RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-214ENST00000582717 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-214ENST00000582717 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.39■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.39■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.36■□□□□ 0.85
GGA3-214ENST00000582717 MYT1Q01538 1121 aa20.33■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.3■□□□□ 0.84
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GGA3-214ENST00000582717 P3H3Q8IVL6 736 aa20.27■□□□□ 0.84
GGA3-214ENST00000582717 WDR62O43379 1518 aa20.27■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 MAP3K1Q13233 1512 aa20.27■□□□□ 0.83
GGA3-214ENST00000582717 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.26■□□□□ 0.83
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GGA3-214ENST00000582717 CEP170Q5SW79 1584 aa19.84■□□□□ 0.77
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GGA3-214ENST00000582717 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
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GGA3-214ENST00000582717 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.82■□□□□ 0.76
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GGA3-214ENST00000582717 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.72■□□□□ 0.75
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GGA3-214ENST00000582717 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
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GGA3-214ENST00000582717 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.62■□□□□ 0.73
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GGA3-214ENST00000582717 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 UACAQ9BZF9 1416 aa19.51■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 KIF14Q15058 1648 aa19.49■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.49■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.49■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 AKNAQ7Z591 1439 aa19.48■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.48■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 KDM6BO15054 1643 aa19.46■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
GGA3-214ENST00000582717 DAPK1P53355 1430 aa19.45■□□□□ 0.7
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