RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572304.1

MINK1-206, Transcript of misshapen like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene MINK1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINK1-206ENST00000572304 SHROOM2Q13796 1616 aa24.14■■□□□ 1.46
MINK1-206ENST00000572304 ARHGEF11O15085 1522 aa24.14■■□□□ 1.45
MINK1-206ENST00000572304 JPH4Q96JJ6 628 aa24.13■■□□□ 1.45
MINK1-206ENST00000572304 IQGAP2Q13576 1575 aa24.1■■□□□ 1.45
MINK1-206ENST00000572304 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.08■■□□□ 1.45
MINK1-206ENST00000572304 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.08■■□□□ 1.45
MINK1-206ENST00000572304 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.08■■□□□ 1.45
MINK1-206ENST00000572304 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.05■■□□□ 1.44
MINK1-206ENST00000572304 GOLGA3Q08378 1498 aa24.05■■□□□ 1.44
MINK1-206ENST00000572304 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
MINK1-206ENST00000572304 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24■■□□□ 1.43
MINK1-206ENST00000572304 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.97■■□□□ 1.43
MINK1-206ENST00000572304 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.95■■□□□ 1.43
MINK1-206ENST00000572304 ARAP1Q96P48 1450 aa23.95■■□□□ 1.42
MINK1-206ENST00000572304 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
MINK1-206ENST00000572304 DISP1Q96F81 1524 aa23.91■■□□□ 1.42
MINK1-206ENST00000572304 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.88■■□□□ 1.41
MINK1-206ENST00000572304 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.86■■□□□ 1.41
MINK1-206ENST00000572304 KIAA0556O60303 1618 aa23.85■■□□□ 1.41
MINK1-206ENST00000572304 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
MINK1-206ENST00000572304 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.84■■□□□ 1.41
MINK1-206ENST00000572304 PTPRGP23470 1445 aa23.82■■□□□ 1.4
MINK1-206ENST00000572304 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
MINK1-206ENST00000572304 SAMD9Q5K651 1589 aa23.8■■□□□ 1.4
MINK1-206ENST00000572304 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.79■■□□□ 1.4
MINK1-206ENST00000572304 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 P3H3Q8IVL6 736 aa23.67■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 UACAQ9BZF9 1416 aa23.67■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.66■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.66■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.66■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
MINK1-206ENST00000572304 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.63■■□□□ 1.37
MINK1-206ENST00000572304 CLIP1P30622 1438 aa23.62■■□□□ 1.37
MINK1-206ENST00000572304 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.62■■□□□ 1.37
MINK1-206ENST00000572304 ABCC2Q92887 1545 aa23.61■■□□□ 1.37
MINK1-206ENST00000572304 ABCA8O94911 1581 aa23.59■■□□□ 1.37
MINK1-206ENST00000572304 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.58■■□□□ 1.37
MINK1-206ENST00000572304 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
MINK1-206ENST00000572304 CEP162Q5TB80 1403 aa23.57■■□□□ 1.36
MINK1-206ENST00000572304 FMN1Q68DA7 1419 aa23.57■■□□□ 1.36
MINK1-206ENST00000572304 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.53■■□□□ 1.36
MINK1-206ENST00000572304 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.5■■□□□ 1.35
MINK1-206ENST00000572304 MAPKBP1O60336 1514 aa23.48■■□□□ 1.35
MINK1-206ENST00000572304 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MINK1-206ENST00000572304 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
MINK1-206ENST00000572304 ATP10BO94823 1461 aa23.4■■□□□ 1.34
MINK1-206ENST00000572304 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.4■■□□□ 1.34
MINK1-206ENST00000572304 HECW1Q76N89 1606 aa23.38■■□□□ 1.33
MINK1-206ENST00000572304 ASXL2Q76L83 1435 aa23.37■■□□□ 1.33
MINK1-206ENST00000572304 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.36■■□□□ 1.33
MINK1-206ENST00000572304 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.32■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.31■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 ARID3CA6NKF2 412 aa23.29■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.29■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.29■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
MINK1-206ENST00000572304 DIP2BQ9P265 1576 aa23.26■■□□□ 1.31
MINK1-206ENST00000572304 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
MINK1-206ENST00000572304 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.25■■□□□ 1.31
MINK1-206ENST00000572304 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
MINK1-206ENST00000572304 GLI2P10070 1586 aa23.23■■□□□ 1.31
MINK1-206ENST00000572304 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.23■■□□□ 1.31
MINK1-206ENST00000572304 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.2■■□□□ 1.3
MINK1-206ENST00000572304 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.19■■□□□ 1.3
MINK1-206ENST00000572304 KCNH8Q96L42 1107 aa23.16■■□□□ 1.3
MINK1-206ENST00000572304 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
MINK1-206ENST00000572304 MAP3K1Q13233 1512 aa23.11■■□□□ 1.29
MINK1-206ENST00000572304 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.09■■□□□ 1.29
MINK1-206ENST00000572304 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.09■■□□□ 1.29
MINK1-206ENST00000572304 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.09■■□□□ 1.29
MINK1-206ENST00000572304 CD109Q6YHK3 1445 aa23.07■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 TIAM1Q13009 1591 aa23.06■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.05■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 KIF14Q15058 1648 aa23.04■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.04■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 APLP2Q06481 763 aa23.03■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.02■■□□□ 1.28
MINK1-206ENST00000572304 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.01■■□□□ 1.27
MINK1-206ENST00000572304 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.97■■□□□ 1.27
MINK1-206ENST00000572304 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MINK1-206ENST00000572304 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.97■■□□□ 1.27
MINK1-206ENST00000572304 TSPOAP1O95153 1857 aa22.96■■□□□ 1.27
MINK1-206ENST00000572304 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.95■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.95■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 PLCH2O75038 1416 aa22.94■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 NEO1Q92859 1461 aa22.92■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.89■■□□□ 1.26
MINK1-206ENST00000572304 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MINK1-206ENST00000572304 FANCAO15360 1455 aa22.87■■□□□ 1.25
MINK1-206ENST00000572304 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.87■■□□□ 1.25
MINK1-206ENST00000572304 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.86■■□□□ 1.25
MINK1-206ENST00000572304 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms