RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575009.5

SRRM2-222, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 5

Gene SRRM2, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-222	ENST00000575009	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.36	■■■■■ 4.69
SRRM2-222	ENST00000575009	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.34	■■■■■ 4.69
SRRM2-222	ENST00000575009	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.34	■■■■■ 4.69
SRRM2-222	ENST00000575009	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		44.27	■■■■■ 4.68
SRRM2-222	ENST00000575009	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.12	■■■■■ 4.65
SRRM2-222	ENST00000575009	PRX	Q9BXM0	1461 aa		44.08	■■■■■ 4.65
SRRM2-222	ENST00000575009	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		44.07	■■■■■ 4.65
SRRM2-222	ENST00000575009	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.97	■■■■■ 4.63
SRRM2-222	ENST00000575009	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.95	■■■■■ 4.63
SRRM2-222	ENST00000575009	EEA1	Q15075	1411 aa		43.9	■■■■■ 4.62
SRRM2-222	ENST00000575009	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.89	■■■■■ 4.62
SRRM2-222	ENST00000575009	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	43.88	■■■■■ 4.62
SRRM2-222	ENST00000575009	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.84	■■■■■ 4.61
SRRM2-222	ENST00000575009	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.84	■■■■■ 4.61
SRRM2-222	ENST00000575009	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.83	■■■■■ 4.61
SRRM2-222	ENST00000575009	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.79	■■■■■ 4.6
SRRM2-222	ENST00000575009	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.77	■■■■■ 4.6
SRRM2-222	ENST00000575009	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.75	■■■■■ 4.59
SRRM2-222	ENST00000575009	PTPRG	P23470	1445 aa		43.74	■■■■■ 4.59
SRRM2-222	ENST00000575009	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.73	■■■■■ 4.59
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF21B	O75037	1637 aa		43.59	■■■■■ 4.57
SRRM2-222	ENST00000575009	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.52	■■■■■ 4.56
SRRM2-222	ENST00000575009	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.51	■■■■■ 4.56
SRRM2-222	ENST00000575009	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.46	■■■■■ 4.55
SRRM2-222	ENST00000575009	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.45	■■■■■ 4.55
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.43	■■■■■ 4.54
SRRM2-222	ENST00000575009	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.42	■■■■■ 4.54
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.42	■■■■■ 4.54
SRRM2-222	ENST00000575009	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.41	■■■■■ 4.54
SRRM2-222	ENST00000575009	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.36	■■■■■ 4.53
SRRM2-222	ENST00000575009	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.35	■■■■■ 4.53
SRRM2-222	ENST00000575009	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.32	■■■■■ 4.53
SRRM2-222	ENST00000575009	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.28	■■■■■ 4.52
SRRM2-222	ENST00000575009	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.27	■■■■■ 4.52
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCA8	O94911	1581 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SRRM2-222	ENST00000575009	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.23	■■■■■ 4.51
SRRM2-222	ENST00000575009	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.23	■■■■■ 4.51
SRRM2-222	ENST00000575009	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SRRM2-222	ENST00000575009	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.18	■■■■■ 4.5
SRRM2-222	ENST00000575009	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SRRM2-222	ENST00000575009	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SRRM2-222	ENST00000575009	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SRRM2-222	ENST00000575009	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43	■■■■■ 4.47
SRRM2-222	ENST00000575009	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SRRM2-222	ENST00000575009	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SRRM2-222	ENST00000575009	GLI2	P10070	1586 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SRRM2-222	ENST00000575009	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
SRRM2-222	ENST00000575009	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SRRM2-222	ENST00000575009	ATP10B	O94823	1461 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SRRM2-222	ENST00000575009	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SRRM2-222	ENST00000575009	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
SRRM2-222	ENST00000575009	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.81	■■■■■ 4.44
SRRM2-222	ENST00000575009	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SRRM2-222	ENST00000575009	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SRRM2-222	ENST00000575009	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
SRRM2-222	ENST00000575009	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
SRRM2-222	ENST00000575009	KDM6B	O15054	1643 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SRRM2-222	ENST00000575009	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SRRM2-222	ENST00000575009	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SRRM2-222	ENST00000575009	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
SRRM2-222	ENST00000575009	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.53	■■■■■ 4.4
SRRM2-222	ENST00000575009	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SRRM2-222	ENST00000575009	CLIP1	P30622	1438 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SRRM2-222	ENST00000575009	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
SRRM2-222	ENST00000575009	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SRRM2-222	ENST00000575009	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SRRM2-222	ENST00000575009	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.43	■■■■■ 4.38
SRRM2-222	ENST00000575009	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
SRRM2-222	ENST00000575009	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SRRM2-222	ENST00000575009	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
SRRM2-222	ENST00000575009	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.33	■■■■■ 4.37
SRRM2-222	ENST00000575009	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SRRM2-222	ENST00000575009	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.28	■■■■■ 4.36
SRRM2-222	ENST00000575009	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.25	■■■■■ 4.35	9e-17	■□□□□ 9.3
SRRM2-222	ENST00000575009	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SRRM2-222	ENST00000575009	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SRRM2-222	ENST00000575009	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF14	Q15058	1648 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SRRM2-222	ENST00000575009	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
SRRM2-222	ENST00000575009	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
SRRM2-222	ENST00000575009	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SRRM2-222	ENST00000575009	NEO1	Q92859	1461 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SRRM2-222	ENST00000575009	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42	■■■■■ 4.31
SRRM2-222	ENST00000575009	FANCA	O15360	1455 aa		41.99	■■■■■ 4.31
SRRM2-222	ENST00000575009	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.98	■■■■■ 4.31
SRRM2-222	ENST00000575009	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SRRM2-222	ENST00000575009	PLCH2	O75038	1416 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SRRM2-222	ENST00000575009	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SRRM2-222	ENST00000575009	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SRRM2-222	ENST00000575009	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SRRM2-222	ENST00000575009	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.82	■■■■■ 4.29
SRRM2-222	ENST00000575009	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SRRM2-222	ENST00000575009	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
SRRM2-222	ENST00000575009	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.79	■■■■■ 4.28
SRRM2-222	ENST00000575009	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
SRRM2-222	ENST00000575009	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SRRM2-222	ENST00000575009	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SRRM2-222	ENST00000575009	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.76	■■■■■ 4.28

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