RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568621.1

PLEKHG4-214, Transcript of pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4, humanhuman

TSL 3

Gene PLEKHG4, Length 514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4-214ENST00000568621 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.65■■■■■ 4.26
PLEKHG4-214ENST00000568621 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.63■■■■■ 4.25
PLEKHG4-214ENST00000568621 SHROOM2Q13796 1616 aa41.62■■■■■ 4.25
PLEKHG4-214ENST00000568621 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
PLEKHG4-214ENST00000568621 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.52■■■■■ 4.24
PLEKHG4-214ENST00000568621 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.52■■■■■ 4.24
PLEKHG4-214ENST00000568621 EEA1Q15075 1411 aa41.48■■■■■ 4.23
PLEKHG4-214ENST00000568621 PRXQ9BXM0 1461 aa41.47■■■■■ 4.23
PLEKHG4-214ENST00000568621 IQGAP2Q13576 1575 aa41.3■■■■■ 4.2
PLEKHG4-214ENST00000568621 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
PLEKHG4-214ENST00000568621 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.25■■■■■ 4.19
PLEKHG4-214ENST00000568621 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.13■■■■■ 4.18
PLEKHG4-214ENST00000568621 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.12■■■■■ 4.17
PLEKHG4-214ENST00000568621 PTPRGP23470 1445 aa41.11■■■■■ 4.17
PLEKHG4-214ENST00000568621 DISP1Q96F81 1524 aa41.07■■■■■ 4.16
PLEKHG4-214ENST00000568621 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
PLEKHG4-214ENST00000568621 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.01■■■■■ 4.16
PLEKHG4-214ENST00000568621 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PLEKHG4-214ENST00000568621 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
PLEKHG4-214ENST00000568621 GOLGA3Q08378 1498 aa40.95■■■■■ 4.15
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIF21BO75037 1637 aa40.91■■■■■ 4.14
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIAA0556O60303 1618 aa40.89■■■■■ 4.14
PLEKHG4-214ENST00000568621 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.81■■■■■ 4.12
PLEKHG4-214ENST00000568621 UACAQ9BZF9 1416 aa40.8■■■■■ 4.12
PLEKHG4-214ENST00000568621 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
PLEKHG4-214ENST00000568621 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.75■■■■■ 4.11
PLEKHG4-214ENST00000568621 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.72■■■■■ 4.11
PLEKHG4-214ENST00000568621 P3H3Q8IVL6 736 aa40.71■■■■■ 4.11
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCC2Q92887 1545 aa40.68■■■■■ 4.1
PLEKHG4-214ENST00000568621 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PLEKHG4-214ENST00000568621 MAPKBP1O60336 1514 aa40.64■■■■■ 4.1
PLEKHG4-214ENST00000568621 SAMD9Q5K651 1589 aa40.59■■■■■ 4.09
PLEKHG4-214ENST00000568621 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.57■■■■■ 4.08
PLEKHG4-214ENST00000568621 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.53■■■■■ 4.08
PLEKHG4-214ENST00000568621 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.52■■■■■ 4.08
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.51■■■■■ 4.08
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCA8O94911 1581 aa40.49■■■■■ 4.07
PLEKHG4-214ENST00000568621 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.46■■■■■ 4.07
PLEKHG4-214ENST00000568621 ASXL2Q76L83 1435 aa40.44■■■■■ 4.06
PLEKHG4-214ENST00000568621 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.42■■■■■ 4.06
PLEKHG4-214ENST00000568621 DIP2BQ9P265 1576 aa40.33■■■■■ 4.05
PLEKHG4-214ENST00000568621 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.31■■■■■ 4.04
PLEKHG4-214ENST00000568621 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.26■■■■■ 4.04
PLEKHG4-214ENST00000568621 ATP10BO94823 1461 aa40.24■■■■■ 4.03
PLEKHG4-214ENST00000568621 ARID3CA6NKF2 412 aa40.23■■■■■ 4.03
PLEKHG4-214ENST00000568621 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.22■■■■■ 4.03
PLEKHG4-214ENST00000568621 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.2■■■■■ 4.03
PLEKHG4-214ENST00000568621 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 GLI2P10070 1586 aa40.18■■■■■ 4.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 FMN1Q68DA7 1419 aa40.16■■■■■ 4.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PLEKHG4-214ENST00000568621 KCNH8Q96L42 1107 aa40.12■■■■■ 4.01
PLEKHG4-214ENST00000568621 CLIP1P30622 1438 aa40.04■■■■■ 4
PLEKHG4-214ENST00000568621 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40■■■■□ 3.99
PLEKHG4-214ENST00000568621 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
PLEKHG4-214ENST00000568621 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.95■■■■□ 3.99
PLEKHG4-214ENST00000568621 TSPOAP1O95153 1857 aa39.91■■■■□ 3.98
PLEKHG4-214ENST00000568621 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.91■■■■□ 3.98
PLEKHG4-214ENST00000568621 CD109Q6YHK3 1445 aa39.91■■■■□ 3.98
PLEKHG4-214ENST00000568621 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.86■■■■□ 3.97
PLEKHG4-214ENST00000568621 HECW1Q76N89 1606 aa39.85■■■■□ 3.97
PLEKHG4-214ENST00000568621 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
PLEKHG4-214ENST00000568621 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.82■■■■□ 3.97
PLEKHG4-214ENST00000568621 CEP162Q5TB80 1403 aa39.81■■■■□ 3.96
PLEKHG4-214ENST00000568621 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.81■■■■□ 3.96
PLEKHG4-214ENST00000568621 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
PLEKHG4-214ENST00000568621 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
PLEKHG4-214ENST00000568621 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.78■■■■□ 3.96
PLEKHG4-214ENST00000568621 KDM6BO15054 1643 aa39.73■■■■□ 3.95
PLEKHG4-214ENST00000568621 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.71■■■■□ 3.95
PLEKHG4-214ENST00000568621 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.67■■■■□ 3.94
PLEKHG4-214ENST00000568621 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
PLEKHG4-214ENST00000568621 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.65■■■■□ 3.94
PLEKHG4-214ENST00000568621 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.6■■■■□ 3.93
PLEKHG4-214ENST00000568621 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
PLEKHG4-214ENST00000568621 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PLEKHG4-214ENST00000568621 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.924e-6■■■□□ 15.9
PLEKHG4-214ENST00000568621 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.5■■■■□ 3.91
PLEKHG4-214ENST00000568621 NEO1Q92859 1461 aa39.49■■■■□ 3.91
PLEKHG4-214ENST00000568621 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.46■■■■□ 3.91
PLEKHG4-214ENST00000568621 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.42■■■■□ 3.9
PLEKHG4-214ENST00000568621 PLCH2O75038 1416 aa39.42■■■■□ 3.9
PLEKHG4-214ENST00000568621 KIF14Q15058 1648 aa39.39■■■■□ 3.9
PLEKHG4-214ENST00000568621 FANCAO15360 1455 aa39.37■■■■□ 3.89
PLEKHG4-214ENST00000568621 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.36■■■■□ 3.89
PLEKHG4-214ENST00000568621 AKNAQ7Z591 1439 aa39.35■■■■□ 3.89
PLEKHG4-214ENST00000568621 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.35■■■■□ 3.89
PLEKHG4-214ENST00000568621 RAPGEF3O95398 923 aa39.3■■■■□ 3.88
PLEKHG4-214ENST00000568621 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.29■■■■□ 3.88
PLEKHG4-214ENST00000568621 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.27■■■■□ 3.88
PLEKHG4-214ENST00000568621 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
PLEKHG4-214ENST00000568621 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.19■■■■□ 3.86
PLEKHG4-214ENST00000568621 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.16■■■■□ 3.86
PLEKHG4-214ENST00000568621 ADGRL1O94910 1474 aa39.16■■■■□ 3.86
PLEKHG4-214ENST00000568621 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.15■■■■□ 3.86
PLEKHG4-214ENST00000568621 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.09■■■■□ 3.85
PLEKHG4-214ENST00000568621 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.08■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms