RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567408.1

RNF166-208, Transcript of ring finger protein 166, human

TSL 2

Gene RNF166, Length 313 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF166-208	ENST00000567408	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RNF166-208	ENST00000567408	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RNF166-208	ENST00000567408	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RNF166-208	ENST00000567408	EEA1	Q15075	1411 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RNF166-208	ENST00000567408	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RNF166-208	ENST00000567408	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RNF166-208	ENST00000567408	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RNF166-208	ENST00000567408	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
RNF166-208	ENST00000567408	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RNF166-208	ENST00000567408	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RNF166-208	ENST00000567408	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RNF166-208	ENST00000567408	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RNF166-208	ENST00000567408	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RNF166-208	ENST00000567408	KIF21B	O75037	1637 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RNF166-208	ENST00000567408	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNF166-208	ENST00000567408	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNF166-208	ENST00000567408	PTPRG	P23470	1445 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RNF166-208	ENST00000567408	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
RNF166-208	ENST00000567408	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RNF166-208	ENST00000567408	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RNF166-208	ENST00000567408	KIAA0556	O60303	1618 aa		33	■■■□□ 2.87
RNF166-208	ENST00000567408	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
RNF166-208	ENST00000567408	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
RNF166-208	ENST00000567408	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNF166-208	ENST00000567408	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.9	■■■□□ 2.86
RNF166-208	ENST00000567408	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
RNF166-208	ENST00000567408	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RNF166-208	ENST00000567408	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RNF166-208	ENST00000567408	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RNF166-208	ENST00000567408	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RNF166-208	ENST00000567408	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RNF166-208	ENST00000567408	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RNF166-208	ENST00000567408	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RNF166-208	ENST00000567408	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RNF166-208	ENST00000567408	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNF166-208	ENST00000567408	ABCA8	O94911	1581 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RNF166-208	ENST00000567408	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNF166-208	ENST00000567408	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RNF166-208	ENST00000567408	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RNF166-208	ENST00000567408	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RNF166-208	ENST00000567408	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RNF166-208	ENST00000567408	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RNF166-208	ENST00000567408	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
RNF166-208	ENST00000567408	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RNF166-208	ENST00000567408	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RNF166-208	ENST00000567408	ATP10B	O94823	1461 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RNF166-208	ENST00000567408	CLIP1	P30622	1438 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RNF166-208	ENST00000567408	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RNF166-208	ENST00000567408	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RNF166-208	ENST00000567408	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RNF166-208	ENST00000567408	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RNF166-208	ENST00000567408	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RNF166-208	ENST00000567408	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RNF166-208	ENST00000567408	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RNF166-208	ENST00000567408	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
RNF166-208	ENST00000567408	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RNF166-208	ENST00000567408	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RNF166-208	ENST00000567408	GLI2	P10070	1586 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RNF166-208	ENST00000567408	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RNF166-208	ENST00000567408	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RNF166-208	ENST00000567408	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RNF166-208	ENST00000567408	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RNF166-208	ENST00000567408	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RNF166-208	ENST00000567408	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RNF166-208	ENST00000567408	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RNF166-208	ENST00000567408	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RNF166-208	ENST00000567408	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RNF166-208	ENST00000567408	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RNF166-208	ENST00000567408	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RNF166-208	ENST00000567408	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RNF166-208	ENST00000567408	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RNF166-208	ENST00000567408	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
RNF166-208	ENST00000567408	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RNF166-208	ENST00000567408	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32	■■■□□ 2.71
RNF166-208	ENST00000567408	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RNF166-208	ENST00000567408	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
RNF166-208	ENST00000567408	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.95	■■■□□ 2.7
RNF166-208	ENST00000567408	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.9	■■■□□ 2.7
RNF166-208	ENST00000567408	KDM6B	O15054	1643 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RNF166-208	ENST00000567408	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RNF166-208	ENST00000567408	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
RNF166-208	ENST00000567408	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RNF166-208	ENST00000567408	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RNF166-208	ENST00000567408	KIF14	Q15058	1648 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RNF166-208	ENST00000567408	NEO1	Q92859	1461 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RNF166-208	ENST00000567408	PLCH2	O75038	1416 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RNF166-208	ENST00000567408	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RNF166-208	ENST00000567408	FANCA	O15360	1455 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RNF166-208	ENST00000567408	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RNF166-208	ENST00000567408	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RNF166-208	ENST00000567408	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RNF166-208	ENST00000567408	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RNF166-208	ENST00000567408	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
RNF166-208	ENST00000567408	APLP2	Q06481	763 aa		31.58	■■■□□ 2.65

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