RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576761.5

PITPNA-211, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, human

TSL 4

Gene PITPNA, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNA-211	ENST00000576761	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.51	■■■■■ 4.72
PITPNA-211	ENST00000576761	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.5	■■■■■ 4.71
PITPNA-211	ENST00000576761	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.4	■■■■■ 4.7
PITPNA-211	ENST00000576761	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.39	■■■■■ 4.7
PITPNA-211	ENST00000576761	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		44.07	■■■■■ 4.65
PITPNA-211	ENST00000576761	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.05	■■■■■ 4.64
PITPNA-211	ENST00000576761	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.96	■■■■■ 4.63
PITPNA-211	ENST00000576761	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.95	■■■■■ 4.63
PITPNA-211	ENST00000576761	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.91	■■■■■ 4.62
PITPNA-211	ENST00000576761	PTPRG	P23470	1445 aa		43.88	■■■■■ 4.61
PITPNA-211	ENST00000576761	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.85	■■■■■ 4.61
PITPNA-211	ENST00000576761	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.85	■■■■■ 4.61
PITPNA-211	ENST00000576761	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.81	■■■■■ 4.6
PITPNA-211	ENST00000576761	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.78	■■■■■ 4.6
PITPNA-211	ENST00000576761	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.77	■■■■■ 4.6
PITPNA-211	ENST00000576761	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.75	■■■■■ 4.59
PITPNA-211	ENST00000576761	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.74	■■■■■ 4.59
PITPNA-211	ENST00000576761	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.72	■■■■■ 4.59
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.7	■■■■■ 4.59
PITPNA-211	ENST00000576761	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.64	■■■■■ 4.58
PITPNA-211	ENST00000576761	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.62	■■■■■ 4.57
PITPNA-211	ENST00000576761	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.62	■■■■■ 4.57
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.59	■■■■■ 4.57
PITPNA-211	ENST00000576761	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.57	■■■■■ 4.57
PITPNA-211	ENST00000576761	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.56	■■■■■ 4.56
PITPNA-211	ENST00000576761	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.5	■■■■■ 4.55
PITPNA-211	ENST00000576761	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.49	■■■■■ 4.55
PITPNA-211	ENST00000576761	EEA1	Q15075	1411 aa		43.45	■■■■■ 4.55
PITPNA-211	ENST00000576761	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.38	■■■■■ 4.54
PITPNA-211	ENST00000576761	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.38	■■■■■ 4.53
PITPNA-211	ENST00000576761	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.37	■■■■■ 4.53
PITPNA-211	ENST00000576761	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.32	■■■■■ 4.52
PITPNA-211	ENST00000576761	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.3	■■■■■ 4.52
PITPNA-211	ENST00000576761	GLI2	P10070	1586 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCA8	O94911	1581 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PITPNA-211	ENST00000576761	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
PITPNA-211	ENST00000576761	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.5
PITPNA-211	ENST00000576761	KDM6B	O15054	1643 aa		43.12	■■■■■ 4.49
PITPNA-211	ENST00000576761	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PITPNA-211	ENST00000576761	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.1	■■■■■ 4.49
PITPNA-211	ENST00000576761	KIF21B	O75037	1637 aa		43.08	■■■■■ 4.49
PITPNA-211	ENST00000576761	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.07	■■■■■ 4.49
PITPNA-211	ENST00000576761	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PITPNA-211	ENST00000576761	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
PITPNA-211	ENST00000576761	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.02	■■■■■ 4.48
PITPNA-211	ENST00000576761	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
PITPNA-211	ENST00000576761	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PITPNA-211	ENST00000576761	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
PITPNA-211	ENST00000576761	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PITPNA-211	ENST00000576761	ATP10B	O94823	1461 aa		42.82	■■■■■ 4.45
PITPNA-211	ENST00000576761	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PITPNA-211	ENST00000576761	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PITPNA-211	ENST00000576761	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PITPNA-211	ENST00000576761	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PITPNA-211	ENST00000576761	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PITPNA-211	ENST00000576761	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PITPNA-211	ENST00000576761	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
PITPNA-211	ENST00000576761	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.69	■■■■■ 4.42
PITPNA-211	ENST00000576761	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
PITPNA-211	ENST00000576761	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PITPNA-211	ENST00000576761	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
PITPNA-211	ENST00000576761	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
PITPNA-211	ENST00000576761	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PITPNA-211	ENST00000576761	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PITPNA-211	ENST00000576761	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.41	■■■■■ 4.38
PITPNA-211	ENST00000576761	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PITPNA-211	ENST00000576761	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PITPNA-211	ENST00000576761	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.35	■■■■■ 4.37
PITPNA-211	ENST00000576761	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PITPNA-211	ENST00000576761	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PITPNA-211	ENST00000576761	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
PITPNA-211	ENST00000576761	NEO1	Q92859	1461 aa		42.27	■■■■■ 4.36
PITPNA-211	ENST00000576761	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PITPNA-211	ENST00000576761	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PITPNA-211	ENST00000576761	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.2	■■■■■ 4.35
PITPNA-211	ENST00000576761	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PITPNA-211	ENST00000576761	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.1	■■■■■ 4.33
PITPNA-211	ENST00000576761	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
PITPNA-211	ENST00000576761	FANCA	O15360	1455 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PITPNA-211	ENST00000576761	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PITPNA-211	ENST00000576761	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.03	■■■■■ 4.32
PITPNA-211	ENST00000576761	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PITPNA-211	ENST00000576761	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PITPNA-211	ENST00000576761	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
PITPNA-211	ENST00000576761	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.96	■■■■■ 4.31
PITPNA-211	ENST00000576761	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
PITPNA-211	ENST00000576761	CLIP1	P30622	1438 aa		41.95	■■■■■ 4.31
PITPNA-211	ENST00000576761	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PITPNA-211	ENST00000576761	PLCH2	O75038	1416 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PITPNA-211	ENST00000576761	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
PITPNA-211	ENST00000576761	KIF14	Q15058	1648 aa		41.93	■■■■■ 4.3
PITPNA-211	ENST00000576761	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.92	■■■■■ 4.3
PITPNA-211	ENST00000576761	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.9	■■■■■ 4.3
PITPNA-211	ENST00000576761	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.85	■■■■■ 4.29
PITPNA-211	ENST00000576761	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PITPNA-211	ENST00000576761	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.78	■■■■■ 4.28
PITPNA-211	ENST00000576761	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.78	■■■■■ 4.28
PITPNA-211	ENST00000576761	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.76	■■■■■ 4.28
PITPNA-211	ENST00000576761	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.7	■■■■■ 4.27

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