RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 CUL7Q14999 1698 aa38.96■■■■□ 3.83
TTC19-210ENST00000583704 IGF1RP08069 1367 aa38.95■■■■□ 3.83
TTC19-210ENST00000583704 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.81■■■■□ 3.8
TTC19-210ENST00000583704 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.72■■■■□ 3.79
TTC19-210ENST00000583704 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.66■■■■□ 3.78
TTC19-210ENST00000583704 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.63■■■■□ 3.77
TTC19-210ENST00000583704 MAPKBP1O60336 1514 aa38.52■■■■□ 3.76
TTC19-210ENST00000583704 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.51■■■■□ 3.76
TTC19-210ENST00000583704 IQGAP2Q13576 1575 aa38.51■■■■□ 3.76
TTC19-210ENST00000583704 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.45■■■■□ 3.75
TTC19-210ENST00000583704 PTPRGP23470 1445 aa38.42■■■■□ 3.74
TTC19-210ENST00000583704 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.41■■■■□ 3.74
TTC19-210ENST00000583704 DIP2BQ9P265 1576 aa38.4■■■■□ 3.74
TTC19-210ENST00000583704 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.4■■■■□ 3.74
TTC19-210ENST00000583704 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.39■■■■□ 3.74
TTC19-210ENST00000583704 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
TTC19-210ENST00000583704 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.36■■■■□ 3.73
TTC19-210ENST00000583704 DISP1Q96F81 1524 aa38.3■■■■□ 3.72
TTC19-210ENST00000583704 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.24■■■■□ 3.71
TTC19-210ENST00000583704 ABCC2Q92887 1545 aa38.23■■■■□ 3.71
TTC19-210ENST00000583704 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
TTC19-210ENST00000583704 KIAA0556O60303 1618 aa38.17■■■■□ 3.7
TTC19-210ENST00000583704 TSPOAP1O95153 1857 aa38.16■■■■□ 3.7
TTC19-210ENST00000583704 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.16■■■■□ 3.7
TTC19-210ENST00000583704 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.15■■■■□ 3.7
TTC19-210ENST00000583704 UACAQ9BZF9 1416 aa38.14■■■■□ 3.7
TTC19-210ENST00000583704 ASXL2Q76L83 1435 aa38.09■■■■□ 3.69
TTC19-210ENST00000583704 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.04■■■■□ 3.68
TTC19-210ENST00000583704 KDM6BO15054 1643 aa38.04■■■■□ 3.68
TTC19-210ENST00000583704 PRXQ9BXM0 1461 aa38.03■■■■□ 3.68
TTC19-210ENST00000583704 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38■■■■□ 3.67
TTC19-210ENST00000583704 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
TTC19-210ENST00000583704 GLI2P10070 1586 aa37.97■■■■□ 3.67
TTC19-210ENST00000583704 GOLGA3Q08378 1498 aa37.92■■■■□ 3.66
TTC19-210ENST00000583704 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
TTC19-210ENST00000583704 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
TTC19-210ENST00000583704 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.8■■■■□ 3.64
TTC19-210ENST00000583704 ABCA8O94911 1581 aa37.79■■■■□ 3.64
TTC19-210ENST00000583704 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.74■■■■□ 3.63
TTC19-210ENST00000583704 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.72■■■■□ 3.63
TTC19-210ENST00000583704 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.64■■■■□ 3.62
TTC19-210ENST00000583704 EEA1Q15075 1411 aa37.61■■■■□ 3.61
TTC19-210ENST00000583704 P3H3Q8IVL6 736 aa37.61■■■■□ 3.61
TTC19-210ENST00000583704 SAMD9Q5K651 1589 aa37.59■■■■□ 3.61
TTC19-210ENST00000583704 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
TTC19-210ENST00000583704 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.54■■■■□ 3.6
TTC19-210ENST00000583704 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.53■■■■□ 3.6
TTC19-210ENST00000583704 KCNH8Q96L42 1107 aa37.51■■■■□ 3.6
TTC19-210ENST00000583704 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
TTC19-210ENST00000583704 ARID3CA6NKF2 412 aa37.48■■■■□ 3.59
TTC19-210ENST00000583704 CD109Q6YHK3 1445 aa37.47■■■■□ 3.59
TTC19-210ENST00000583704 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.45■■■■□ 3.59
TTC19-210ENST00000583704 ATP10BO94823 1461 aa37.45■■■■□ 3.59
TTC19-210ENST00000583704 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.43■■■■□ 3.58
TTC19-210ENST00000583704 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
TTC19-210ENST00000583704 KIF21BO75037 1637 aa37.37■■■■□ 3.57
TTC19-210ENST00000583704 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.34■■■■□ 3.57
TTC19-210ENST00000583704 ADGRL1O94910 1474 aa37.33■■■■□ 3.57
TTC19-210ENST00000583704 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
TTC19-210ENST00000583704 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.26■■■■□ 3.56
TTC19-210ENST00000583704 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.21■■■■□ 3.55
TTC19-210ENST00000583704 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
TTC19-210ENST00000583704 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
TTC19-210ENST00000583704 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.15■■■■□ 3.54
TTC19-210ENST00000583704 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC19-210ENST00000583704 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.11■■■■□ 3.53
TTC19-210ENST00000583704 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TTC19-210ENST00000583704 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.03■■■■□ 3.52
TTC19-210ENST00000583704 NEO1Q92859 1461 aa37.02■■■■□ 3.52
TTC19-210ENST00000583704 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.99■■■■□ 3.51
TTC19-210ENST00000583704 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.5
TTC19-210ENST00000583704 RAPGEF3O95398 923 aa36.93■■■■□ 3.5
TTC19-210ENST00000583704 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.92■■■■□ 3.5
TTC19-210ENST00000583704 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.91■■■■□ 3.5
TTC19-210ENST00000583704 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.91■■■■□ 3.5
TTC19-210ENST00000583704 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.9■■■■□ 3.5
TTC19-210ENST00000583704 FMN1Q68DA7 1419 aa36.85■■■■□ 3.49
TTC19-210ENST00000583704 HECW1Q76N89 1606 aa36.85■■■■□ 3.49
TTC19-210ENST00000583704 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.83■■■■□ 3.49
TTC19-210ENST00000583704 FANCAO15360 1455 aa36.82■■■■□ 3.48
TTC19-210ENST00000583704 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.79■■■■□ 3.48
TTC19-210ENST00000583704 RICTORQ6R327 1708 aa36.79■■■■□ 3.48
TTC19-210ENST00000583704 AKNAQ7Z591 1439 aa36.78■■■■□ 3.48
TTC19-210ENST00000583704 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
TTC19-210ENST00000583704 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TTC19-210ENST00000583704 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.71■■■■□ 3.47
TTC19-210ENST00000583704 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.7■■■■□ 3.47
TTC19-210ENST00000583704 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.67■■■■□ 3.46
TTC19-210ENST00000583704 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.66■■■■□ 3.46
TTC19-210ENST00000583704 PLCH2O75038 1416 aa36.64■■■■□ 3.46
TTC19-210ENST00000583704 KIF14Q15058 1648 aa36.63■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.63■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.62■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 PTPRMP28827 1452 aa36.6■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 MADDQ8WXG6 1647 aa36.58■■■■□ 3.45
TTC19-210ENST00000583704 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
TTC19-210ENST00000583704 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
TTC19-210ENST00000583704 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.55■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms