RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578552.5

GPS1-208, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPS1, Length 1,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-208ENST00000578552 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.35■■□□□ 1.81
GPS1-208ENST00000578552 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.3■■□□□ 1.8
GPS1-208ENST00000578552 CEP162Q5TB80 1403 aa26.23■■□□□ 1.79
GPS1-208ENST00000578552 NUP160Q12769 1436 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-208ENST00000578552 IQGAP2Q13576 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
GPS1-208ENST00000578552 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.13■■□□□ 1.77
GPS1-208ENST00000578552 CLIP1P30622 1438 aa26.12■■□□□ 1.77
GPS1-208ENST00000578552 P3H3Q8IVL6 736 aa26.12■■□□□ 1.77
GPS1-208ENST00000578552 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.08■■□□□ 1.77
GPS1-208ENST00000578552 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.07■■□□□ 1.76
GPS1-208ENST00000578552 ARAP1Q96P48 1450 aa26.02■■□□□ 1.76
GPS1-208ENST00000578552 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.01■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.01■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 SAMD9Q5K651 1589 aa26■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 JPH4Q96JJ6 628 aa26■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 OSCARQ8IYS5 282 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 DISP1Q96F81 1524 aa25.98■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 SHROOM2Q13796 1616 aa25.96■■□□□ 1.75
GPS1-208ENST00000578552 KIAA0556O60303 1618 aa25.95■■□□□ 1.74
GPS1-208ENST00000578552 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GPS1-208ENST00000578552 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.91■■□□□ 1.74
GPS1-208ENST00000578552 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.78■■□□□ 1.72
GPS1-208ENST00000578552 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GPS1-208ENST00000578552 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.77■■□□□ 1.72
GPS1-208ENST00000578552 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
GPS1-208ENST00000578552 ARID3CA6NKF2 412 aa25.71■■□□□ 1.71
GPS1-208ENST00000578552 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GPS1-208ENST00000578552 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.71■■□□□ 1.71
GPS1-208ENST00000578552 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.7■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 ARHGEF11O15085 1522 aa25.69■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 FMN1Q68DA7 1419 aa25.66■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 PTPRGP23470 1445 aa25.65■■□□□ 1.7
GPS1-208ENST00000578552 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.62■■□□□ 1.69
GPS1-208ENST00000578552 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.59■■□□□ 1.69
GPS1-208ENST00000578552 ABCA8O94911 1581 aa25.58■■□□□ 1.69
GPS1-208ENST00000578552 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.58■■□□□ 1.68
GPS1-208ENST00000578552 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GPS1-208ENST00000578552 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GPS1-208ENST00000578552 HECW1Q76N89 1606 aa25.54■■□□□ 1.68
GPS1-208ENST00000578552 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 UACAQ9BZF9 1416 aa25.49■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.49■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.49■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 TIAM1Q13009 1591 aa25.48■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.47■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 ABCC2Q92887 1545 aa25.45■■□□□ 1.67
GPS1-208ENST00000578552 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.44■■□□□ 1.66
GPS1-208ENST00000578552 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
GPS1-208ENST00000578552 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GPS1-208ENST00000578552 APLP2Q06481 763 aa25.41■■□□□ 1.66
GPS1-208ENST00000578552 ATP10BO94823 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
GPS1-208ENST00000578552 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
GPS1-208ENST00000578552 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.35■■□□□ 1.65
GPS1-208ENST00000578552 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.34■■□□□ 1.65
GPS1-208ENST00000578552 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.33■■□□□ 1.65
GPS1-208ENST00000578552 MAP3K1Q13233 1512 aa25.3■■□□□ 1.64
GPS1-208ENST00000578552 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.29■■□□□ 1.64
GPS1-208ENST00000578552 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.28■■□□□ 1.64
GPS1-208ENST00000578552 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.27■■□□□ 1.64
GPS1-208ENST00000578552 KIF14Q15058 1648 aa25.25■■□□□ 1.63
GPS1-208ENST00000578552 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.22■■□□□ 1.63
GPS1-208ENST00000578552 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 KCNH8Q96L42 1107 aa25.16■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.16■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.15■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 NCOA2Q15596 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 ASXL2Q76L83 1435 aa25.15■■□□□ 1.62
GPS1-208ENST00000578552 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GPS1-208ENST00000578552 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
GPS1-208ENST00000578552 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.1■■□□□ 1.61
GPS1-208ENST00000578552 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.09■■□□□ 1.61
GPS1-208ENST00000578552 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.08■■□□□ 1.61
GPS1-208ENST00000578552 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
GPS1-208ENST00000578552 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.03■■□□□ 1.6
GPS1-208ENST00000578552 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.03■■□□□ 1.6
GPS1-208ENST00000578552 MAPKBP1O60336 1514 aa25.02■■□□□ 1.6
GPS1-208ENST00000578552 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GPS1-208ENST00000578552 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.96■■□□□ 1.59
GPS1-208ENST00000578552 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.96■■□□□ 1.59
GPS1-208ENST00000578552 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.96■■□□□ 1.59
GPS1-208ENST00000578552 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GPS1-208ENST00000578552 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.93■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.93■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 PREX2Q70Z35 1606 aa24.92■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.92■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 DIP2BQ9P265 1576 aa24.91■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.91■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.9■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.89■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
GPS1-208ENST00000578552 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms