RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574899.1

PHF23-211, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-211ENST00000574899 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
PHF23-211ENST00000574899 JPH4Q96JJ6 628 aa40.19■■■■■ 4.02
PHF23-211ENST00000574899 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.1■■■■■ 4.01
PHF23-211ENST00000574899 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.06■■■■■ 4
PHF23-211ENST00000574899 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.8■■■■□ 3.96
PHF23-211ENST00000574899 IQGAP2Q13576 1575 aa39.79■■■■□ 3.96
PHF23-211ENST00000574899 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.76■■■■□ 3.96
PHF23-211ENST00000574899 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.69■■■■□ 3.94
PHF23-211ENST00000574899 DISP1Q96F81 1524 aa39.6■■■■□ 3.93
PHF23-211ENST00000574899 PTPRGP23470 1445 aa39.59■■■■□ 3.93
PHF23-211ENST00000574899 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.59■■■■□ 3.93
PHF23-211ENST00000574899 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PHF23-211ENST00000574899 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.57■■■■□ 3.92
PHF23-211ENST00000574899 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.56■■■■□ 3.92
PHF23-211ENST00000574899 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.55■■■■□ 3.92
PHF23-211ENST00000574899 PRXQ9BXM0 1461 aa39.54■■■■□ 3.92
PHF23-211ENST00000574899 MAPKBP1O60336 1514 aa39.54■■■■□ 3.92
PHF23-211ENST00000574899 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.91
PHF23-211ENST00000574899 KIAA0556O60303 1618 aa39.46■■■■□ 3.91
PHF23-211ENST00000574899 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.44■■■■□ 3.9
PHF23-211ENST00000574899 DIP2BQ9P265 1576 aa39.42■■■■□ 3.9
PHF23-211ENST00000574899 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.36■■■■□ 3.89
PHF23-211ENST00000574899 ABCC2Q92887 1545 aa39.35■■■■□ 3.89
PHF23-211ENST00000574899 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.33■■■■□ 3.89
PHF23-211ENST00000574899 UACAQ9BZF9 1416 aa39.32■■■■□ 3.89
PHF23-211ENST00000574899 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.28■■■■□ 3.88
PHF23-211ENST00000574899 TSPOAP1O95153 1857 aa39.21■■■■□ 3.87
PHF23-211ENST00000574899 GOLGA3Q08378 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
PHF23-211ENST00000574899 ASXL2Q76L83 1435 aa39.18■■■■□ 3.86
PHF23-211ENST00000574899 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.16■■■■□ 3.86
PHF23-211ENST00000574899 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
PHF23-211ENST00000574899 EEA1Q15075 1411 aa39.15■■■■□ 3.86
PHF23-211ENST00000574899 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.13■■■■□ 3.85
PHF23-211ENST00000574899 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PHF23-211ENST00000574899 ABCA8O94911 1581 aa39.08■■■■□ 3.85
PHF23-211ENST00000574899 GLI2P10070 1586 aa39.04■■■■□ 3.84
PHF23-211ENST00000574899 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.03■■■■□ 3.84
PHF23-211ENST00000574899 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
PHF23-211ENST00000574899 SAMD9Q5K651 1589 aa38.99■■■■□ 3.83
PHF23-211ENST00000574899 P3H3Q8IVL6 736 aa38.99■■■■□ 3.83
PHF23-211ENST00000574899 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
PHF23-211ENST00000574899 KDM6BO15054 1643 aa38.93■■■■□ 3.82
PHF23-211ENST00000574899 KIF21BO75037 1637 aa38.93■■■■□ 3.82
PHF23-211ENST00000574899 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.89■■■■□ 3.82
PHF23-211ENST00000574899 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.86■■■■□ 3.81
PHF23-211ENST00000574899 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
PHF23-211ENST00000574899 ARID3CA6NKF2 412 aa38.76■■■■□ 3.8
PHF23-211ENST00000574899 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.74■■■■□ 3.79
PHF23-211ENST00000574899 ATP10BO94823 1461 aa38.73■■■■□ 3.79
PHF23-211ENST00000574899 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.72■■■■□ 3.79
