RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC6A-202ENST00000585934 JPH4Q96JJ6 628 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IQGAP2Q13576 1575 aa27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRXQ9BXM0 1461 aa27.56■■■□□ 2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.55■■■□□ 2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PTPRGP23470 1445 aa27.54■■■□□ 2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.54■■■□□ 2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DISP1Q96F81 1524 aa27.52■■■□□ 2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIAA0556O60303 1618 aa27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EEA1Q15075 1411 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAPKBP1O60336 1514 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GOLGA3Q08378 1498 aa27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCC2Q92887 1545 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DIP2BQ9P265 1576 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UACAQ9BZF9 1416 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF21BO75037 1637 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ASXL2Q76L83 1435 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TSPOAP1O95153 1857 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SAMD9Q5K651 1589 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCA8O94911 1581 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC6A-202ENST00000585934 P3H3Q8IVL6 736 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GLI2P10070 1586 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KDM6BO15054 1643 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARID3CA6NKF2 412 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ATP10BO94823 1461 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KCNH8Q96L42 1107 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CD109Q6YHK3 1445 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FMN1Q68DA7 1419 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HECW1Q76N89 1606 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CLIP1P30622 1438 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NEO1Q92859 1461 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF14Q15058 1648 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FANCAO15360 1455 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ADGRL1O94910 1474 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AKNAQ7Z591 1439 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RICTORQ6R327 1708 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RAPGEF3O95398 923 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CEP162Q5TB80 1403 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PLCH2O75038 1416 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PREX2Q70Z35 1606 aa26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.25■■□□□ 1.79
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