RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574007.5

P4HB-218, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene P4HB, Length 1,053 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HB-218ENST00000574007 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
P4HB-218ENST00000574007 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.94■■□□□ 1.42
P4HB-218ENST00000574007 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
P4HB-218ENST00000574007 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.89■■□□□ 1.42
P4HB-218ENST00000574007 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
P4HB-218ENST00000574007 IQGAP2Q13576 1575 aa23.73■■□□□ 1.39
P4HB-218ENST00000574007 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.65■■□□□ 1.38
P4HB-218ENST00000574007 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.63■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 PTPRGP23470 1445 aa23.61■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.6■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 PRXQ9BXM0 1461 aa23.59■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.59■■□□□ 1.37
P4HB-218ENST00000574007 DISP1Q96F81 1524 aa23.58■■□□□ 1.36
P4HB-218ENST00000574007 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.58■■□□□ 1.36
P4HB-218ENST00000574007 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.54■■□□□ 1.36
P4HB-218ENST00000574007 MAPKBP1O60336 1514 aa23.52■■□□□ 1.36
P4HB-218ENST00000574007 KIAA0556O60303 1618 aa23.51■■□□□ 1.35
P4HB-218ENST00000574007 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.49■■□□□ 1.35
P4HB-218ENST00000574007 EEA1Q15075 1411 aa23.46■■□□□ 1.35
P4HB-218ENST00000574007 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.46■■□□□ 1.35
P4HB-218ENST00000574007 ABCC2Q92887 1545 aa23.44■■□□□ 1.34
P4HB-218ENST00000574007 UACAQ9BZF9 1416 aa23.44■■□□□ 1.34
P4HB-218ENST00000574007 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.44■■□□□ 1.34
P4HB-218ENST00000574007 DIP2BQ9P265 1576 aa23.43■■□□□ 1.34
P4HB-218ENST00000574007 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.43■■□□□ 1.34
P4HB-218ENST00000574007 GOLGA3Q08378 1498 aa23.42■■□□□ 1.34
P4HB-218ENST00000574007 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
P4HB-218ENST00000574007 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.37■■□□□ 1.33
P4HB-218ENST00000574007 ASXL2Q76L83 1435 aa23.33■■□□□ 1.33
P4HB-218ENST00000574007 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.32
P4HB-218ENST00000574007 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.31■■□□□ 1.32
P4HB-218ENST00000574007 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
P4HB-218ENST00000574007 TSPOAP1O95153 1857 aa23.3■■□□□ 1.32
P4HB-218ENST00000574007 ABCA8O94911 1581 aa23.27■■□□□ 1.32
P4HB-218ENST00000574007 P3H3Q8IVL6 736 aa23.27■■□□□ 1.32
P4HB-218ENST00000574007 KIF21BO75037 1637 aa23.26■■□□□ 1.31
P4HB-218ENST00000574007 SAMD9Q5K651 1589 aa23.24■■□□□ 1.31
P4HB-218ENST00000574007 GLI2P10070 1586 aa23.23■■□□□ 1.31
P4HB-218ENST00000574007 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
P4HB-218ENST00000574007 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
P4HB-218ENST00000574007 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.16■■□□□ 1.3
P4HB-218ENST00000574007 KDM6BO15054 1643 aa23.15■■□□□ 1.3
P4HB-218ENST00000574007 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.14■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.11■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.1■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 ARID3CA6NKF2 412 aa23.1■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.09■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
P4HB-218ENST00000574007 ATP10BO94823 1461 aa23.07■■□□□ 1.28
P4HB-218ENST00000574007 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.07■■□□□ 1.28
P4HB-218ENST00000574007 KCNH8Q96L42 1107 aa23.06■■□□□ 1.28
P4HB-218ENST00000574007 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.02■■□□□ 1.28
P4HB-218ENST00000574007 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.01■■□□□ 1.27
P4HB-218ENST00000574007 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
P4HB-218ENST00000574007 CD109Q6YHK3 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
P4HB-218ENST00000574007 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
P4HB-218ENST00000574007 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
P4HB-218ENST00000574007 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
P4HB-218ENST00000574007 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.94■■□□□ 1.26
P4HB-218ENST00000574007 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
P4HB-218ENST00000574007 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.92■■□□□ 1.26
P4HB-218ENST00000574007 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.89■■□□□ 1.25
P4HB-218ENST00000574007 FMN1Q68DA7 1419 aa22.85■■□□□ 1.25
P4HB-218ENST00000574007 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.83■■□□□ 1.25
P4HB-218ENST00000574007 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
P4HB-218ENST00000574007 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
P4HB-218ENST00000574007 HECW1Q76N89 1606 aa22.8■■□□□ 1.24
P4HB-218ENST00000574007 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.75■■□□□ 1.23
P4HB-218ENST00000574007 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.74■■□□□ 1.23
P4HB-218ENST00000574007 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.73■■□□□ 1.23
P4HB-218ENST00000574007 NEO1Q92859 1461 aa22.73■■□□□ 1.23
P4HB-218ENST00000574007 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
P4HB-218ENST00000574007 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.71■■□□□ 1.23
P4HB-218ENST00000574007 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.7■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 CLIP1P30622 1438 aa22.68■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 ADGRL1O94910 1474 aa22.66■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.65■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.64■■□□□ 1.22
P4HB-218ENST00000574007 RAPGEF3O95398 923 aa22.64■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 FANCAO15360 1455 aa22.63■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.61■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 AKNAQ7Z591 1439 aa22.61■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 KIF14Q15058 1648 aa22.6■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.59■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.58■■□□□ 1.21
P4HB-218ENST00000574007 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
P4HB-218ENST00000574007 PLCH2O75038 1416 aa22.57■■□□□ 1.2
P4HB-218ENST00000574007 RICTORQ6R327 1708 aa22.56■■□□□ 1.2
P4HB-218ENST00000574007 CEP162Q5TB80 1403 aa22.5■■□□□ 1.19
P4HB-218ENST00000574007 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.5■■□□□ 1.19
P4HB-218ENST00000574007 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.48■■□□□ 1.19
P4HB-218ENST00000574007 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.47■■□□□ 1.19
P4HB-218ENST00000574007 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.47■■□□□ 1.19
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