PHF23-211ENST00000574899 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.71■■■■□ 3.79
PHF23-211ENST00000574899 KCNH8Q96L42 1107 aa38.67■■■■□ 3.78
PHF23-211ENST00000574899 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
PHF23-211ENST00000574899 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.64■■■■□ 3.78
PHF23-211ENST00000574899 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
PHF23-211ENST00000574899 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.6■■■■□ 3.77
PHF23-211ENST00000574899 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.6■■■■□ 3.77
PHF23-211ENST00000574899 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
PHF23-211ENST00000574899 CD109Q6YHK3 1445 aa38.56■■■■□ 3.76
PHF23-211ENST00000574899 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
PHF23-211ENST00000574899 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.52■■■■□ 3.76
PHF23-211ENST00000574899 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.45■■■■□ 3.75
PHF23-211ENST00000574899 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
PHF23-211ENST00000574899 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
PHF23-211ENST00000574899 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.4■■■■□ 3.74
PHF23-211ENST00000574899 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.35■■■■□ 3.73
PHF23-211ENST00000574899 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
PHF23-211ENST00000574899 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.21■■■■□ 3.71
PHF23-211ENST00000574899 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.21■■■■□ 3.71
PHF23-211ENST00000574899 FMN1Q68DA7 1419 aa38.21■■■■□ 3.71
PHF23-211ENST00000574899 HECW1Q76N89 1606 aa38.18■■■■□ 3.7
PHF23-211ENST00000574899 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.16■■■■□ 3.7
PHF23-211ENST00000574899 ADGRL1O94910 1474 aa38.15■■■■□ 3.7
PHF23-211ENST00000574899 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.15■■■■□ 3.7
PHF23-211ENST00000574899 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.14■■■■□ 3.7
PHF23-211ENST00000574899 NEO1Q92859 1461 aa38.11■■■■□ 3.69
PHF23-211ENST00000574899 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
PHF23-211ENST00000574899 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.06■■■■□ 3.68
PHF23-211ENST00000574899 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.05■■■■□ 3.68
PHF23-211ENST00000574899 RAPGEF3O95398 923 aa38.02■■■■□ 3.68
PHF23-211ENST00000574899 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
PHF23-211ENST00000574899 KIF14Q15058 1648 aa37.96■■■■□ 3.67
PHF23-211ENST00000574899 FANCAO15360 1455 aa37.96■■■■□ 3.67
PHF23-211ENST00000574899 AKNAQ7Z591 1439 aa37.94■■■■□ 3.66
PHF23-211ENST00000574899 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.93■■■■□ 3.66
PHF23-211ENST00000574899 RICTORQ6R327 1708 aa37.93■■■■□ 3.66
PHF23-211ENST00000574899 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.9■■■■□ 3.66
PHF23-211ENST00000574899 CLIP1P30622 1438 aa37.89■■■■□ 3.66
PHF23-211ENST00000574899 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
PHF23-211ENST00000574899 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.87■■■■□ 3.65
PHF23-211ENST00000574899 PLCH2O75038 1416 aa37.86■■■■□ 3.65
PHF23-211ENST00000574899 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
PHF23-211ENST00000574899 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
PHF23-211ENST00000574899 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.77■■■■□ 3.64
PHF23-211ENST00000574899 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.77■■■■□ 3.64
PHF23-211ENST00000574899 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.75■■■■□ 3.63
PHF23-211ENST00000574899 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.71■■■■□ 3.63
PHF23-211ENST00000574899 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.7■■■■□ 3.63
PHF23-211ENST00000574899 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.7■■■■□ 3.63
PHF23-211ENST00000574899 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 198.8 ms