RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 SHROOM2Q13796 1616 aa18.03■□□□□ 0.48
CTIF-204ENST00000587769 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-204ENST00000587769 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-204ENST00000587769 JPH4Q96JJ6 628 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-204ENST00000587769 PRXQ9BXM0 1461 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-204ENST00000587769 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-204ENST00000587769 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-204ENST00000587769 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.94■□□□□ 0.46
CTIF-204ENST00000587769 KIF21BO75037 1637 aa17.93■□□□□ 0.46
CTIF-204ENST00000587769 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CTIF-204ENST00000587769 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-204ENST00000587769 GOLGA3Q08378 1498 aa17.84■□□□□ 0.45
CTIF-204ENST00000587769 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.79■□□□□ 0.44
CTIF-204ENST00000587769 IQGAP2Q13576 1575 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-204ENST00000587769 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-204ENST00000587769 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-204ENST00000587769 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.68■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 PTPRGP23470 1445 aa17.67■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.66■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.66■□□□□ 0.42
CTIF-204ENST00000587769 DISP1Q96F81 1524 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-204ENST00000587769 MAPKBP1O60336 1514 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-204ENST00000587769 KIAA0556O60303 1618 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-204ENST00000587769 SAMD9Q5K651 1589 aa17.58■□□□□ 0.41
CTIF-204ENST00000587769 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.58■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.57■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.57■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.57■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 TSPOAP1O95153 1857 aa17.55■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 DIP2BQ9P265 1576 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 UACAQ9BZF9 1416 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 ABCC2Q92887 1545 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-204ENST00000587769 CLIP1P30622 1438 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 CEP162Q5TB80 1403 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 ASXL2Q76L83 1435 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-204ENST00000587769 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-204ENST00000587769 P3H3Q8IVL6 736 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-204ENST00000587769 ABCA8O94911 1581 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-204ENST00000587769 GLI2P10070 1586 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-204ENST00000587769 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-204ENST00000587769 FMN1Q68DA7 1419 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-204ENST00000587769 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-204ENST00000587769 KDM6BO15054 1643 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-204ENST00000587769 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-204ENST00000587769 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.33■□□□□ 0.37
CTIF-204ENST00000587769 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 HECW1Q76N89 1606 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 KCNH8Q96L42 1107 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 ARID3CA6NKF2 412 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 ATP10BO94823 1461 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-204ENST00000587769 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.27■□□□□ 0.35
CTIF-204ENST00000587769 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-204ENST00000587769 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-204ENST00000587769 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-204ENST00000587769 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.21■□□□□ 0.35
CTIF-204ENST00000587769 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CTIF-204ENST00000587769 CD109Q6YHK3 1445 aa17.21■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.19■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTIF-204ENST00000587769 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-204ENST00000587769 TIAM1Q13009 1591 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-204ENST00000587769 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-204ENST00000587769 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-204ENST00000587769 MAP3K1Q13233 1512 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-204ENST00000587769 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-204ENST00000587769 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CTIF-204ENST00000587769 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CTIF-204ENST00000587769 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-204ENST00000587769 APLP2Q06481 763 aa17.02■□□□□ 0.32
CTIF-204ENST00000587769 KIF14Q15058 1648 aa17.02■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.02■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 NEO1Q92859 1461 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 RAPGEF3O95398 923 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 ADGRL1O94910 1474 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-204ENST00000587769 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 AKNAQ7Z591 1439 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 RICTORQ6R327 1708 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-204ENST00000587769 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms