RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 CUL7Q14999 1698 aa50.75■■■■■ 5.71
SMAD2-208ENST00000587269 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.67■■■■■ 5.7
SMAD2-208ENST00000587269 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.63■■■■■ 5.7
SMAD2-208ENST00000587269 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50.57■■■■■ 5.69
SMAD2-208ENST00000587269 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP50.4■■■■■ 5.66
SMAD2-208ENST00000587269 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa50.19■■■■■ 5.63
SMAD2-208ENST00000587269 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP50.19■■■■■ 5.63
SMAD2-208ENST00000587269 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.19■■■■■ 5.62
SMAD2-208ENST00000587269 IQGAP2Q13576 1575 aa50.13■■■■■ 5.62
SMAD2-208ENST00000587269 PTPRGP23470 1445 aa50.12■■■■■ 5.61
SMAD2-208ENST00000587269 TNIKQ9UKE5 1360 aa50.04■■■■■ 5.6
SMAD2-208ENST00000587269 ADCY10Q96PN6 1610 aa50.03■■■■■ 5.6
SMAD2-208ENST00000587269 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.98■■■■■ 5.59
SMAD2-208ENST00000587269 MAPKBP1O60336 1514 aa49.91■■■■■ 5.58
SMAD2-208ENST00000587269 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.91■■■■■ 5.58
SMAD2-208ENST00000587269 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.87■■■■■ 5.57
SMAD2-208ENST00000587269 DISP1Q96F81 1524 aa49.8■■■■■ 5.56
SMAD2-208ENST00000587269 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.79■■■■■ 5.56
SMAD2-208ENST00000587269 UACAQ9BZF9 1416 aa49.7■■■■■ 5.55
SMAD2-208ENST00000587269 ABCC2Q92887 1545 aa49.7■■■■■ 5.55
SMAD2-208ENST00000587269 DIP2BQ9P265 1576 aa49.68■■■■■ 5.54
SMAD2-208ENST00000587269 PRXQ9BXM0 1461 aa49.67■■■■■ 5.54
SMAD2-208ENST00000587269 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.66■■■■■ 5.54
SMAD2-208ENST00000587269 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa49.63■■■■■ 5.53
SMAD2-208ENST00000587269 KIAA0556O60303 1618 aa49.62■■■■■ 5.53
SMAD2-208ENST00000587269 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.59■■■■■ 5.53
SMAD2-208ENST00000587269 GOLGA3Q08378 1498 aa49.57■■■■■ 5.53
SMAD2-208ENST00000587269 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
SMAD2-208ENST00000587269 PLB1Q6P1J6 1458 aa49.52■■■■■ 5.52
SMAD2-208ENST00000587269 ASXL2Q76L83 1435 aa49.51■■■■■ 5.52
SMAD2-208ENST00000587269 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.5■■■■■ 5.51
SMAD2-208ENST00000587269 TSPOAP1O95153 1857 aa49.45■■■■■ 5.51
SMAD2-208ENST00000587269 EEA1Q15075 1411 aa49.39■■■■■ 5.5
SMAD2-208ENST00000587269 KDM5BQ9UGL1 1544 aa49.39■■■■■ 5.5
SMAD2-208ENST00000587269 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
SMAD2-208ENST00000587269 P3H3Q8IVL6 736 aa49.26■■■■■ 5.48
SMAD2-208ENST00000587269 GLI2P10070 1586 aa49.25■■■■■ 5.47
SMAD2-208ENST00000587269 KDM6BO15054 1643 aa49.25■■■■■ 5.47
SMAD2-208ENST00000587269 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
SMAD2-208ENST00000587269 ABCA8O94911 1581 aa49.12■■■■■ 5.45
SMAD2-208ENST00000587269 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
SMAD2-208ENST00000587269 WDR7Q9Y4E6 1490 aa49.09■■■■■ 5.45
SMAD2-208ENST00000587269 KCNH8Q96L42 1107 aa49.05■■■■■ 5.44
SMAD2-208ENST00000587269 ARID3CA6NKF2 412 aa48.98■■■■■ 5.43
SMAD2-208ENST00000587269 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.98■■■■■ 5.43
SMAD2-208ENST00000587269 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.98■■■■■ 5.43
SMAD2-208ENST00000587269 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.96■■■■■ 5.43
SMAD2-208ENST00000587269 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.96■■■■■ 5.43
SMAD2-208ENST00000587269 SAMD9Q5K651 1589 aa48.93■■■■■ 5.42
SMAD2-208ENST00000587269 KIF21BO75037 1637 aa48.85■■■■■ 5.41
SMAD2-208ENST00000587269 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
