR1A-215ENST00000588702 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.75■■■□□ 2.35
PRKAR1A-215ENST00000588702 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
PRKAR1A-215ENST00000588702 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.73■■■□□ 2.35
PRKAR1A-215ENST00000588702 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.71■■■□□ 2.35
PRKAR1A-215ENST00000588702 KCNH8Q96L42 1107 aa29.68■■■□□ 2.34
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAP3K1Q13233 1512 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKAR1A-215ENST00000588702 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.67■■■□□ 2.34
PRKAR1A-215ENST00000588702 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
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PRKAR1A-215ENST00000588702 DIP2BQ9P265 1576 aa29.61■■■□□ 2.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 TIAM1Q13009 1591 aa29.6■■■□□ 2.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.59■■■□□ 2.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.58■■■□□ 2.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.57■■■□□ 2.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF14Q15058 1648 aa29.52■■■□□ 2.32
PRKAR1A-215ENST00000588702 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.5■■■□□ 2.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.49■■■□□ 2.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 CD109Q6YHK3 1445 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.46■■■□□ 2.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.34e-7■■■■□ 24.6
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PRKAR1A-215ENST00000588702 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PRKAR1A-215ENST00000588702 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.39■■■□□ 2.3
PRKAR1A-215ENST00000588702 TSPOAP1O95153 1857 aa29.38■■■□□ 2.29
PRKAR1A-215ENST00000588702 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.35■■■□□ 2.29
PRKAR1A-215ENST00000588702 PLCH2O75038 1416 aa29.35■■■□□ 2.29
PRKAR1A-215ENST00000588702 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.34■■■□□ 2.29
PRKAR1A-215ENST00000588702 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.34■■■□□ 2.29
PRKAR1A-215ENST00000588702 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKAR1A-215ENST00000588702 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKAR1A-215ENST00000588702 NCOA2Q15596 1464 aa29.31■■■□□ 2.28
PRKAR1A-215ENST00000588702 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.3■■■□□ 2.28
PRKAR1A-215ENST00000588702 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PRKAR1A-215ENST00000588702 NEO1Q92859 1461 aa29.26■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.26■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PRKAR1A-215ENST00000588702 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.25■■■□□ 2.27
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