RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 CUL7Q14999 1698 aa27.33■■□□□ 1.97
NME3-211ENST00000568561 KIF27Q86VH2 1401 aa27.31■■□□□ 1.96
NME3-211ENST00000568561 IGF1RP08069 1367 aa27.3■■□□□ 1.96
NME3-211ENST00000568561 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.26■■□□□ 1.95
NME3-211ENST00000568561 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.25■■□□□ 1.95
NME3-211ENST00000568561 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
NME3-211ENST00000568561 MAPKBP1O60336 1514 aa27.17■■□□□ 1.94
NME3-211ENST00000568561 DIP2BQ9P265 1576 aa27.16■■□□□ 1.94
NME3-211ENST00000568561 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.15■■□□□ 1.94
NME3-211ENST00000568561 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
NME3-211ENST00000568561 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.12■■□□□ 1.93
NME3-211ENST00000568561 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.11■■□□□ 1.93
NME3-211ENST00000568561 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NME3-211ENST00000568561 IQGAP2Q13576 1575 aa27.05■■□□□ 1.92
NME3-211ENST00000568561 TSPOAP1O95153 1857 aa27.04■■□□□ 1.92
NME3-211ENST00000568561 PTPRGP23470 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
NME3-211ENST00000568561 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.97■■□□□ 1.91
NME3-211ENST00000568561 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.96■■□□□ 1.91
NME3-211ENST00000568561 KDM6BO15054 1643 aa26.94■■□□□ 1.9
NME3-211ENST00000568561 ABCC2Q92887 1545 aa26.91■■□□□ 1.9
NME3-211ENST00000568561 DISP1Q96F81 1524 aa26.91■■□□□ 1.9
NME3-211ENST00000568561 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.88■■□□□ 1.89
NME3-211ENST00000568561 ASXL2Q76L83 1435 aa26.84■■□□□ 1.89
NME3-211ENST00000568561 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.83■■□□□ 1.89
NME3-211ENST00000568561 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.82■■□□□ 1.88
NME3-211ENST00000568561 KIAA0556O60303 1618 aa26.82■■□□□ 1.88
NME3-211ENST00000568561 UACAQ9BZF9 1416 aa26.82■■□□□ 1.88
NME3-211ENST00000568561 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
NME3-211ENST00000568561 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.79■■□□□ 1.88
NME3-211ENST00000568561 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
NME3-211ENST00000568561 GLI2P10070 1586 aa26.76■■□□□ 1.87
NME3-211ENST00000568561 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NME3-211ENST00000568561 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.73■■□□□ 1.87
NME3-211ENST00000568561 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
NME3-211ENST00000568561 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.68■■□□□ 1.86
NME3-211ENST00000568561 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.65■■□□□ 1.86
NME3-211ENST00000568561 PRXQ9BXM0 1461 aa26.58■■□□□ 1.85
NME3-211ENST00000568561 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NME3-211ENST00000568561 GOLGA3Q08378 1498 aa26.57■■□□□ 1.84
NME3-211ENST00000568561 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-211ENST00000568561 ABCA8O94911 1581 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-211ENST00000568561 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-211ENST00000568561 ADGRL1O94910 1474 aa26.48■■□□□ 1.83
NME3-211ENST00000568561 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.46■■□□□ 1.83
NME3-211ENST00000568561 KCNH8Q96L42 1107 aa26.42■■□□□ 1.82
NME3-211ENST00000568561 ARID3CA6NKF2 412 aa26.4■■□□□ 1.82
NME3-211ENST00000568561 P3H3Q8IVL6 736 aa26.39■■□□□ 1.82
NME3-211ENST00000568561 CD109Q6YHK3 1445 aa26.39■■□□□ 1.81
NME3-211ENST00000568561 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.37■■□□□ 1.81
NME3-211ENST00000568561 SAMD9Q5K651 1589 aa26.35■■□□□ 1.81
NME3-211ENST00000568561 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.3■■□□□ 1.8
NME3-211ENST00000568561 ATP10BO94823 1461 aa26.3■■□□□ 1.8
NME3-211ENST00000568561 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.27■■□□□ 1.8
NME3-211ENST00000568561 KIF21BO75037 1637 aa26.25■■□□□ 1.79
NME3-211ENST00000568561 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.23■■□□□ 1.79
NME3-211ENST00000568561 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
NME3-211ENST00000568561 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
NME3-211ENST00000568561 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.17■■□□□ 1.78
NME3-211ENST00000568561 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.17■■□□□ 1.78
NME3-211ENST00000568561 EEA1Q15075 1411 aa26.16■■□□□ 1.78
NME3-211ENST00000568561 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.16■■□□□ 1.78
NME3-211ENST00000568561 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NME3-211ENST00000568561 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NME3-211ENST00000568561 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NME3-211ENST00000568561 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.05■■□□□ 1.76
NME3-211ENST00000568561 NEO1Q92859 1461 aa26.04■■□□□ 1.76
NME3-211ENST00000568561 RAPGEF3O95398 923 aa26.03■■□□□ 1.76
NME3-211ENST00000568561 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.02■■□□□ 1.76
NME3-211ENST00000568561 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.01■■□□□ 1.75
NME3-211ENST00000568561 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.97■■□□□ 1.75
NME3-211ENST00000568561 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.96■■□□□ 1.75
NME3-211ENST00000568561 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.96■■□□□ 1.75
NME3-211ENST00000568561 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
NME3-211ENST00000568561 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.743e-22■□□□□ 10.7
NME3-211ENST00000568561 RICTORQ6R327 1708 aa25.94■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.92■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.91■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.9■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 MADDQ8WXG6 1647 aa25.89■■□□□ 1.74
NME3-211ENST00000568561 FANCAO15360 1455 aa25.89■■□□□ 1.73
NME3-211ENST00000568561 PTPRMP28827 1452 aa25.89■■□□□ 1.73
NME3-211ENST00000568561 AKNAQ7Z591 1439 aa25.87■■□□□ 1.73
NME3-211ENST00000568561 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NME3-211ENST00000568561 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
NME3-211ENST00000568561 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 HECW1Q76N89 1606 aa25.81■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.79■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.78■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NME3-211ENST00000568561 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.76■■□□□ 1.71
NME3-211ENST00000568561 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.76■■□□□ 1.71
NME3-211ENST00000568561 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.75■■□□□ 1.71
NME3-211ENST00000568561 FMN1Q68DA7 1419 aa25.75■■□□□ 1.71
NME3-211ENST00000568561 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.75■■□□□ 1.71
NME3-211ENST00000568561 KIF14Q15058 1648 aa25.74■■□□□ 1.71
NME3-211ENST00000568561 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms