RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567283.5

RPUSD1-209, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RPUSD1, Length 835 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-209ENST00000567283 KIF27Q86VH2 1401 aa42.94■■■■■ 4.46
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RPUSD1-209ENST00000567283 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.74■■■■■ 4.43
RPUSD1-209ENST00000567283 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.61■■■■■ 4.41
RPUSD1-209ENST00000567283 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.58■■■■■ 4.41
RPUSD1-209ENST00000567283 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.58■■■■■ 4.41
RPUSD1-209ENST00000567283 MAPKBP1O60336 1514 aa42.52■■■■■ 4.4
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RPUSD1-209ENST00000567283 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
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RPUSD1-209ENST00000567283 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.28■■■■■ 4.36
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RPUSD1-209ENST00000567283 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.06■■■■■ 4.32
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RPUSD1-209ENST00000567283 ASXL2Q76L83 1435 aa42.02■■■■■ 4.32
RPUSD1-209ENST00000567283 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.99■■■■■ 4.31
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RPUSD1-209ENST00000567283 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.73■■■■■ 4.27
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RPUSD1-209ENST00000567283 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.61■■■■■ 4.25
RPUSD1-209ENST00000567283 ABCA8O94911 1581 aa41.61■■■■■ 4.25
RPUSD1-209ENST00000567283 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.49■■■■■ 4.23
RPUSD1-209ENST00000567283 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.45■■■■■ 4.23
RPUSD1-209ENST00000567283 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
RPUSD1-209ENST00000567283 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
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RPUSD1-209ENST00000567283 P3H3Q8IVL6 736 aa41.39■■■■■ 4.22
RPUSD1-209ENST00000567283 KCNH8Q96L42 1107 aa41.37■■■■■ 4.21
RPUSD1-209ENST00000567283 SAMD9Q5K651 1589 aa41.35■■■■■ 4.21
RPUSD1-209ENST00000567283 CD109Q6YHK3 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
RPUSD1-209ENST00000567283 ARID3CA6NKF2 412 aa41.32■■■■■ 4.21
RPUSD1-209ENST00000567283 ADGRL1O94910 1474 aa41.32■■■■■ 4.2
RPUSD1-209ENST00000567283 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.3■■■■■ 4.2
RPUSD1-209ENST00000567283 EEA1Q15075 1411 aa41.3■■■■■ 4.2
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RPUSD1-209ENST00000567283 ATP10BO94823 1461 aa41.21■■■■■ 4.19
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RPUSD1-209ENST00000567283 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
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RPUSD1-209ENST00000567283 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
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