RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 FBLN2P98095 1184 aa29.1■■■□□ 2.25
SPNS2-202ENST00000570641 CEP162Q5TB80 1403 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS2-202ENST00000570641 NUP160Q12769 1436 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS2-202ENST00000570641 CEP170Q5SW79 1584 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS2-202ENST00000570641 IQGAP2Q13576 1575 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS2-202ENST00000570641 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS2-202ENST00000570641 CLIP1P30622 1438 aa28.94■■■□□ 2.22
SPNS2-202ENST00000570641 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SPNS2-202ENST00000570641 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.85■■■□□ 2.21
SPNS2-202ENST00000570641 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.83■■■□□ 2.21
SPNS2-202ENST00000570641 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.8■■■□□ 2.2
SPNS2-202ENST00000570641 SAMD9Q5K651 1589 aa28.79■■■□□ 2.2
SPNS2-202ENST00000570641 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.78■■■□□ 2.2
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SPNS2-202ENST00000570641 SHROOM2Q13796 1616 aa28.72■■■□□ 2.19
SPNS2-202ENST00000570641 ARAP1Q96P48 1450 aa28.72■■■□□ 2.19
SPNS2-202ENST00000570641 OSCARQ8IYS5 282 aa28.71■■■□□ 2.19
SPNS2-202ENST00000570641 KIAA0556O60303 1618 aa28.68■■■□□ 2.18
SPNS2-202ENST00000570641 DISP1Q96F81 1524 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS2-202ENST00000570641 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS2-202ENST00000570641 P3H3Q8IVL6 736 aa28.64■■■□□ 2.18
SPNS2-202ENST00000570641 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.63■■■□□ 2.17
SPNS2-202ENST00000570641 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.63■■■□□ 2.17
SPNS2-202ENST00000570641 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SPNS2-202ENST00000570641 FMN1Q68DA7 1419 aa28.55■■■□□ 2.16
SPNS2-202ENST00000570641 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.45■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS2-202ENST00000570641 PTPRGP23470 1445 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS2-202ENST00000570641 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SPNS2-202ENST00000570641 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS2-202ENST00000570641 HECW1Q76N89 1606 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS2-202ENST00000570641 APLP2Q06481 763 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS2-202ENST00000570641 ABCA8O94911 1581 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS2-202ENST00000570641 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SPNS2-202ENST00000570641 MAP3K1Q13233 1512 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS2-202ENST00000570641 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS2-202ENST00000570641 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.26■■■□□ 2.12
SPNS2-202ENST00000570641 ARHGEF11O15085 1522 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS2-202ENST00000570641 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS2-202ENST00000570641 TIAM1Q13009 1591 aa28.24■■■□□ 2.11
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.23■■■□□ 2.11
SPNS2-202ENST00000570641 UACAQ9BZF9 1416 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS2-202ENST00000570641 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SPNS2-202ENST00000570641 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SPNS2-202ENST00000570641 ABCC2Q92887 1545 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS2-202ENST00000570641 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.15■■■□□ 2.1
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SPNS2-202ENST00000570641 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.06■■■□□ 2.08
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SPNS2-202ENST00000570641 ATP10BO94823 1461 aa28.05■■■□□ 2.08
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SPNS2-202ENST00000570641 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.02■■■□□ 2.08
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SPNS2-202ENST00000570641 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28■■■□□ 2.07
SPNS2-202ENST00000570641 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SPNS2-202ENST00000570641 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SPNS2-202ENST00000570641 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.97■■■□□ 2.07
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SPNS2-202ENST00000570641 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
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SPNS2-202ENST00000570641 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.7■■■□□ 2.03
SPNS2-202ENST00000570641 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.7■■■□□ 2.02
SPNS2-202ENST00000570641 MAPKBP1O60336 1514 aa27.7■■■□□ 2.02
SPNS2-202ENST00000570641 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.68■■■□□ 2.02
SPNS2-202ENST00000570641 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.68■■■□□ 2.02
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SPNS2-202ENST00000570641 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.64■■■□□ 2.01
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SPNS2-202ENST00000570641 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
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SPNS2-202ENST00000570641 MIA2Q96PC5 1412 aa27.61■■■□□ 2.01
SPNS2-202ENST00000570641 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.61■■■□□ 2.01
SPNS2-202ENST00000570641 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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SPNS2-202ENST00000570641 PREX2Q70Z35 1606 aa27.57■■■□□ 2
SPNS2-202ENST00000570641 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.57■■■□□ 2
SPNS2-202ENST00000570641 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.54■■■□□ 2
SPNS2-202ENST00000570641 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
SPNS2-202ENST00000570641 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.54■■■□□ 2
SPNS2-202ENST00000570641 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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