SMAD2-208ENST00000587269 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP48.85■■■■■ 5.41
SMAD2-208ENST00000587269 CD109Q6YHK3 1445 aa48.83■■■■■ 5.41
SMAD2-208ENST00000587269 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.81■■■■■ 5.4
SMAD2-208ENST00000587269 ATP10BO94823 1461 aa48.8■■■■■ 5.4
SMAD2-208ENST00000587269 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
SMAD2-208ENST00000587269 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.75■■■■■ 5.39
SMAD2-208ENST00000587269 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.74■■■■■ 5.39
SMAD2-208ENST00000587269 CFAP43Q8NDM7 1665 aa48.73■■■■■ 5.39
SMAD2-208ENST00000587269 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa48.66■■■■■ 5.38
SMAD2-208ENST00000587269 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
SMAD2-208ENST00000587269 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.62■■■■■ 5.37
SMAD2-208ENST00000587269 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa48.57■■■■■ 5.37
SMAD2-208ENST00000587269 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
SMAD2-208ENST00000587269 PLEKHD1A6NEE1 506 aa48.5■■■■■ 5.35
SMAD2-208ENST00000587269 ABCA9Q8IUA7 1624 aa48.4■■■■■ 5.34
SMAD2-208ENST00000587269 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
SMAD2-208ENST00000587269 PHLDB1Q86UU1 1377 aa48.35■■■■■ 5.33
SMAD2-208ENST00000587269 FMN1Q68DA7 1419 aa48.28■■■■■ 5.32
SMAD2-208ENST00000587269 ADGRL1O94910 1474 aa48.28■■■■■ 5.32
SMAD2-208ENST00000587269 ARAP3Q8WWN8 1544 aa48.27■■■■■ 5.32
SMAD2-208ENST00000587269 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa48.21■■■■■ 5.31
SMAD2-208ENST00000587269 NEO1Q92859 1461 aa48.2■■■■■ 5.31
SMAD2-208ENST00000587269 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
SMAD2-208ENST00000587269 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
SMAD2-208ENST00000587269 RAPGEF3O95398 923 aa48.12■■■■■ 5.29
SMAD2-208ENST00000587269 HECW1Q76N89 1606 aa48.09■■■■■ 5.29
SMAD2-208ENST00000587269 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP48.02■■■■■ 5.28
SMAD2-208ENST00000587269 AKNAQ7Z591 1439 aa47.96■■■■■ 5.27
SMAD2-208ENST00000587269 FANCAO15360 1455 aa47.96■■■■■ 5.27
SMAD2-208ENST00000587269 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.93■■■■■ 5.26
SMAD2-208ENST00000587269 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.92■■■■■ 5.26
SMAD2-208ENST00000587269 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.91■■■■■ 5.26
SMAD2-208ENST00000587269 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP47.82■■■■■ 5.25
SMAD2-208ENST00000587269 CLIP1P30622 1438 aa47.81■■■■■ 5.24
SMAD2-208ENST00000587269 PLCH2O75038 1416 aa47.8■■■■■ 5.24
SMAD2-208ENST00000587269 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.77■■■■■ 5.24
SMAD2-208ENST00000587269 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.77■■■■■ 5.24
SMAD2-208ENST00000587269 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
SMAD2-208ENST00000587269 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.73■■■■■ 5.23
SMAD2-208ENST00000587269 KIF14Q15058 1648 aa47.72■■■■■ 5.23
SMAD2-208ENST00000587269 RICTORQ6R327 1708 aa47.68■■■■■ 5.22
SMAD2-208ENST00000587269 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.68■■■■■ 5.22
SMAD2-208ENST00000587269 SCAPERQ9BY12 1400 aa47.67■■■■■ 5.22
SMAD2-208ENST00000587269 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.67■■■■■ 5.22
SMAD2-208ENST00000587269 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
SMAD2-208ENST00000587269 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.61■■■■■ 5.21
SMAD2-208ENST00000587269 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47.58■■■■■ 5.21
SMAD2-208ENST00000587269 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.56■■■■■ 5.2
SMAD2-208ENST00000587269 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.55■■■■■ 5.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms