RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581598.1

CCDC42-203, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC42, Length 538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-203ENST00000581598 JPH4Q96JJ6 628 aa36.31■■■■□ 3.4
CCDC42-203ENST00000581598 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
CCDC42-203ENST00000581598 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.21■■■■□ 3.39
CCDC42-203ENST00000581598 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.15■■■■□ 3.38
CCDC42-203ENST00000581598 IQGAP2Q13576 1575 aa35.89■■■■□ 3.34
CCDC42-203ENST00000581598 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.88■■■■□ 3.33
CCDC42-203ENST00000581598 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
CCDC42-203ENST00000581598 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.85■■■■□ 3.33
CCDC42-203ENST00000581598 MAPKBP1O60336 1514 aa35.83■■■■□ 3.33
CCDC42-203ENST00000581598 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
CCDC42-203ENST00000581598 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.81■■■■□ 3.32
CCDC42-203ENST00000581598 PTPRGP23470 1445 aa35.77■■■■□ 3.32
CCDC42-203ENST00000581598 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.76■■■■□ 3.32
CCDC42-203ENST00000581598 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.73■■■■□ 3.31
CCDC42-203ENST00000581598 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.7■■■■□ 3.31
CCDC42-203ENST00000581598 DISP1Q96F81 1524 aa35.69■■■■□ 3.3
CCDC42-203ENST00000581598 DIP2BQ9P265 1576 aa35.65■■■■□ 3.3
CCDC42-203ENST00000581598 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CCDC42-203ENST00000581598 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.61■■■■□ 3.29
CCDC42-203ENST00000581598 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.6■■■■□ 3.29
CCDC42-203ENST00000581598 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.6■■■■□ 3.29
CCDC42-203ENST00000581598 PRXQ9BXM0 1461 aa35.6■■■■□ 3.29
CCDC42-203ENST00000581598 ABCC2Q92887 1545 aa35.59■■■■□ 3.29
CCDC42-203ENST00000581598 KIAA0556O60303 1618 aa35.56■■■■□ 3.28
CCDC42-203ENST00000581598 UACAQ9BZF9 1416 aa35.54■■■■□ 3.28
CCDC42-203ENST00000581598 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CCDC42-203ENST00000581598 GOLGA3Q08378 1498 aa35.43■■■■□ 3.26
CCDC42-203ENST00000581598 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.43■■■■□ 3.26
CCDC42-203ENST00000581598 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.42■■■■□ 3.26
CCDC42-203ENST00000581598 ASXL2Q76L83 1435 aa35.4■■■■□ 3.26
CCDC42-203ENST00000581598 GLI2P10070 1586 aa35.36■■■■□ 3.25
CCDC42-203ENST00000581598 TSPOAP1O95153 1857 aa35.33■■■■□ 3.25
CCDC42-203ENST00000581598 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.32■■■■□ 3.24
CCDC42-203ENST00000581598 EEA1Q15075 1411 aa35.32■■■■□ 3.24
CCDC42-203ENST00000581598 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CCDC42-203ENST00000581598 KDM6BO15054 1643 aa35.25■■■■□ 3.23
CCDC42-203ENST00000581598 ABCA8O94911 1581 aa35.24■■■■□ 3.23
CCDC42-203ENST00000581598 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CCDC42-203ENST00000581598 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CCDC42-203ENST00000581598 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.15■■■■□ 3.22
CCDC42-203ENST00000581598 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.12■■■■□ 3.21
CCDC42-203ENST00000581598 SAMD9Q5K651 1589 aa35.11■■■■□ 3.21
CCDC42-203ENST00000581598 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CCDC42-203ENST00000581598 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.03■■■■□ 3.2
CCDC42-203ENST00000581598 KIF21BO75037 1637 aa35■■■■□ 3.19
CCDC42-203ENST00000581598 P3H3Q8IVL6 736 aa34.97■■■■□ 3.19
CCDC42-203ENST00000581598 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.95■■■■□ 3.18
CCDC42-203ENST00000581598 ATP10BO94823 1461 aa34.9■■■■□ 3.18
CCDC42-203ENST00000581598 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.9■■■■□ 3.18
CCDC42-203ENST00000581598 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.9■■■■□ 3.18
CCDC42-203ENST00000581598 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.89■■■■□ 3.18
CCDC42-203ENST00000581598 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
CCDC42-203ENST00000581598 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.88■■■■□ 3.17
CCDC42-203ENST00000581598 CD109Q6YHK3 1445 aa34.86■■■■□ 3.17
CCDC42-203ENST00000581598 KCNH8Q96L42 1107 aa34.84■■■■□ 3.17
CCDC42-203ENST00000581598 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.82■■■■□ 3.16
CCDC42-203ENST00000581598 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.79■■■■□ 3.16
CCDC42-203ENST00000581598 ARID3CA6NKF2 412 aa34.75■■■■□ 3.15
CCDC42-203ENST00000581598 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
CCDC42-203ENST00000581598 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.73■■■■□ 3.15
CCDC42-203ENST00000581598 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
CCDC42-203ENST00000581598 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.6■■■■□ 3.13
CCDC42-203ENST00000581598 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CCDC42-203ENST00000581598 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CCDC42-203ENST00000581598 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.6■■■■□ 3.13
CCDC42-203ENST00000581598 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CCDC42-203ENST00000581598 ADGRL1O94910 1474 aa34.54■■■■□ 3.12
CCDC42-203ENST00000581598 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.51■■■■□ 3.12
CCDC42-203ENST00000581598 NEO1Q92859 1461 aa34.51■■■■□ 3.11
CCDC42-203ENST00000581598 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.5■■■■□ 3.11
CCDC42-203ENST00000581598 FMN1Q68DA7 1419 aa34.48■■■■□ 3.11
CCDC42-203ENST00000581598 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.46■■■■□ 3.11
CCDC42-203ENST00000581598 HECW1Q76N89 1606 aa34.4■■■■□ 3.1
CCDC42-203ENST00000581598 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
CCDC42-203ENST00000581598 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
CCDC42-203ENST00000581598 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.33■■■■□ 3.09
CCDC42-203ENST00000581598 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.32■■■■□ 3.09
CCDC42-203ENST00000581598 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.31■■■■□ 3.08
CCDC42-203ENST00000581598 RAPGEF3O95398 923 aa34.29■■■■□ 3.08
CCDC42-203ENST00000581598 FANCAO15360 1455 aa34.27■■■■□ 3.08
CCDC42-203ENST00000581598 AKNAQ7Z591 1439 aa34.26■■■■□ 3.07
CCDC42-203ENST00000581598 RICTORQ6R327 1708 aa34.23■■■■□ 3.07
CCDC42-203ENST00000581598 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
CCDC42-203ENST00000581598 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
CCDC42-203ENST00000581598 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CCDC42-203ENST00000581598 PLCH2O75038 1416 aa34.19■■■■□ 3.06
CCDC42-203ENST00000581598 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.18■■■■□ 3.06
CCDC42-203ENST00000581598 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CCDC42-203ENST00000581598 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.13■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.13■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.13■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 KIF14Q15058 1648 aa34.12■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.12■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.09■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 CLIP1P30622 1438 aa34.09■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.08■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.07■■■■□ 3.05
CCDC42-203ENST00000581598 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.05■■■■□ 3.04
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