RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580087.5

TIMM21-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 21, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM21, Length 2,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM21-204ENST00000580087 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TIMM21-204ENST00000580087 WDR97A6NE52 1622 aa12.01□□□□□ -0.49
TIMM21-204ENST00000580087 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TIMM21-204ENST00000580087 CUL7Q14999 1698 aa11.99□□□□□ -0.49
TIMM21-204ENST00000580087 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TIMM21-204ENST00000580087 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.96□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.94□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 P3H3Q8IVL6 736 aa11.94□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.94□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 TIAM1Q13009 1591 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TIMM21-204ENST00000580087 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.9□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 MAP3K1Q13233 1512 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 PBRM1Q86U86 1689 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMM21-204ENST00000580087 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.83□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 ITGAEP38570 1179 aa11.83□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.81□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 SAMD9Q5K651 1589 aa11.81□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 FMN1Q68DA7 1419 aa11.8□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 WDR62O43379 1518 aa11.8□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 ADAMTS12P58397 1594 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 ERCC6Q03468 1493 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 GRIN2BQ13224 1484 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 IFT140Q96RY7 1462 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM21-204ENST00000580087 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 IQGAP2Q13576 1575 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.72□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TIMM21-204ENST00000580087 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.71□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.7□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 HECW1Q76N89 1606 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 GRIN2AQ12879 1464 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 NCOA2Q15596 1464 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMM21-204ENST00000580087 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.65□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.64□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 ARID3CA6NKF2 412 aa11.63□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.63□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 KCNA4P22459 653 aa11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 MAPKBP1O60336 1514 aa11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 KIAA0556O60303 1618 aa11.62□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.61□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 FBLN2P98095 1184 aa11.61□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 DISP1Q96F81 1524 aa11.6□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 SYNJ2O15056 1496 aa11.59□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 CEP170Q5SW79 1584 aa11.59□□□□□ -0.55
TIMM21-204ENST00000580087 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.58□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 ARHGEF11O15085 1522 aa11.58□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 PTPRKQ15262 1439 aa11.57□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.55□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 HFM1A2PYH4 1435 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 NEUROD1Q13562 356 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMM21-204ENST00000580087 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 NUP160Q12769 1436 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 NAIPQ13075 1403 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 MIER1Q8N108 512 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.5□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 JPH4Q96JJ6 628 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 MIA2Q96PC5 1412 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 UACAQ9BZF9 1416 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMM21-204ENST00000580087 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms