RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-214ENST00000582717 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-214ENST00000582717 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.39■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.39■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.36■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 MYT1Q01538 1121 aa20.33■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.3■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 PBRM1Q86U86 1689 aa20.29■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 TIAM1Q13009 1591 aa20.29■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.27■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 P3H3Q8IVL6 736 aa20.27■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 WDR62O43379 1518 aa20.27■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 MAP3K1Q13233 1512 aa20.27■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.26■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.831e-7■■■■□ 25.8
GGA3-214ENST00000582717 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.22■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 ADAMTS12P58397 1594 aa20.2■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 SAMD9Q5K651 1589 aa20.19■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 IFT140Q96RY7 1462 aa20.19■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.18■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.17■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.15■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 ERCC6Q03468 1493 aa20.15■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 GRIN2BQ13224 1484 aa20.15■□□□□ 0.82
GGA3-214ENST00000582717 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
GGA3-214ENST00000582717 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.13■□□□□ 0.81
GGA3-214ENST00000582717 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.12■□□□□ 0.81
GGA3-214ENST00000582717 FMN1Q68DA7 1419 aa20.11■□□□□ 0.81
GGA3-214ENST00000582717 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GGA3-214ENST00000582717 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GGA3-214ENST00000582717 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.06■□□□□ 0.8
GGA3-214ENST00000582717 IQGAP2Q13576 1575 aa20.06■□□□□ 0.8
GGA3-214ENST00000582717 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.05■□□□□ 0.8
GGA3-214ENST00000582717 MIER1Q8N108 512 aa19.97■□□□□ 0.79
GGA3-214ENST00000582717 ITGAEP38570 1179 aa19.97■□□□□ 0.79
GGA3-214ENST00000582717 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
GGA3-214ENST00000582717 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.95■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 GRIN2AQ12879 1464 aa19.94■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.92■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.91■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.9■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
GGA3-214ENST00000582717 HECW1Q76N89 1606 aa19.89■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.87■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 KIAA0556O60303 1618 aa19.87■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 DISP1Q96F81 1524 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 SYNJ2O15056 1496 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.85■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 CEP170Q5SW79 1584 aa19.84■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 NCOA2Q15596 1464 aa19.84■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
GGA3-214ENST00000582717 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
GGA3-214ENST00000582717 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.82■□□□□ 0.76
GGA3-214ENST00000582717 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
GGA3-214ENST00000582717 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
GGA3-214ENST00000582717 ARHGEF11O15085 1522 aa19.79■□□□□ 0.76
GGA3-214ENST00000582717 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.78■□□□□ 0.76
GGA3-214ENST00000582717 NUP160Q12769 1436 aa19.75■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 FBLN2P98095 1184 aa19.75■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 MAPKBP1O60336 1514 aa19.74■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.73■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.72■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 ARID3CA6NKF2 412 aa19.72■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 PTPRKQ15262 1439 aa19.71■□□□□ 0.75
GGA3-214ENST00000582717 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
GGA3-214ENST00000582717 JPH4Q96JJ6 628 aa19.63■□□□□ 0.73
GGA3-214ENST00000582717 HFM1A2PYH4 1435 aa19.63■□□□□ 0.73
GGA3-214ENST00000582717 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.63■□□□□ 0.73
GGA3-214ENST00000582717 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.62■□□□□ 0.73
GGA3-214ENST00000582717 MIA2Q96PC5 1412 aa19.59■□□□□ 0.73
GGA3-214ENST00000582717 NAIPQ13075 1403 aa19.58■□□□□ 0.73
GGA3-214ENST00000582717 CHD1O14646 1710 aa19.58■□□□□ 0.72
GGA3-214ENST00000582717 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
GGA3-214ENST00000582717 ABCA8O94911 1581 aa19.53■□□□□ 0.72
GGA3-214ENST00000582717 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
GGA3-214ENST00000582717 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.53■□□□□ 0.72
GGA3-214ENST00000582717 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
GGA3-214ENST00000582717 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.51■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 UACAQ9BZF9 1416 aa19.51■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 KIF14Q15058 1648 aa19.49■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.49■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.49■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 AKNAQ7Z591 1439 aa19.48■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.48■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 KDM6BO15054 1643 aa19.46■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 DAPK1P53355 1430 aa19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms