RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587235.5

TCF3-210, Transcript of transcription factor 3, human

TSL 5

Gene TCF3, Length 986 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF3-210	ENST00000587235	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.71	■■■■■ 4.59
TCF3-210	ENST00000587235	CUL7	Q14999	1698 aa		43.66	■■■■■ 4.58
TCF3-210	ENST00000587235	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.61	■■■■■ 4.57
TCF3-210	ENST00000587235	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.6	■■■■■ 4.57
TCF3-210	ENST00000587235	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.36	■■■■■ 4.53
TCF3-210	ENST00000587235	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TCF3-210	ENST00000587235	PTPRG	P23470	1445 aa		43.21	■■■■■ 4.51
TCF3-210	ENST00000587235	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.19	■■■■■ 4.51
TCF3-210	ENST00000587235	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.19	■■■■■ 4.5
TCF3-210	ENST00000587235	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.19	■■■■■ 4.5
TCF3-210	ENST00000587235	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.17	■■■■■ 4.5
TCF3-210	ENST00000587235	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.16	■■■■■ 4.5
TCF3-210	ENST00000587235	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.14	■■■■■ 4.5
TCF3-210	ENST00000587235	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.13	■■■■■ 4.49
TCF3-210	ENST00000587235	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TCF3-210	ENST00000587235	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.09	■■■■■ 4.49
TCF3-210	ENST00000587235	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.99	■■■■■ 4.47
TCF3-210	ENST00000587235	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.94	■■■■■ 4.46
TCF3-210	ENST00000587235	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.93	■■■■■ 4.46
TCF3-210	ENST00000587235	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.88	■■■■■ 4.46
TCF3-210	ENST00000587235	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TCF3-210	ENST00000587235	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.83	■■■■■ 4.45
TCF3-210	ENST00000587235	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.81	■■■■■ 4.44
TCF3-210	ENST00000587235	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
TCF3-210	ENST00000587235	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.77	■■■■■ 4.44
TCF3-210	ENST00000587235	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.74	■■■■■ 4.43
TCF3-210	ENST00000587235	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.73	■■■■■ 4.43
TCF3-210	ENST00000587235	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.7	■■■■■ 4.43
TCF3-210	ENST00000587235	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.66	■■■■■ 4.42
TCF3-210	ENST00000587235	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.64	■■■■■ 4.42
TCF3-210	ENST00000587235	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.64	■■■■■ 4.42
TCF3-210	ENST00000587235	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TCF3-210	ENST00000587235	GLI2	P10070	1586 aa		42.54	■■■■■ 4.4
TCF3-210	ENST00000587235	KDM6B	O15054	1643 aa		42.51	■■■■■ 4.4
TCF3-210	ENST00000587235	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
TCF3-210	ENST00000587235	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
TCF3-210	ENST00000587235	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.4	■■■■■ 4.38
TCF3-210	ENST00000587235	ABCA8	O94911	1581 aa		42.39	■■■■■ 4.38
TCF3-210	ENST00000587235	EEA1	Q15075	1411 aa		42.39	■■■■■ 4.38
TCF3-210	ENST00000587235	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
TCF3-210	ENST00000587235	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
TCF3-210	ENST00000587235	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.33	■■■■■ 4.37
TCF3-210	ENST00000587235	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TCF3-210	ENST00000587235	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.25	■■■■■ 4.35
TCF3-210	ENST00000587235	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.19	■■■■■ 4.34
TCF3-210	ENST00000587235	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.18	■■■■■ 4.34
TCF3-210	ENST00000587235	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
TCF3-210	ENST00000587235	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.16	■■■■■ 4.34
TCF3-210	ENST00000587235	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.16	■■■■■ 4.34
TCF3-210	ENST00000587235	ATP10B	O94823	1461 aa		42.11	■■■■■ 4.33
TCF3-210	ENST00000587235	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.1	■■■■■ 4.33
TCF3-210	ENST00000587235	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.1	■■■■■ 4.33
TCF3-210	ENST00000587235	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.07	■■■■■ 4.33
TCF3-210	ENST00000587235	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.01	■■■■■ 4.32
TCF3-210	ENST00000587235	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.01	■■■■■ 4.32
TCF3-210	ENST00000587235	KIF21B	O75037	1637 aa		41.99	■■■■■ 4.31
TCF3-210	ENST00000587235	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.97	■■■■■ 4.31
TCF3-210	ENST00000587235	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.96	■■■■■ 4.31
TCF3-210	ENST00000587235	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
TCF3-210	ENST00000587235	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
TCF3-210	ENST00000587235	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.89	■■■■■ 4.3
TCF3-210	ENST00000587235	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
TCF3-210	ENST00000587235	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.84	■■■■■ 4.29
TCF3-210	ENST00000587235	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.79	■■■■■ 4.28
TCF3-210	ENST00000587235	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.75	■■■■■ 4.27
TCF3-210	ENST00000587235	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.74	■■■■■ 4.27
TCF3-210	ENST00000587235	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.72	■■■■■ 4.27
TCF3-210	ENST00000587235	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.68	■■■■■ 4.26
TCF3-210	ENST00000587235	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.65	■■■■■ 4.26
TCF3-210	ENST00000587235	NEO1	Q92859	1461 aa		41.55	■■■■■ 4.24
TCF3-210	ENST00000587235	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.54	■■■■■ 4.24
TCF3-210	ENST00000587235	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.53	■■■■■ 4.24
TCF3-210	ENST00000587235	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.52	■■■■■ 4.24
TCF3-210	ENST00000587235	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TCF3-210	ENST00000587235	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.47	■■■■■ 4.23
TCF3-210	ENST00000587235	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.42	■■■■■ 4.22	5e-7	■■■□□ 18.3
TCF3-210	ENST00000587235	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.35	■■■■■ 4.21
TCF3-210	ENST00000587235	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.33	■■■■■ 4.21
TCF3-210	ENST00000587235	FANCA	O15360	1455 aa		41.33	■■■■■ 4.21
TCF3-210	ENST00000587235	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.32	■■■■■ 4.2
TCF3-210	ENST00000587235	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.31	■■■■■ 4.2
TCF3-210	ENST00000587235	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.29	■■■■■ 4.2
TCF3-210	ENST00000587235	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.28	■■■■■ 4.2
TCF3-210	ENST00000587235	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.23	■■■■■ 4.19
TCF3-210	ENST00000587235	PLCH2	O75038	1416 aa		41.21	■■■■■ 4.19
TCF3-210	ENST00000587235	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.17	■■■■■ 4.18
TCF3-210	ENST00000587235	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.15	■■■■■ 4.18
TCF3-210	ENST00000587235	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.12	■■■■■ 4.17
TCF3-210	ENST00000587235	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.11	■■■■■ 4.17
TCF3-210	ENST00000587235	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.09	■■■■■ 4.17
TCF3-210	ENST00000587235	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.07	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.07	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	CLIP1	P30622	1438 aa		41.06	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.06	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	KIF14	Q15058	1648 aa		41.06	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.06	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.05	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.02	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.01	■■■■■ 4.16
TCF3-210	ENST00000587235	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15

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