RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 CUL7Q14999 1698 aa31.9■■■□□ 2.7
CTIF-206ENST00000588345 JPH4Q96JJ6 628 aa31.9■■■□□ 2.7
CTIF-206ENST00000588345 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.8■■■□□ 2.68
CTIF-206ENST00000588345 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.71■■■□□ 2.67
CTIF-206ENST00000588345 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.57■■■□□ 2.64
CTIF-206ENST00000588345 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.56■■■□□ 2.64
CTIF-206ENST00000588345 MAPKBP1O60336 1514 aa31.51■■■□□ 2.63
CTIF-206ENST00000588345 IQGAP2Q13576 1575 aa31.5■■■□□ 2.63
CTIF-206ENST00000588345 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
CTIF-206ENST00000588345 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.46■■■□□ 2.63
CTIF-206ENST00000588345 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.45■■■□□ 2.62
CTIF-206ENST00000588345 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.44■■■□□ 2.62
CTIF-206ENST00000588345 PTPRGP23470 1445 aa31.43■■■□□ 2.62
CTIF-206ENST00000588345 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.41■■■□□ 2.62
CTIF-206ENST00000588345 DIP2BQ9P265 1576 aa31.39■■■□□ 2.61
CTIF-206ENST00000588345 DISP1Q96F81 1524 aa31.35■■■□□ 2.61
CTIF-206ENST00000588345 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.34■■■□□ 2.61
CTIF-206ENST00000588345 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.33■■■□□ 2.61
CTIF-206ENST00000588345 ABCC2Q92887 1545 aa31.28■■■□□ 2.6
CTIF-206ENST00000588345 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.27■■■□□ 2.6
CTIF-206ENST00000588345 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
CTIF-206ENST00000588345 KIAA0556O60303 1618 aa31.23■■■□□ 2.59
CTIF-206ENST00000588345 UACAQ9BZF9 1416 aa31.22■■■□□ 2.59
CTIF-206ENST00000588345 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.22■■■□□ 2.59
CTIF-206ENST00000588345 PRXQ9BXM0 1461 aa31.2■■■□□ 2.58
CTIF-206ENST00000588345 ASXL2Q76L83 1435 aa31.14■■■□□ 2.58
CTIF-206ENST00000588345 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.14■■■□□ 2.57
CTIF-206ENST00000588345 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.12■■■□□ 2.57
CTIF-206ENST00000588345 TSPOAP1O95153 1857 aa31.1■■■□□ 2.57
CTIF-206ENST00000588345 GLI2P10070 1586 aa31.09■■■□□ 2.57
CTIF-206ENST00000588345 GOLGA3Q08378 1498 aa31.07■■■□□ 2.56
CTIF-206ENST00000588345 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CTIF-206ENST00000588345 KDM6BO15054 1643 aa31.04■■■□□ 2.56
CTIF-206ENST00000588345 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CTIF-206ENST00000588345 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CTIF-206ENST00000588345 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CTIF-206ENST00000588345 ABCA8O94911 1581 aa30.94■■■□□ 2.54
CTIF-206ENST00000588345 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.94■■■□□ 2.54
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.91■■■□□ 2.54
CTIF-206ENST00000588345 EEA1Q15075 1411 aa30.9■■■□□ 2.54
CTIF-206ENST00000588345 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.87■■■□□ 2.53
CTIF-206ENST00000588345 SAMD9Q5K651 1589 aa30.79■■■□□ 2.52
CTIF-206ENST00000588345 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.78■■■□□ 2.52
CTIF-206ENST00000588345 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CTIF-206ENST00000588345 P3H3Q8IVL6 736 aa30.71■■■□□ 2.51
CTIF-206ENST00000588345 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.71■■■□□ 2.51
CTIF-206ENST00000588345 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CTIF-206ENST00000588345 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.67■■■□□ 2.5
CTIF-206ENST00000588345 ATP10BO94823 1461 aa30.66■■■□□ 2.5
CTIF-206ENST00000588345 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.65■■■□□ 2.5
CTIF-206ENST00000588345 CD109Q6YHK3 1445 aa30.64■■■□□ 2.5
CTIF-206ENST00000588345 KIF21BO75037 1637 aa30.64■■■□□ 2.5
CTIF-206ENST00000588345 KCNH8Q96L42 1107 aa30.62■■■□□ 2.49
CTIF-206ENST00000588345 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.62■■■□□ 2.49
CTIF-206ENST00000588345 ARID3CA6NKF2 412 aa30.54■■■□□ 2.48
CTIF-206ENST00000588345 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.52■■■□□ 2.48
CTIF-206ENST00000588345 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.51■■■□□ 2.47
CTIF-206ENST00000588345 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CTIF-206ENST00000588345 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.5■■■□□ 2.47
CTIF-206ENST00000588345 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.48■■■□□ 2.47
CTIF-206ENST00000588345 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CTIF-206ENST00000588345 ADGRL1O94910 1474 aa30.45■■■□□ 2.47
CTIF-206ENST00000588345 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.42■■■□□ 2.46
CTIF-206ENST00000588345 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.38■■■□□ 2.45
CTIF-206ENST00000588345 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CTIF-206ENST00000588345 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CTIF-206ENST00000588345 NEO1Q92859 1461 aa30.32■■■□□ 2.44
CTIF-206ENST00000588345 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.28■■■□□ 2.44
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.24■■■□□ 2.43
CTIF-206ENST00000588345 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.21■■■□□ 2.43
CTIF-206ENST00000588345 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.432e-7■■■■□ 26.2
CTIF-206ENST00000588345 FMN1Q68DA7 1419 aa30.21■■■□□ 2.43
CTIF-206ENST00000588345 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CTIF-206ENST00000588345 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.17■■■□□ 2.42
CTIF-206ENST00000588345 HECW1Q76N89 1606 aa30.16■■■□□ 2.42
CTIF-206ENST00000588345 RAPGEF3O95398 923 aa30.15■■■□□ 2.42
CTIF-206ENST00000588345 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.15■■■□□ 2.42
CTIF-206ENST00000588345 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.13■■■□□ 2.41
CTIF-206ENST00000588345 FANCAO15360 1455 aa30.11■■■□□ 2.41
CTIF-206ENST00000588345 AKNAQ7Z591 1439 aa30.1■■■□□ 2.41
CTIF-206ENST00000588345 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CTIF-206ENST00000588345 RICTORQ6R327 1708 aa30.08■■■□□ 2.41
CTIF-206ENST00000588345 PLCH2O75038 1416 aa30.02■■■□□ 2.4
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.01■■■□□ 2.4
CTIF-206ENST00000588345 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CTIF-206ENST00000588345 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30■■■□□ 2.39
CTIF-206ENST00000588345 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.99■■■□□ 2.39
CTIF-206ENST00000588345 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.99■■■□□ 2.39
CTIF-206ENST00000588345 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.98■■■□□ 2.39
CTIF-206ENST00000588345 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.95■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.95■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 KIF14Q15058 1648 aa29.93■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.9■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.9■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 CLIP1P30622 1438 aa29.89■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.89■■■□□ 2.38
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