RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-210ENST00000580357 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.5■■□□□ 1.99
IFT20-210ENST00000580357 ARAP1Q96P48 1450 aa27.49■■□□□ 1.99
IFT20-210ENST00000580357 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.49■■□□□ 1.99
IFT20-210ENST00000580357 SHROOM2Q13796 1616 aa27.45■■□□□ 1.98
IFT20-210ENST00000580357 EEA1Q15075 1411 aa27.44■■□□□ 1.98
IFT20-210ENST00000580357 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.44■■□□□ 1.98
IFT20-210ENST00000580357 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
IFT20-210ENST00000580357 PRXQ9BXM0 1461 aa27.35■■□□□ 1.97
IFT20-210ENST00000580357 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.31■■□□□ 1.96
IFT20-210ENST00000580357 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.26■■□□□ 1.95
IFT20-210ENST00000580357 IQGAP2Q13576 1575 aa27.26■■□□□ 1.95
IFT20-210ENST00000580357 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
IFT20-210ENST00000580357 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
IFT20-210ENST00000580357 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.15■■□□□ 1.94
IFT20-210ENST00000580357 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.14■■□□□ 1.94
IFT20-210ENST00000580357 PTPRGP23470 1445 aa27.14■■□□□ 1.93
IFT20-210ENST00000580357 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
IFT20-210ENST00000580357 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.09■■□□□ 1.93
IFT20-210ENST00000580357 GOLGA3Q08378 1498 aa27.06■■□□□ 1.92
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IFT20-210ENST00000580357 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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IFT20-210ENST00000580357 KIAA0556O60303 1618 aa26.96■■□□□ 1.91
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IFT20-210ENST00000580357 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.9■■□□□ 1.9
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IFT20-210ENST00000580357 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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IFT20-210ENST00000580357 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.74■■□□□ 1.87
IFT20-210ENST00000580357 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.74■■□□□ 1.87
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IFT20-210ENST00000580357 ASXL2Q76L83 1435 aa26.66■■□□□ 1.86
IFT20-210ENST00000580357 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.64■■□□□ 1.85
IFT20-210ENST00000580357 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
IFT20-210ENST00000580357 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.58■■□□□ 1.84
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IFT20-210ENST00000580357 FMN1Q68DA7 1419 aa26.55■■□□□ 1.84
IFT20-210ENST00000580357 ATP10BO94823 1461 aa26.55■■□□□ 1.84
IFT20-210ENST00000580357 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.55■■□□□ 1.84
IFT20-210ENST00000580357 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
IFT20-210ENST00000580357 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
IFT20-210ENST00000580357 GLI2P10070 1586 aa26.51■■□□□ 1.83
IFT20-210ENST00000580357 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.51■■□□□ 1.83
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IFT20-210ENST00000580357 KCNH8Q96L42 1107 aa26.48■■□□□ 1.83
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IFT20-210ENST00000580357 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
IFT20-210ENST00000580357 CLIP1P30622 1438 aa26.43■■□□□ 1.82
IFT20-210ENST00000580357 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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IFT20-210ENST00000580357 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.37■■□□□ 1.81
IFT20-210ENST00000580357 CD109Q6YHK3 1445 aa26.34■■□□□ 1.81
IFT20-210ENST00000580357 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.33■■□□□ 1.81
IFT20-210ENST00000580357 TSPOAP1O95153 1857 aa26.33■■□□□ 1.81
IFT20-210ENST00000580357 HECW1Q76N89 1606 aa26.32■■□□□ 1.8
IFT20-210ENST00000580357 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.32■■□□□ 1.8
IFT20-210ENST00000580357 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.29■■□□□ 1.8
IFT20-210ENST00000580357 CEP162Q5TB80 1403 aa26.27■■□□□ 1.8
IFT20-210ENST00000580357 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.27■■□□□ 1.8
IFT20-210ENST00000580357 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.26■■□□□ 1.79
IFT20-210ENST00000580357 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
IFT20-210ENST00000580357 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
IFT20-210ENST00000580357 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.2■■□□□ 1.79
IFT20-210ENST00000580357 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.2■■□□□ 1.78
IFT20-210ENST00000580357 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.2■■□□□ 1.78
IFT20-210ENST00000580357 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.19■■□□□ 1.78
IFT20-210ENST00000580357 KDM6BO15054 1643 aa26.19■■□□□ 1.78
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IFT20-210ENST00000580357 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.09■■□□□ 1.77
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IFT20-210ENST00000580357 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.04■■□□□ 1.76
IFT20-210ENST00000580357 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.03■■□□□ 1.76
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IFT20-210ENST00000580357 KIF14Q15058 1648 aa26■■□□□ 1.75
IFT20-210ENST00000580357 FANCAO15360 1455 aa25.98■■□□□ 1.75
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IFT20-210ENST00000580357 AKNAQ7Z591 1439 aa25.97■■□□□ 1.75
IFT20-210ENST00000580357 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.97■■□□□ 1.75
IFT20-210ENST00000580357 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.96■■□□□ 1.75
IFT20-210ENST00000580357 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.95■■□□□ 1.75
IFT20-210ENST00000580357 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
IFT20-210ENST00000580357 RAPGEF3O95398 923 aa25.91■■□□□ 1.74
IFT20-210ENST00000580357 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
IFT20-210ENST00000580357 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.88■■□□□ 1.73
IFT20-210ENST00000580357 APLP2Q06481 763 aa25.86■■□□□ 1.73
IFT20-210ENST00000580357 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.84■■□□□ 1.73
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